Development of molecular diagnosis system of cancer drug resistance using absolute quantitative proteomics

利用绝对定量蛋白质组学开发癌症耐药性分子诊断系统

• 批准号: 23701084
• 负责人: TAKEMORI Nobuaki
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: Ehime University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23701084/
• 关键词: 薬剤耐性; 絶対定量プロテオミクス; 定量MRM法; 小麦無細胞タンパク質合成系; コムギ無細胞タンパク質合成系

We have established a molecular diagnosis system for quantifying proteomic alterations of cancer drug resistance using wheat germ cell-free protein synthesis system and quantitative mass spectrometry. Stable isotope (SI) labeled recombinant proteins as an internal standard for protein quantification were in vitro synthesized using wheat cell-free synthesis system. We selected a set of digested peptides for each protein based on their ionization efficiency and established multiple reaction monitoring (MRM) assay using triple quadrupole mass spectrometer. We are currently constructing an absolute quantitative platform of human biopsy samples by combining MRM assay and synthesized SI-labeled protein library, which allows an accurate measurement of the absolute amount of targeted proteins from a limited amount of tissue samples.

我们建立了一个利用麦胚无细胞蛋白质合成系统和定量质谱技术定量肿瘤耐药蛋白质组学改变的分子诊断系统。利用小麦无细胞合成系统体外合成了稳定同位素标记的重组蛋白作为蛋白定量的内标。我们选择了一组消化的肽为每种蛋白质的基础上，他们的电离效率和建立多反应监测（MRM）测定使用三重四极质谱仪。我们目前正在通过结合MRM检测和合成的SI标记的蛋白质文库来构建人类活检样品的绝对定量平台，其允许从有限量的组织样品中精确测量靶蛋白的绝对量。

项目成果

A high-throughput targeted approach for the absolute quantification of human and mouse proteome alterations.

用于绝对定量人类和小鼠蛋白质组改变的高通量靶向方法。

• 作者: 武森信暁;武森文子;青島正人;田中ゆき;東山繁樹
• 通讯作者: 東山繁樹

SIRPL: Construction of a stable isotope-labeled recombinant protein library for the absolute quantitative analysis of mouse membrane proteome.

SIRPL：构建稳定同位素标记的重组蛋白文库，用于小鼠膜蛋白质组的绝对定量分析。

• 作者: Takemori N;Takemori A;Matsuoka K;Matsushita N;Takeda H;Sawasaki T;Endo Y;Higashiyama S
• 通讯作者: Higashiyama S

SIRPLDB:安定同位体標識リコンビナントタンパク質ライブラリーの定量プロテオーム解析への活用に向けた情報データベースの構築

SIRPLDB：利用稳定同位素标记的重组蛋白文库进行定量蛋白质组分析的信息数据库的构建

• 发表时间: 2012
• 作者: 武森文子;武森信暁;東山繁樹
• 通讯作者: 東山繁樹

SIRPL: Construction of a stable isotope-labeled recombinant protein library for the absolute quantitative analysis of mouse membrane proteome

SIRPL：构建用于小鼠膜蛋白质组绝对定量分析的稳定同位素标记重组蛋白库

• 发表时间: 2012
• 作者: Takemori N;Takemori A;Matsuoka K;Matsushita N;Takeda H;Sawasaki T;Endo Y;Higashiyama S
• 通讯作者: Higashiyama S

Adseverin: A novel cisplatin-resistant marker in the human bladder cancer cell line HT1376 identified by quantitative proteomic analysis

• DOI: 10.1016/j.molonc.2011.12.002
• 发表时间: 2012-06-01
• 期刊: MOLECULAR ONCOLOGY
• 影响因子: 6.6
• 作者: Miura, Noriyoshi;Takemori, Nobuaki;Yokoyama, Masayoshi
• 通讯作者: Yokoyama, Masayoshi