Community composition of the bacterioplanktons in the Southern Ocean

通过真实的荧光PCR方法对玫瑰杆菌属RCA（RoseobacterClade Affiliated）簇的多样性、多样性和丰度进行了研究，确定了玫瑰杆菌属RCA簇，并对南方极地α-Proteobakterien的RSAR 11-Zweig进行了比较。本研究提供了一种扩增16 S rRNA基因片段的特异性引物。通过对南极哈滕的分析发现，南极的RCA-集群有20%的细菌群，并且南极的细菌群中含有一种特殊的结构元素。Roseback-和SAR 11-Zweiges的多样性是由DGGE和Zweig-specifischer Primersysteme组成的，并由DGGE-Banden进行分析。通过实验，1999年5月至5月的ANT XVI/3号研究成果被认为是亚热带阵线的产物，而极地阵线则被认为是温带阵线和温带Küstenstrom基因组的沃登。

Im beantragten Forschungsvorhaben soll die Verbreitung, Diversität und Abundanz eines kürzlich definierten eng umgrenzten Roseobacter-Clusters, das RCA (Roseobacter Clade Affiliated) Cluster, im Vergleich zum Roseobacter-Zweig und dem SAR11-Zweig der al-pha-Proteobakterien im Südpolarmeer mittels real time PCR untersucht werden. Dabei kommen Zielgruppen-spezifische Primer zur Amplifikation von Fragmenten der 16S rRNA-Gene zum Einsatz. Voruntersuchungen der Antragsteller hatten gezeigt, dass das RCA-Cluster etwa 20% der Domaine der Bacteria im Südpolarmeer umfasst und damit ein wichtiges strukturelles Element des Bakterioplanktons im Südpolarmeer ist. Die Diversität innerhalb des Roseobacter- und SAR11-Zweiges wird mittels DGGE und Zweig-spezifischer Primersysteme und nach Sequenzierung charakteristischer DGGE-Banden a-nalysiert. Die Untersuchung erfolgt mit Proben, die während der Forschungsfahrt ANT XVI/3 von März bis Mai 1999 von nördlich der subtropischen Front über die subantarktische Front, die Polarfront bis ins Weddellmeer und in den antarktischen Küstenstrom genommen worden sind.