Genomic and chromosomal evolution of vertebrates inferred from comparative gene mapping

从比较基因图谱推断脊椎动物的基因组和染色体进化

基本信息

批准号：
24770226
负责人：
UNO Yoshinobu
金额：
$ 3万
依托单位：
Nagoya University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2012
资助国家：
日本
起止时间：
2012-04-01 至 2014-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

To deduce the process of genomic and chromosomal evolution in vertebrates, I constructed a chromosome map of Xenopus (Silurana) tropicalis using FISH mapping. The homologous segments corresponding to chicken microchromosomes have been highly conserved in X. tropicalis without microchromosomes, suggesting that the ancestral tetrapods probably had genetic linkage groups each of which corresponded to chicken microchromosomes. Next, I performed FISH mapping for an allotetraploid species, X. laevis, and constructed a comparative chromosome map between these two Xenopus species. This result indicated that the loss of duplicated genes and interchromosomal rearrangements occurred much less frequently in X. laevis allotetraploidization.

为了推断脊椎动物中的基因组和染色体进化过程，我使用鱼类图构建了Xenopus（Silurana）Tropicalis的染色体图。与鸡微色体相对应的同源片段在没有微染色体的X. topicalis中得到了高度保守，这表明祖先四足动物可能患有遗传连锁基团，每个遗传连锁基团每个对应于鸡肉微染色体。接下来，我为同种二磷酸物种X. laevis进行了鱼类图，并在这两个爪蟾物种之间构建了比较染色体图。该结果表明，在X. Laevis同种异体二磷酸化中，重复的基因和染色体重排的丧失频率要少得多。

项目成果

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アフリカツメガエルのゲノム倍数化過程に生じた染色体再配列と無尾両生類における性染色体の起源とその進化に関する分子細胞遺伝学的研究

非洲爪蟾基因组多倍化过程中染色体重排及无尾两栖类性染色体起源与进化的分子细胞遗传学研究

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
H. Yasumitsu;H. Tajima;M. Isobe;S. Kutsuna;S. M. Kawsar;Y. Fujii;R. A. Kanaly;Y. Ozeki and E. Yokota;宇野好宣・西田千鶴子・高木知世・井川武・上野直人・住田正幸・松田洋一
通讯作者：
宇野好宣・西田千鶴子・高木知世・井川武・上野直人・住田正幸・松田洋一

Molecular cytogenetic studies on the process of genomic and chromosomal evolution in X. laevis after WGD and the origin and evolution of sex chromosomes in anuran species

WGD后非洲虎基因组和染色体进化过程及无尾类性染色体起源和进化的分子细胞遗传学研究