Analyses of molecular mechanisms of regulation of bacterial shape by cytoskeletal protein complex.

细胞骨架蛋白复合物调节细菌形状的分子机制分析。

• 批准号: 24770191
• 负责人: SHIOMI Daisuke
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Rikkyo University (2013)National Institute of Genetics (2012)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24770191/
• 关键词: 細胞形態; 細胞骨格; 大腸菌; 抑圧変異体; 形態形成; 細胞骨格タンパク質; ペプチドグリカン; タンパク質間相互作用; Bacterial two-hybrid

Purpose of this project was to understand molecular mechanism to regulate bacterial cell shape. Analyses of the suppressor mutants of the rodZ mutant suggested that RodZ regulates assembly of MreB filaments. This result was published in 2012. In order to analyze the importance of the positively-charged residues in the juxta-membrane domain, I introduced Alanine into the residues and deleted the domain. I found that the positively-charged residues is dispensable for the RodZ function while the length of the domain is critical. I also analyzes the interaction among proteins constituting supramolecular machinery, elongasome. I found that RodZ interacts with MreB, MreC, PBP2, and RodA and that there are two sub-complexes in the complex, that is, MreB/MreC and PBP2/RodA complexes. The results indicate that RodZ bridges the sub-complexes. I also applied site-specific in vivo photo crosslink assay to detect interaction between RodZ and other proteins. I could detect crosslinked products.

本项目的目的是了解调控细菌细胞形状的分子机制。对rodZ突变体的抑制突变体的分析表明，RodZ调节MreB丝的组装。这一结果于2012年公布。为了分析带正电荷的残基在近膜结构域中的重要性，我将丙氨酸引入残基并删除结构域。我发现带正电荷的残基对于RodZ功能来说是不稳定的，而结构域的长度是关键的。 我还分析了蛋白质之间的相互作用，构成超分子机制，延长体。我发现RodZ与MreB，MreC，PBP 2和RodA相互作用，并且在复合物中存在两个亚复合物，即MreB/MreC和PBP 2/RodA复合物。结果表明，RodZ桥接子复合物。我还应用了位点特异性体内光交联分析来检测RodZ与其他蛋白质之间的相互作用。我能检测到交联产物。

项目成果

Mutations in cell elongation genes mreB, mrdA and mrdB suppress the shape defect of RodZ-deficient cells.

• DOI: 10.1111/mmi.12148
• 发表时间: 2013-03
• 期刊: Molecular microbiology
• 影响因子: 3.6
• 作者: Shiomi D;Toyoda A;Aizu T;Ejima F;Fujiyama A;Shini T;Kohara Y;Niki H
• 通讯作者: Niki H

Bacterial shape determinant protein RodZ directly binds to peptidoglycan to regulate the width

细菌形状决定蛋白RodZ直接与肽聚糖结合调节宽度

• 发表时间: 2013
• 作者: Esaki;M.;and Ogura;T.;塩見大輔
• 通讯作者: 塩見大輔

大腸菌形態制御因子RodZ の分裂面への局在とその意義

大肠杆菌形态调节因子RodZ在划分平面上的定位及其意义

• 发表时间: 2013
• 作者: 塩見 大輔;仁木 宏典
• 通讯作者: 仁木 宏典

RodZ タンパク質の細胞分裂面への局在:細胞幅の制御

RodZ 蛋白定位于细胞分裂平面：控制细胞宽度

• 发表时间: 2012
• 作者: 塩見 大輔;仁木 宏典
• 通讯作者: 仁木 宏典

Escherichia coli and Bacillus subtilis : The Frontiers of Molecular Microbiology Revisited (Sadaie Y and Matsumoto K.) Chapter 3-2. Nucleoid organization and chromosome segregation

大肠杆菌和枯草芽孢杆菌：分子微生物学前沿重温（Sadaie Y 和 Matsumoto K.）第 3-2 章。

• 发表时间: 2012
• 作者: Daisuke Shiomi;Hironori Niki
• 通讯作者: Hironori Niki