Development of denovo genome/gene assembler for highly heterozygous samples from NGS sequence data

开发用于 NGS 序列数据的高度杂合样本的 devo 基因组/基因组装程序

基本信息

  • 批准号:
    24310142
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 13.4万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 财政年份:
    2012
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2012-04-01 至 2015-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
イトマキヒトデのde novoアセンブリ
海星的从头组装
  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Oda;K.;Usuki;Y.;Koizumi;K.;Umemura;K. and Onishi;T;西村智洋
  • 通讯作者:
    西村智洋
高ヘテロ接合性を持つベネズエラ糞線虫のゲノム解析
高杂合委内瑞拉类圆线虫的基因组分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    矢花充;他
  • 通讯作者:
メタゲノム用de novoアセンブラの開発およびilluminaデータを用いたベンチマーク
使用 Illumina 数据开发用于宏基因组学和基准测试的从头组装程序
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    中山 学;小田 紘嗣;八角 高裕;西小森 隆太;平家 俊男;小原 收;近藤昭彦・小林達明・鈴木弘行・山口英俊・早川敏雄・松下龍之介;上原康平,丸山喜久;小林文明;梶谷嶺
  • 通讯作者:
    梶谷嶺
Efficient de novo assembly of highly heterozygous genomes from whole-genome shotgun short reads.
  • DOI:
    10.1101/gr.170720.113
  • 发表时间:
    2014-08
  • 期刊:
  • 影响因子:
    7
  • 作者:
    Kajitani R;Toshimoto K;Noguchi H;Toyoda A;Ogura Y;Okuno M;Yabana M;Harada M;Nagayasu E;Maruyama H;Kohara Y;Fujiyama A;Hayashi T;Itoh T
  • 通讯作者:
    Itoh T
高ヘテロ接合性ゲノムのde novoアセンブリ
高度杂合基因组的从头组装
  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    梶谷嶺;他
  • 通讯作者:
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