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膜を超えた情報伝達:細胞表層ストレス応答システムに対する新視点からのアプローチ

膜を超えた情報伝達:細胞表層ストレス応答システムに対する新視点からのアプローチ
跨膜信息传输:细胞表面应激反应系统的新方法
批准号:
12J05188
负责人:
檜作 洋平
金额:
$1.54万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2012
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2012 至 2014-03-31

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
本研究計画では、大腸菌における表層ストレス応答の主要な経路であるσ^E経路ストレス応答を対象とし、膜を越えて情報伝達を行うというユニークな細胞表層ストレス応答システムを理解することを目的とした。昨年度は好熱菌Aquifex aeolicusのRsePホモログ(AaRseP)のPDZ-NCドメイン(PDZタンデム)の結晶構造解析及び大腸菌RseP (EcRseP)を用いた生化学的機能解析を行い、いくつかの結果に基づき、PDZタンデムが膜表面においてゲート様の構造(PDZポケット)を形成し、DegSによって切断されたRseAのペリプラズム領域のサイズを感知して膜貫通領域の活性部位へ基質を取り込むような、サイズ排除フィルターとして機能するというモデルを提案したことを報告した。本年度は引き続き解析を進め、細胞膜上で実際にRseP PDZドメインがどのような配向を取っているかを調べるため、システイン置換体を用いた特異的修飾試薬による修飾実験を行ったところ、予測構造によく合致する結果を得た。さらにEcRsePのPDZ-Nに特異的な小さなα-Helix構造(Capping Helix)に着目し、その欠失変異や点変異が基質切断制御異常を引き起こすことや、全長RsePの生体中におけるTrypsin感受性が変化することを新たに見出した。これはPDZ-N, -Cドメイン間の配向変化等を含むPDZドメインのグローバルな構造変換を引き起こすことを示唆する結果である。これらの結果は、Capping Helixを介して引き起こされるPDZ-NCタンデムの構造変換によりPDZタンデムのサイズ排除ブイルター機能が調節され、過去の知見から示唆されてきた、DegS非依存的な未知のシグナル伝達経路の活性化を実現させている可能性を示唆する。本研究内容については国際学術雑誌Structureに掲載された。
英文摘要
本研究計画では、大腸菌における表層ストレス応答の主要な経路であるσ^E経路ストレス応答を対象とし、膜を越えて情報伝達を行うというユニークな細胞表層ストレス応答システムを理解することを目的とした。昨年度は好熱菌Aquifex aeolicusのRsePホモログ(AaRseP)のPDZ-NCドメイン(PDZタンデム)の結晶構造解析及び大腸菌RseP (EcRseP)を用いた生化学的機能解析を行い、いくつかの結果に基づき、PDZタンデムが膜表面においてゲート様の構造(PDZポケット)を形成し、DegSによって切断されたRseAのペリプラズム領域のサイズを感知して膜貫通領域の活性部位へ基質を取り込むような、サイズ排除フィルターとして機能するというモデルを提案したことを報告した。本年度は引き続き解析を進め、細胞膜上で実際にRseP PDZドメインがどのような配向を取っているかを調べるため、システイン置換体を用いた特異的修飾試薬による修飾実験を行ったところ、予測構造によく合致する結果を得た。さらにEcRsePのPDZ-Nに特異的な小さなα-Helix構造(Capping Helix)に着目し、その欠失変異や点変異が基質切断制御異常を引き起こすことや、全長RsePの生体中におけるTrypsin感受性が変化することを新たに見出した。これはPDZ-N, -Cドメイン間の配向変化等を含むPDZドメインのグローバルな構造変換を引き起こすことを示唆する結果である。これらの結果は、Capping Helixを介して引き起こされるPDZ-NCタンデムの構造変換によりPDZタンデムのサイズ排除ブイルター機能が調節され、過去の知見から示唆されてきた、DegS非依存的な未知のシグナル伝達経路の活性化を実現させている可能性を示唆する。本研究内容については国際学術雑誌Structureに掲載された。
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会议论文
立体構造解析に基づく大腸菌膜内切断プロテアーゼRsePのタンデムPDZドメインによる切断基質選別機構モデル
基于3D结构分析的大肠杆菌膜内裂解蛋白酶RseP串联PDZ结构域的裂解底物选择机制模型
DOI: --
发表时间: 2013
期刊:
影响因子: --
作者: [檜作 洋平, 秋山 芳展, 檜作 洋平, 檜作 洋平]
通讯作者: 檜作 洋平
大腸菌表層ストレス応答に関与する膜内切断プロテアーゼRsePのPDZドメインによる新たな機能制御メカニズム
RseP 的 PDZ 结构域的新功能控制机制,RseP 是一种参与大肠杆菌表面应激反应的膜内裂解蛋白酶
DOI: --
发表时间: 2012
期刊:
影响因子: --
作者: [檜作 洋平, 秋山 芳展, 檜作 洋平, 檜作 洋平, 檜作 洋平, 檜作 洋平, 檜作洋平, 檜作洋平, 檜作洋平]
通讯作者: 檜作洋平
大腸菌RIPプロテアーゼRsePのタンデムPDZドメインによる新たな機能制御メカニズム.
大肠杆菌 RIP 蛋白酶 RseP 串联 PDZ 结构域的新型功能控制机制。
DOI: --
发表时间: 2012
期刊:
影响因子: --
作者: [檜作洋平, 他]
通讯作者:
膜内切断プロテアーゼRsePによる大腸菌σ^E経路表層ストレス応答の制御機構
膜内裂解蛋白酶RseP对大肠杆菌σ^E途径表面应激反应的控制机制
DOI: --
发表时间: 2014
期刊:
影响因子: --
作者: [檜作 洋平, 秋山 芳展, 檜作 洋平]
通讯作者: 檜作 洋平
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    新規構造・基質に基づく細菌S2P膜内切断プロテアーゼの切断制御機構の酵素学的理解
    • 批准号:
      22K06142
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额:
      $2.75万
    • 财政年份:
      2022
    • 负责人:
      檜作 洋平
    • 依托单位:
    超分子ナノマシン細菌べん毛モーターを再構成して機能を探る
    • 批准号:
      07J02549
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额:
      $1.15万
    • 财政年份:
      2007
    • 负责人:
      檜作 洋平
    • 依托单位:
    海外基金