Characterization of an RNA-binding protein PpCSP that promotes reprogramming of the moss Physcomitrella patens

促进小立碗藓重编程的 RNA 结合蛋白 PpCSP 的表征

• 批准号: 24770051
• 负责人: TAMADA Yosuke
• 金额: $ 3万
• 依托单位: National Institute for Basic Biology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24770051/
• 关键词: リプログラミング; RNA; 植物; 発生

PpCSP, an RNA-binding protein, facilitates the reprogramming from differentiated leaf cells to stem cells in the moss Physcomitrella patens. To reveal the molecular mechanisms underlying the promotion of reprogramming by PpCSP, we have tried to identify the target RNA molecules and the interacting proteins of PpCSP. We performed RNA immunoprecipitation-sequencing and found that PpCSP binds to almost all mRNAs. We previously isolated multiple genes, which exhibited higher transcripts accumulation in the over-expression line of PpCSP than in wild type. We produced over-expression lines of those genes, and found that several over-expression lines exhibited abnormal morphologies. In addition, we isolated multiple interacting partners of PpCSP by performing immunoprecipitation followed by liquid chromatography-mass spectrometry. We confirmed that the cellular localization largely overlapped with that of PpCSP.

PpCSP是一种RNA结合蛋白，可促进藓类小立碗藓分化叶细胞向干细胞的重编程。为了揭示PpCSP促进重编程的分子机制，我们试图鉴定PpCSP的靶RNA分子和相互作用蛋白。我们进行了RNA免疫沉淀测序，发现PpCSP结合几乎所有的mRNA。我们先前分离出多个基因，其在PpCSP过表达系中表现出比野生型更高的转录物积累。我们建立了这些基因的过表达株系，并发现几个过表达株系表现出异常的形态。此外，我们分离出多个相互作用的合作伙伴的PpCSP进行免疫沉淀，然后通过液相色谱-质谱。我们证实，细胞定位在很大程度上与PpCSP重叠。

项目成果

出張授業:玉田洋介、「DNAに運命は書き込まれているのか」、2012年7月12日、岡崎市立福岡中学校(愛知県岡崎市)

访问讲座：玉田洋介，《命运是写在DNA里的吗？》，2012年7月12日，冈崎市福冈中学（爱知县冈崎市）

研究・施設紹介:玉田洋介、愛知県立刈谷高等学校の高校生約25名に基礎生物学研究所の研究・施設紹介、2013年6月5日、基礎生物学研究所(愛知県岡崎市)

研究及设施介绍：玉田洋介向爱知县刈谷高中约25名高中生介绍基础生物学研究所的研究及设施，2013年6月5日，基础生物学研究所（爱知县冈崎市）

Cold shock domain protein functions in reprogramming from differentiated cells to stem cells

冷休克结构域蛋白在从分化细胞重编程为干细胞中发挥作用

• 发表时间: 2012
• 作者: Chen Li;Yosuke Tamada;Mitsuyasu Hasebe
• 通讯作者: Mitsuyasu Hasebe

一般公開:玉田洋介、李琛、長谷部光泰ら、基礎生物学研究所 一般公開2013「体感!最先端バイオの世界」、2013年10月5日、基礎生物学研究所(愛知県岡崎市)

公开公开：玉田洋介、李勤、长谷部光安等，基础生物学研究所公开公开2013“体验！尖端生物的世界”，2013年10月5日，基础生物学研究所（爱知县冈崎市） ）

)実験研修:長谷部光泰、村田隆、石川雅樹、玉田洋介、壁谷幸子、「新課程教育の基礎となる植物の最先端研究」、スーパーサイエンスハイスクールに所属する教員、学生約35名に対する植物の最先端研究についての実験研修、2014年2月15日、基礎生物学研究所(愛知県岡崎市)

) 实验研修：长谷部光康、村田隆、石川正树、玉田洋介、壁谷幸子，《作为新课程教育基础的植物尖端研究》，超科学高中所属约35名师生的植物实验研修关于尖端研究，2014年2月15日，国立基础生物学研究所（爱知县冈崎市）