Super-resolution, multicolor imaging of chromatin structures in the interphase nucleus

间期核染色质结构的超分辨率、多色成像

• 批准号: 24770113
• 负责人: MATSUDA Atsushi
• 金额: $ 3万
• 依托单位: National Institute of Information and Communications Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24770113/
• 关键词: クロマチン; 高分解能顕微鏡観察; 超分解能顕微鏡

Fission yeast has been a classical model organism for gene silencing. However, little is known about its chromatin structure due to the small size of the genome. Here we used super-resolution fluorescence microscopy to observe condensation levels of interphase chromatin in fission yeast. Unexpectedly silent chromatin is less condensed than the rest of euchromatin in fission yeast. Furthermore, the subtelomeric silent regions are flanked by highly condensed, but non-silencing chromatin body, which we named as knob. The regions of knob span for about 50 kb devoid of methylated histones. Knob condensation was independent from HP1 homolog swi6. The unusual chromatin structure indicates that gene silencing in fission yeast is not a direct consequence of chromatin condensation.

裂变酵母是一种典型的基因沉默模式生物。然而，由于基因组的小尺寸，对其染色质结构知之甚少。在这里，我们使用超分辨率荧光显微镜观察分裂酵母间期染色质的凝聚水平。在裂变酵母中，沉默的染色质比其他的常染色质凝聚得更少。此外，亚端粒沉默区两侧是高度凝聚但不沉默的染色质体，我们将其命名为旋钮。旋钮的区域跨度约50 kb，缺乏甲基化组蛋白。旋钮缩合与HP1同源物swi6无关。这种不寻常的染色质结构表明，裂变酵母中的基因沉默不是染色质凝聚的直接结果。

项目成果

Trouble shooting 3DSIM in the Fourier space Structured Illumination

傅立叶空间结构照明中的 3DSIM 故障排除

• 发表时间: 2013
• 作者: 丁大橋;松田厚志;原口徳子;平岡泰;Atsushi Matsuda
• 通讯作者: Atsushi Matsuda

分裂酵母減数分裂期前期染色体構造の３D-SIM解析

裂殖酵母减数分裂前期染色体结构的3D-SIM分析

• 发表时间: 2014
• 作者: Pham;TM.;Tan;K.W.;Sakumura;Y.;Okumura,K.;Furukohri;A.;Maki;H.,and Akiyama;T.M.;榊原祐樹，佐々木裕之，Marnie Blewitt，佐渡 敬;丁 大橋
• 通讯作者: 丁 大橋

Trouble shooting 3DSIM in the Fourier space

傅里叶空间中的 3DSIM 故障排除

• 发表时间: 2013
• 作者: 丁大橋;松田厚志;原口徳子;平岡泰;Atsushi Matsuda;Atsushi Matsuda
• 通讯作者: Atsushi Matsuda

超高分解蛍光顕微鏡法

超高分辨率荧光显微镜

• 发表时间: 2014
• 期刊: 光アライアンス
• 作者: 松田厚志;平野泰弘;原口徳子
• 通讯作者: 原口徳子

Deep STORM

深风暴

• 发表时间: 2012
• 作者: 松田厚志;木村宏;平岡泰;原口徳子;松田厚志
• 通讯作者: 松田厚志