Microbial analysis of subglacial samples drilling at Dome Fuji, Antarctica
对南极洲富士圆顶钻探的冰下样本进行微生物分析
基本信息
- 批准号:24710020
- 负责人:
- 金额:$ 3万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
- 财政年份:2012
- 资助国家:日本
- 起止时间:2012-04-01 至 2014-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
The ice cores from Antarctica could preserve microorganisms in the ancient atmosphere trapped in the snow and ice from the ice sheet. Subglacial environment are thought to be contained ancient ecosystems. We examine microorganisms in the ice core samples near the bedrock by molecular DNA techniques. We extracted the inner part of ice core samples using the melting device special designed for biological analysis. Small DNA fragments were extracted from ice samples and sequenced using Illumina Hiseq and Miseq sequencers. We carried out taxonomic and functional binning of the metagenomic DNA, and attempted to reconstruct the organisms. Our data support that microorganism have existed in this subglacial environment.
来自南极洲的冰芯可以保存被困在冰雪和冰盖中的古代大气中的微生物。冰下环境被认为包含着古老的生态系统。我们用分子DNA技术检测了基岩附近冰芯样本中的微生物。我们利用专门为生物分析设计的融化装置提取了冰芯样品的内部。从冰样中提取小DNA片段,并使用Illumina HiSeq和MiSeq测序仪进行测序。我们对后基因组DNA进行了分类和功能分类,并试图重建生物体。我们的数据支持在这个冰下环境中存在微生物。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
低温科学、氷河やアイスコア中のバクテリアに関する研究
低温科学、冰川和冰芯细菌研究
- DOI:
- 发表时间:2012
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Takahiro Segawa;Satoshi Ishii;Dylan Bodington;Yuichi Hongoh;Fumito Maruyama;Nozomu Takeuchi;Takahiro Segawa; Satoshi Ishii; Dylan Bodington; Yuichi Hongoh; Fumito Maruyama; Nozomu Takeuchi;Takahiro Segawa;瀬川高弘,近藤伸二,本山秀明;瀬川高弘;瀬川高弘
- 通讯作者:瀬川高弘
Nitrogen cycle in cryoconites : naturally-occurring nitrification-denitrification granules on a glacier in Central Asia
冰石中的氮循环:中亚冰川上自然存在的硝化反硝化颗粒
- DOI:
- 发表时间:2013
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Takahiro Segawa;Satoshi Ishii;Nobuto Ohte;Zhongqin Li;Yuichi Hongoh;Nozomu Takeuchi
- 通讯作者:Nozomu Takeuchi
南米パタゴニア氷原チンダル氷河裸氷域表面の近年の変化
南美洲巴塔哥尼亚冰原廷德尔冰川裸露冰面的近期变化
- DOI:
- 发表时间:2013
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:藤澤 雄太;竹内望;幸島司郎;瀬川高弘;村上匠
- 通讯作者:村上匠
Distribution of cyanobacteria in glacier environment, International Workshop on Glacial Ecology
冰川环境中蓝藻的分布,冰川生态学国际研讨会
- DOI:
- 发表时间:2012
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Takahiro Segawa;Satoshi Ishii;Dylan Bodington;Yuichi Hongoh;Fumito Maruyama;Nozomu Takeuchi;Takahiro Segawa; Satoshi Ishii; Dylan Bodington; Yuichi Hongoh; Fumito Maruyama; Nozomu Takeuchi;Takahiro Segawa
- 通讯作者:Takahiro Segawa
極限環境生物の産業展開,「第5章アイスコア中の微生物解析」
极端微生物的工业发展,“第五章冰芯中的微生物分析”
- DOI:
- 发表时间:2012
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Takahiro Segawa;Satoshi Ishii;Dylan Bodington;Yuichi Hongoh;Fumito Maruyama;Nozomu Takeuchi;Takahiro Segawa; Satoshi Ishii; Dylan Bodington; Yuichi Hongoh; Fumito Maruyama; Nozomu Takeuchi;Takahiro Segawa;瀬川高弘,近藤伸二,本山秀明;瀬川高弘
- 通讯作者:瀬川高弘
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