Untersuchungen zur Populationsdynamik von schwebstoffassoziierten und frei suspendierten Bakteriengemeinschaften in der Wesermündung
威悉河口悬浮沉积物相关和自由悬浮细菌群落的种群动态研究
基本信息
- 批准号:5205040
- 负责人:
- 金额:--
- 依托单位:
- 依托单位国家:德国
- 项目类别:Research Grants
- 财政年份:1999
- 资助国家:德国
- 起止时间:1998-12-31 至 2001-12-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
Im beantragten Forschungsvorhaben soll die Zusammensetzung der schwebstoffassoziierten und frei suspendierten Bakteriengemeinschaft im Salinitätsgradienten des Ästuars der Unterweser und deren saisonale Dynamik untersucht werden. Die qualitative Zusammensetzung wird mittels denaturierender Gradienten-Gel-Elektrophorese nach PCR-Amplifikation von Fragmenten des 16S rRNA-Gens mit 550 Basenpaaren analysiert. Die ausgeschnittenen Banden werden sequenziert und deren phylogenetische Verwandschaft bestimmt. Außerdem wird die Zusammensetzung mittels in situ Hybridisierung mit fluoreszenzmarkierten rRNA-gerichteten Oligonukleotidsonden unterschiedlicher Spezifität quantifiziert. Um die verschiedenen Bakteriengruppen zu erfassen, sollen zunächst gruppenspezifische Sonden eingesetzt werden (Proteobakterien, Cytophagen/Flavobakteriencluster). Später werden auf der Basis der sequenzierten 16S rRNA-Fragmente neue Sonden von relevanten Vertretern aus der Unterweser konstruiert, um deren Populationsdynamik im Salinitätsgradienten und saisonal zusammen mit dem Umsatz der wichtigsten organischen Substrate zu erfassen. Weiterhin werden MPN-Verdünnungsreihen angelegt, um wichtige Vertreter zu kultivieren, deren 16S rRNA-Gene zu sequenzieren und spezifische Sonden zu konstruieren. In Mesokosmen wird die Wachstumsdynamik und der Substratumsatz der wichtigsten Bakterien unter kontrollierten Bedingungen studiert.
Im beantragten Forschungsvorhaben soll die Zusammensetzung der schwebstoffassoziierten and frei suspendierten Bakteriengemeinschaft im Salinitätsgradienten des Ästuars der Unterweser and deren saisonale Dynamik untersucht韦尔登.通过PCR扩增550个碱基的16 S rRNA基因片段,进行变性凝胶电泳定性。这些基因组韦尔登序列和基因组学研究已经完成。用荧光标记的rRNA-gerichteten Oligonukleotidsonden进行原位杂交,然后进行定量分析。Um die versedenen Bakteriengruppen zu erfassen,sollen zunächst gruppenspezihe Sonden eingesetzt韦尔登(Proteobakterien,Cytoprotein/Flavobakterienclusters). Später韦尔登的基础上,测序16 S rRNA-片段新的Sonden从相关垂直于Unterweser construiert,um deren Populationsdynamik im Salinitätsgradienten and saisonal zusammen dem Umbrella der wichtigsten organischen Substrate zuerfassen。此外,韦尔登MPN-Verdünnungsreihen angelegt,一个wichtige Vertreter zu kulivieren,deren 16 S rRNA基因zu sequenzieren和speciophiles sonden zu struieren。在介观空间中,我们将研究最重要的动力学和基础理论。
项目成果
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