Development of method for comprehensive isolation and purification of viral particles from clinical specimens

临床标本中病毒颗粒综合分离纯化方法的建立

• 批准号: 23659298
• 负责人: NAKAYA Takaaki
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: Kyoto Prefectural University of Medicine
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23659298/
• 关键词: ウイルス; ウイルス粒子精製; インフルエンザウイルス; ニューカッスル病ウイルス; メタゲノム

A more effective method to purify viral paricles from clinical specimens is required in metagenomic analysis of pathogens using a high-throughput DNA sequencer. In this study, a novel virion purification method using HPLC or field flow fractionation was evaluated. Even in the preliminary results, field flow fractionation combined with a light scattering detector could isolate the virion fraction from a crude virus solution, such as influenza and Newcastle disease virus. In addition, it was demonstrated that hydroxyapatite chromatography effectively purified viral particles from allantoic fluid from an infected embryonated egg. These results suggested that the above methods could be useful for virion fractionation from crude samples.

在使用高通量DNA测序仪的病原体宏基因组分析中，需要一种更有效的方法来从临床标本中纯化病毒颗粒。在这项研究中，一种新的病毒粒子纯化方法，使用HPLC或场流分级进行了评价。即使在初步结果中，场流分级分离结合光散射检测器可以从粗病毒溶液中分离病毒体组分，例如流感病毒和纽卡斯尔病病毒。此外，证明了羟基磷灰石层析法有效地从来自感染的含胚卵的尿囊液中纯化病毒颗粒。这些结果表明，上述方法可用于从粗样品中分离病毒粒子。

项目成果

Direct metagenomic detection of viral pathogens in human specimens using an unbiased high-throughput sequencing approach.

使用无偏高通量测序方法直接宏基因组检测人类样本中的病毒病原体。

• 发表时间: 2011
• 作者: Nakaya T;Nakamura S;Iida T;Horii Tet al
• 通讯作者: Horii Tet al

H1N1 2009-HAゲノムのディープシークエンス解析

H1N1 2009-HA 基因组的深度序列分析

• 作者: Jesmin S;Rahman A;/Yamaguchi N;Hiroaki M;Mizutani T;Moroi M;中屋 隆明
• 通讯作者: 中屋 隆明

Human monoclonal antibodies broadly neutralizing against influenza B virus.

• DOI: 10.1371/journal.ppat.1003150
• 发表时间: 2013-02
• 期刊: PLoS pathogens
• 影响因子: 6.7
• 作者: Yasugi M;Kubota-Koketsu R;Yamashita A;Kawashita N;Du A;Sasaki T;Nishimura M;Misaki R;Kuhara M;Boonsathorn N;Fujiyama K;Okuno Y;Nakaya T;Ikuta K
• 通讯作者: Ikuta K

鳥インフルエンザ

禽流感

• 作者: Jesmin S;Islam AMS;Sultana SN;Zaedi S;Hiroe M;Kimura S:;中屋 隆明
• 通讯作者: 中屋 隆明

新興・再興ウイルス感染症のダイナミクス

新出现和重新出现的病毒感染的动态

• 发表时间: 2012
• 作者: 中屋隆明