Integration of plant strain SNPs using NGS Sequence Read Archive and diversity statistics analysis

使用 NGS 序列读取存档和多样性统计分析整合植物菌株 SNP

• 批准号: 24500366
• 负责人: KAMINUMA Eli
• 金额: $ 3.41万
• 依托单位: National Institute of Genetics
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012-04-01 至 2015-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24500366/
• 关键词: SNP; 次世代シークエンサ; Sequence Read Archive; 多様性指標; データベース; 解析ワークフロー; 一塩基多型; WGS; DNA多型; 遺伝的多様性; ゲノム多様性

项目成果

DNAPod database

DNAPod数据库

DNApod: DNA Polymorphism annOtation Database

DNApod：DNA 多态性注释数据库

Constructing an integrated DNA polymorphism database and an analytical workflow for plants and bacteria

构建植物和细菌的综合 DNA 多态性数据库和分析工作流程

• 发表时间: 2014
• 作者: Takako Mochizuki;Takatomo Fujisawa;Yasuhiro Tanizawa;Hideki Nagasaki;Eli Kaminuma;Tokurou Shimizu;Atsushi Toyoda;Asao Fujiyama;Nori Kurata;Naruo Nikoh and Yasukazu Nakamura
• 通讯作者: Naruo Nikoh and Yasukazu Nakamura

DNA Polymorphism Annotation Database(DNAPod)

DNA多态性注释数据库(DNAPod)

DNA Polymorphism Database from New-Generation Sequence Read Archive and Analytical Workflow

来自新一代序列读取存档和分析工作流程的 DNA 多态性数据库

• 发表时间: 2015
• 作者: Mochizuki;T.;Tanizawa;Y., Fujisawa;T.;Nikoh;N.;Toyoda;A.;Fujiyama;A.;Kurata;N.;Nagasaki;H.;Shimizu;T.;Kaminuma;E.;Nakamura;Y.
• 通讯作者: Y.