ミスマッチ塩基対の検出に対するルテニウム錯体光誘起機能の活用に向けた理論研究

利用钌配合物光诱导功能检测错配碱基对的理论研究

基本信息

  • 批准号:
    14J10694
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.22万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2014
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2014-04-25 至 2016-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本研究の目的は、DNA挿入下におけるRu錯体の発光について、錯体と塩基間および錯体と溶媒水分子間の相互作用に着目して考察し、ミスマッチ塩基対の検出に活用可能なRu錯体の設計指針を理論的に示すことである。本年度は、適正塩基対挿入錯体およびミスマッチ塩基対挿入錯体の挿入環境における錯体の励起状態特性を明らかにするため、孤立錯体、錯体と水2分子との複合体、および錯体まわりのDNA構成原子を含めた系に対してTD-DFT計算を行った。DNA挿入下におけるNphz-Hwの最近接距離 (3.0 - 3.6 Å) に水分子を配置したモデル錯体の励起状態特性は孤立錯体のものと類似しており、Nphzと水分子との局所的な相互作用が錯体の励起状態特性に及ぼす影響は小さいことが明らかになった。錯体まわりのDNA構成原子を含めた系に対するTD-DFT計算から、錯体の最低3MLCT状態は3MLCTbpy (明状態) であることが示された。錯体まわりのDNA構成原子がつくる静電ポテンシャルを見積もると、挿入環境の違いに依らず共に負の値をもち、dppz配位子側よりもbpy配位子側が相対的に小さくなっていることが示された。したがって、DNA挿入下における錯体の最低3MLCT状態が3MLCTbpyである要因のひとつとして、DNAがつくる静電ポテンシャル場の影響があることが示唆された。本研究では、DNA挿入錯体の発光を担う励起状態は挿入環境に依らず3MLCTbpy状態であることや、DNAの静電場との相互作用により3MLCTbpy状態が安定化する可能性について示した。すなわち、輻射速度定数は挿入環境にあまり依存しないことが示唆される。したがって、挿入環境により異なる発光量子収率の解釈へと研究を発展させるには、無輻射速度定数についての知見を得ることが必要であると考えられる。
The purpose of this study is to investigate the interaction between Ru complex and solvent water molecules under DNA incorporation, and to explore the possible use of Ru complex design guidelines. This year, TD-DFT calculations were performed on the excitation state characteristics of the positive and negative base pairs of the positive and negative base pairs of the negative base pairs of the negative base pairs of The Nphz-Hw closest contact distance (3.0 - 3.6 °) of DNA penetration is similar to that of isolated faults in the excitation state characteristics of water molecules. The interaction between Nphz-Hw and the excitation state characteristics of water molecules is small. TD-DFT calculations show that the lowest 3MLCT state of the fault is 3MLCTbpy (bright state). The DNA constituent atoms of the complex are separated by electrostatic charges, and the negative values of the molecules in the environment are separated by the dppz ligand and the bpy ligand. The minimum 3MLCT state of the wrong body is 3MLCTbpy, and the influence of electrostatic field on DNA is 3MLCTbpy. This study shows the possibility that the light-emitting state of DNA incorporated into the complex can be stabilized by the interaction of electrostatic field with DNA. The radiation velocity depends on the environment. A study on the solution of the emission of light quantum in different environments is necessary to develop the knowledge of the determination of the non-radiative velocity.

项目成果

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专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
ミスマッチ塩基対挿入下における [Ru(bpy)2dppz]2+ の発光増強に関する理論研究
错配碱基对插入下[Ru(bpy)2dppz]2+发光增强的理论研究
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Takeshi Fujiwara;Yuki Mitsuya;Hiroyuki Takahashi;et al.;大塚 美穂,鷹野 景子
  • 通讯作者:
    大塚 美穂,鷹野 景子
異なる溶媒環境における光スイッチ分子 [Ru(L)2dppz] (L = bpy, tap) の3重項励起状態に関する理論研究
不同溶剂环境下光开关分子[Ru(L)2dppz](L=bpy,tap)三重激发态的理论研究
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    大塚 美穂,Christophe GOURLAOUEN ;Chantal DANIEL ;鷹野 景子
  • 通讯作者:
    鷹野 景子
Theoretical study on [Ru(bpy)2dppz]2+ at well-matched and mismatched sites for binding structures and interactions with the DNA
[Ru(bpy)2dppz]2 在良好匹配和错配位点的结合结构和与 DNA 相互作用的理论研究
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Miho Otsuka;Keiko Takano
  • 通讯作者:
    Keiko Takano
Theoretical study on excited-state properties of Ru complex as a DNA intercalator under different environments
不同环境下Ru配合物作为DNA嵌入剂激发态特性的理论研究
  • DOI:
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    大塚 美穂;鷹野 景子
  • 通讯作者:
    鷹野 景子
ミスマッチ塩基対挿入下における [Ru(bpy)2dppz]2+ の構造と水溶媒分布の解析
错配碱基对插入下[Ru(bpy)2dppz]2+的结构和水溶剂分布分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    大塚 美穂;鷹野 景子
  • 通讯作者:
    鷹野 景子
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