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骨格筋の適応を引き起こす筋収縮の時間と強度の最適パターンの解明

阐明导致骨骼肌适应的肌肉收缩时间和强度的最佳模式

基本信息

批准号：
14J05223
负责人：
星野太佑
金额：
$ 3.16万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2014
资助国家：
日本
起止时间：
2014-04-25 至 2017-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

電気刺激によるmRNAの変動を明らかにするために、myotubesに分化させたマウス骨格筋由来のC2C12細胞に対して電気刺激をおこなった。電気刺激は、50V、3msのパルス刺激を2Hz、20Hzの2種類60分間おこなった。サンプリングタイムポイントは刺激前、60分間の刺激直後と刺激後1時間、3時間、6時間後とした。トランスクリプトーム解析は、Hiseq25000 (Ilumina)を用いてRNA sequenceをおこなった (n=1)。データの解析は、まずTOPHAT、Cufflinksを用いてアノテーションし、fragments per kilobase of exon per million mapped fragments (FPKM)を算出した。FPKM>1の遺伝子を発現遺伝子としたところ、11185遺伝子抽出された。次に、変動遺伝子の抽出は、2Hzもしくは20Hzでtime0と比較して、>2.0もしくは<0.5のFPKMが1つでもある遺伝子とした。その結果、800遺伝子が変動遺伝子として抽出された。800の変動遺伝子に対して、KEGG databaseを用いたパスウェイ解析をDAVIDを用いておこなった。その結果、グルタチオン、中心炭素代謝、コリン、ペントースリン酸経路など、代謝に関わるmRNAの変動が多かったことが明らかとなった。さらに、代謝物濃度の変動からさかのぼると、この変動遺伝子の中に、27個の変動責任代謝酵素が同定された。また、この変動責任代謝酵素の中には、ペントースリン経路の代謝酵素が多く含まれていた。よって、遺伝子発現を介してペントースリン酸経路の代謝物が増加した可能性が示唆された。以上の研究結果を投稿論文にまとめている段階である。

The reason for the formation of bone lattices in C2C12 cells is that the mRNA stimuli are activated by electrical stimulation and the differentiation of bone lattices by myotubes. Electric stimulation, 50V, 3ms stimulation, 2Hz, 20Hz, etc., two kinds of 60-minute interval. After 60 minutes of stimulation, 1 time, 3 hours, and 6 hours after stimulation, there was no significant difference between the two groups. Please analyze, Hiseq25000 (Ilumina), and use RNA sequence (parsing). Please analyze, TOPHAT, Cufflinks and calculate the number of errors by using fragments per kilobase of exon per million mapped fragments (FPKM). In FPKM>1, you can see that the child is broken, and the 11185 child is pulled out of the box. In the second place, you need to extract the information, 2Hz the 20Hz time0, and & gt;2.0 the FPKM to check the number of users. The result of the test, 800 minutes, the number of children, the results, the results and the results. The 800-thousand-minute system is used to analyze the information of the DAVID and the KEGG database is used to analyze the information. The results of the experiment, the results of the test, the carbon replacement of the center, the carbon replacement of the center, the carbon replacement of the central carbon, the carbon replacement of the central carbon, the carbon replacement, the carbon replacement, the carbon The enzyme enzymes of each of the 27 mobile phones are the same as those of the other two, either of which is the same. There are many enzymes in the enzyme system, such as the enzyme, the enzyme, the enzyme and the enzyme. The possibility of adding the possibility is an indication of the possibility of an increase in the possibility of an increase in the number of people in the road. The results of the above study