翻訳制御による人工遺伝子回路の構築およびRNPの改変と探索

通过翻译控制和修饰构建人工基因电路以及RNP的探索

• 批准号: 12J06708
• 负责人: 原 知明
• 金额: $ 0.58万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12J06708/
• 关键词: L7Ae変異体; kink-turn; H23; RNPモチーフ

本研究は、翻訳制御による抑制振動子の構築、RNPモチーフの改変と得られた人工RNPモチーフによる翻訳制御システムの構築、新規RNPモチーフの探索という3つの研究テーマについて研究を行い、RNPの性質について解析を行うことを目的とした。そのうち最も研究を進めたのが2番目の研究テーマであり、その成果を論文として海外雑誌に公表することができた。その成果を述べる。kink-turn(K-turn)への結合力が弱いL7Ae変異体(L7KKとする)に対してSELEX法を行い取得したアプタマーについて、その結合力をまずEMSAで測定した。SELEX法では42クローンから38配列のアプタマーが得られており、そのうち29配列でA/G-AUGAという共通配列が見つかったが、その配列以外の部分は多種多様であったので、38配列全てについてL7KKとEMSAを行い、強く結合するアプタマー9種(D12、G2、G6、G10、H1、H2、H5、H8、H10とする)を特定した。その9種のアプタマーについてSPR法(表面プラズモン共鳴法)を行い、解析ソフトで解離定数を計算したところ、9種とも1nM前後という低い値であることが確認できた。L7KKは、K-turnの一つであるBoxC/Dと約130nMの解離定数で結合することがSPR法で確認できたことから、SELEX法によって目的通り、L7KKにより強く結合するRNAを選択できたことが示された。最終的にアプタマーの最小配列としてH5のK-turnを組み込んだ23塩基のRNA(H23)を作製し、SPR法でL7KKとの結合を測定したところ、約1nMの解離定数で結合することが確認できた。最後にL7KKとH23を使用してHeLa細胞内で機能する翻訳制御スイッチを作製し、期待通りに機能することを確認した。これらを通して遺伝子発現制御方法の種類を増やすことに貢献できた。

は, turn this study 訳 suppression に よ る restrain vibration の construct, RNP モ チ ー フ の change - と have ら れ た artificial RNP モ チ ー フ に よ る turn 訳 suppression シ ス テ ム の building, the new rules RNP モ チ ー フ の explore と い う 3 つ の research テ ー マ に つ い て research を い, RNP の nature に つ い て parsing line を う こ と を purpose と し た. The そ の う ち を も research into め た の が 2's の research テ ー マ で あ り, そ result を の と し て 雑 overseas tzu に male table す る こ と が で き た. Youdaoplaceholder0 そ results を describes べる. Kink - turn (K - turn) へ の weak binding force が い L7Ae - variants (L7KK と す る) に し seaborne て SELEX act line を い し た ア プ タ マ ー に つ い て, そ の binding force を ま ず EMSA で determination し た. SELEX method で は 42 ク ロ ー ン か ら with 38 columns の ア プ タ マ ー が have ら れ て お り, そ の う ち 29 match column で A/G - AUGA と い う with common column が see つ か っ た が, そ の match column の the partial は many many others で あ っ た の で, 38 columns full て に つ い て L7KK と EMSA を い, strong く combining す る ア プ タ マ Youdaoplaceholder0 9 kinds (D12, G2, G6, G10, H1, H2, H5, H8, H10とする)を specific た. そ の nine の ア プ タ マ ー に つ い て method of SPR (surface プ ラ ズ モ ン resonance method) line を い, parse ソ フ ト で dissociation constant を computing し た と こ ろ, nine と も around 1 nm と い う low い numerical で あ る こ と が confirm で き た. L7KK は, K - turn a つ の で あ る BoxC about 130 nm/D と の dissociation constant で combining す る こ と が SPR method で confirm で き た こ と か ら, SELEX に よ っ て purpose り, L7KK に よ り strong く combining す る RNA を sentaku で き た こ と が shown さ れ た. Final に ア プ タ マ ー の minimum column と し て H5 の K - turn を group み 込 ん だ 23 salt base の RNA (H23) を し, SPR method で L7KK と の し combination with the determination of the を た と こ ろ, about 1 nm の dissociation constant で combining す る こ と が confirm で き た. Finally に L7KK と H23 を use し て HeLa で function inside す る turn 訳 suppression ス イ ッ チ し, looking forward to the を cropping り に function す る こ と を confirm し た. <s:1> れらを through the て legacy 伝, the types of control methods を increase やす とに とに contribute で た た.