权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

Novel QSAR analysis based on protein-ligand interaction using molecular calculation

使用分子计算基于蛋白质-配体相互作用的新型 QSAR 分析

基本信息

批准号：
23710272
负责人：
YOSHIDA Tatsusada
金额：
$ 2.25万
依托单位：
The University of Tokushima
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2011
资助国家：
日本
起止时间：
2011 至 2012
项目状态：
已结题

项目摘要

We examined the atomic and electronic mechanism underlying binding between zinc-containing proteins and a series of ligands, using the QM (Quantum mechanics)/MM (Molecular Mechanics) and ab initio FMO (Fragment Molecular Orbital) calculations and LERE (Linear Expression by Representative Energy terms)-QSAR (Quantitative Structure-Activity Relationship) procedure. As a result, the LERE-QSAR procedure demonstrated to quantitatively reveal differences in the binding mechanisms between the several cases involving similar but different zinc-containing proteins at the electronic and atomic levels.

本文采用量子力学/分子力学（QM/MM）和从头计算（ab initio FMO）方法以及莱雷（Linear Expression by Representative Energy terms）-QSAR（Quantitative Structure-Activity Relationship）方法，研究了含锌蛋白质与一系列配体结合的原子和电子机制。因此，LERE-QSAR程序证明，以定量揭示的几种情况下，涉及类似的，但不同的含锌蛋白质在电子和原子水平上的结合机制之间的差异。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

A Combined QM/MM (ONIOM) and QSAR Approach to the Study of Complex Formation of Matrix Metalloproteinase-9 with a Series of Biphenylsulfonamides - LERE-QSAR Analysis (V)

结合 QM/MM (ONIOM) 和 QSAR 方法研究基质金属蛋白酶 9 与一系列联苯磺酰胺的复合物形成 - LERE-QSAR 分析 (V)

DOI：
10.1021/jp305476x
发表时间：
2012
期刊：
The Journal of Physical Chemistry B
影响因子：
0
作者：
Yoshida T;et al.
通讯作者：
et al.

LERE-QSAR解析による絶対立体配置の識別 : インフルエンザ・ノイラミニダーゼとピロリジン系化合物との相互作用解析

通过 LERE-QSAR 分析鉴定绝对构型：流感神经氨酸酶与吡咯烷化合物之间的相互作用分析

DOI：
发表时间：
2013
期刊：
影响因子：
0
作者：
塩見一明;栗山磯子;吉田弘美;水品善之;河野明大
通讯作者：
河野明大

LERE-QSAR 解析によるbilinear model の新しい解釈：トリアジン誘導体とジヒドロ葉酸還元酵素との複合体形成

LERE-QSAR 分析对双线性模型的新解释：三嗪衍生物与二氢叶酸还原酶之间的复合物形成

DOI：
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
0
作者：
間久直;粟津邦男;山内　香子
通讯作者：
山内　香子

Modeling of Human Neuraminidase-1 and Its Validation by LERE-Correlation Analysis

人类神经氨酸酶 1 的建模及其通过 LERE 相关分析的验证

DOI：
10.1273/cbij.13.30
发表时间：
2013
期刊：
Chem-Bio Informatics Journal
影响因子：
0.3
作者：
S. Hitaoka;Y. Shibata;H. Matoba;A. Kawano;M. Harada;M.M. Rahman;D. Tsuji D;T. Hirokawa;K. Itoh;T.Yoshida;H. Chuman
通讯作者：
H. Chuman

LERE-QSAR解析の精密化とその検証

LERE-QSAR 分析的细化及其验证