Analysis on the higher-order chromatin structure in the interphase nucleus using super-resolution fluorescence microscopy

使用超分辨率荧光显微镜分析间期核中的高阶染色质结构

• 批准号: 22870042
• 负责人: MATSUDA Atsushi
• 金额: $ 2.01万
• 依托单位: National Institute of Information and Communications Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22870042/
• 关键词: クロマチン; 分裂酵母; 超分解能蛍光顕微鏡; 遺伝子; 発現制御; 生物物理; 画像; 生体生命情報学

I developed a method for live observation using super-resolution microscopy, 3DSIM, and applied on live fission yeast. The interphase chromatin in live fission yeast formed fibrous structures with a diameter of 100-150 nm. Chromatin in fixed fission yeast nuclei was stained with antibodies against modified histones and observed with 3DSIM, then the level of overlap with the DNA mass was quantitatively analyzed. The results showed that regions associated with ongoing transcription were de-condensed and extended from fibrous structures.

我开发了一种使用超分辨率显微镜（3DSIM）进行活体观察的方法，并将其应用于活的裂变酵母。裂殖酵母的间期染色质形成直径为100-150 nm的纤维状结构。用抗修饰组蛋白的抗体对固定的裂殖酵母细胞核中的染色质进行染色，并用3DSIM进行观察，然后定量分析与DNA质量的重叠水平。结果表明，与正在进行的转录相关的区域是从纤维结构中解压缩和延伸的。

项目成果

Condensed mitotic chromosome structure at nanometer resolution using PALM and EGFP- histones.

• DOI: 10.1371/journal.pone.0012768
• 发表时间: 2010-09-15
• 期刊: PloS one
• 影响因子: 3.7
• 作者: Matsuda A;Shao L;Boulanger J;Kervrann C;Carlton PM;Kner P;Agard D;Sedat JW
• 通讯作者: Sedat JW

超分解能顕微鏡で見る細胞核構造

用超分辨率显微镜观察细胞核结构

• 发表时间: 2010
• 作者: Satomi Kanno;Masato Yamawaki;AtsushiHirose;Hiroki Ishibashi;Natsuko Kbayashi;Keitaro Tanoi;Laurent Nussaume;Tomoko M. Nakanishi;松田厚志
• 通讯作者: 松田厚志

超分解能蛍光顕微鏡3DSIMにより見る間期核クロマチン

使用超分辨率荧光显微镜 3DSIM 观察间期核染色质

• 发表时间: 2012
• 作者: Hitomi Sawai;Hiroshi Sugimoto;Haruto Ishikawa;Yoshitsugu Shiro;Yasuhisa Mizutani;Shigetoshi Aono;松田厚志
• 通讯作者: 松田厚志

Localization microscopy with conventional GFP and noisy biological samples

使用传统 GFP 和噪声生物样品进行定位显微镜

• 发表时间: 2012
• 作者: Atsushi Matsuda

超分解能蛍光顕微鏡により観察する分裂酵母のクロマチン

使用超分辨率荧光显微镜观察裂殖酵母染色质

• 发表时间: 2012
• 作者: M. Tominaga;A. Kimura;E. Yokota;T. Hamaguchi;T. Shimmen;K. Yamamoto;A. Nakano;and K. Ito;H. A. Sakaue;松田厚志
• 通讯作者: 松田厚志