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進化医学が拓く新たな人類学：ヒト集団で広範にみられる解毒酵素欠損多型の進化的背景

进化医学开创的新人类学：人类群体中广泛发现的解毒酶缺乏多态性的进化背景

基本信息

批准号：
14J04456
负责人：
齊藤真理恵
金额：
$ 1.79万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2014
资助国家：
日本
起止时间：
2014-04-25 至 2017-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究は，細胞解毒酵素グルタチオン-S-トランスフェラーゼμ (GSTM)1をコードするGSTM1遺伝子欠失多型が人類集団中に維持され，集団によって異なる頻度を示す進化的背景を明らかにすることを目的とした。GSTM1欠失の分布が適応の結果かどうかを検討するため，1000ゲノムプロジェクトのデータ（東アジア，ヨーロッパ，アフリカ集団）を用いて統計的解析をおこなった。まず，解析に用いる，欠失と連鎖した領域を探すため，欠失と周辺SNPのR2を計算したが，欠失近傍でも<0.5程度の低い値しか算出されず，この領域でgene conversionやrecombinationが起きたことが示唆された。0.5程度のR2をもつGSTM1遺伝子の上流及び下流の約10kbをタグ領域と定め，その配列を集団間で比較した。結果，東アジア人とアフリカ人の間で高いFst(上流0.4，下流0.6<)をもつSNPが観察され、それらのSNPは東アジアにおいてのみGSTM1遺伝子欠失と比較的高い連鎖不平衡値（R2）を示した。また，東アジアにおいては，欠失と連鎖しているハプロタイプが高頻度だった。これは，東アジアにおいてこのハプロタイプあるいは欠失が適応的だったことを示唆する。また，本年度はGSTM1欠失をヘテロにもつヒト7個体，チンパンジー7個体の欠失アリルを解読し、参照ゲノムを含めて詳細な比較解析をおこなった。その結果、ヒトとチンパンジーで欠失のbreak pointが非常に近いことが明らかになった。また，ヒトにおいてもチンパンジーにおいても非常に近い部位でgene conversionがおき、それによってGSTM1遺伝子両側の配列の類似性が局所的に非常に高くなり、どちらの系譜においても同じメカニズムでGSTM1遺伝子欠失が起きたと推測された。

The purpose of this study is to clarify the context in which the genetic polymorphism of the cellular detoxification enzyme Glutataon-S-Transansfizira-μ (GSTM)1 is maintained in human groups and the frequency of expression in groups evolves. GSTM1 deficit distribution results in a statistical analysis of the 1000-point distribution (East, West, and East). In the analysis, the missing linkage domain is detected, the missing cycle SNP R2 is calculated, the missing proximity is <0.5 and the low value is calculated, and the gene conversion and recombination in this domain is started. 0.5 The R2 level is about 10kb in the upstream and downstream of GSTM1. As a result, the linkage disequilibrium (R2) between the two SNPs was higher than that between the two SNPs (0.4 and 0.6). The frequency of loss is high. This is the first time I've ever seen a woman. This year, the GSTM1 has lost 7 individuals, and the GSTM1 has lost 7 individuals. The GSTM 1 has lost 7 individuals, and the GSTM 1 has lost 7 individuals. The GSTM 1 has lost 7 individuals. The result is that the break point is very close. The similarity of the gene conversion in the gene sequence of GSTM1 gene sequence is very high, and the gene conversion in the gene sequence of GSTM1 gene sequence is very high.