小笠原諸島と琉球列島に分布する外生菌根菌の集団遺伝学的研究

小笠原群岛和琉球群岛分布的外生菌根真菌群体遗传学研究

• 批准号: 15F15714
• 负责人: 保坂 健太郎
• 金额: $ 1.47万
• 依托单位: National Museum of Nature and Science, Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2015
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2015-04-24 至 2017-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15F15714/
• 关键词: 菌根菌; 移入種; 多様性; 個体群; 進化; きのこ; リュウキュウマツ; 小笠原

リュウキュウマツが自然分布する琉球列島のうち、奄美大島、沖縄島、石垣島、宮古島を対象に、リュウキュウマツと共生する外生菌根菌であるチチアワタケ（イグチ目ヌメリイグチ科）およびアカハツ（ベニタケ目ベニタケ科）の2種の子実体を集中的にサンプリングした。また、リュウキュウマツが人為的に移入された先である小笠原諸島の父島および母島においても、同2種のサンプリングを集中的に行なった。サンプリングにおいては子実体が10メートル以上離れて発生している場合に別個体とみなした。最終的にはチチアワタケ200個体以上、アカハツ120個体以上を採集し、解析に用いた。全個体からDNAを抽出し、核ITS領域の塩基配列で同一種であることを確認した後に、RAPD法により近隣に発生していた子実体の個体識別を行った。その結果残ったDNAサンプルをピコグリーンにより定量し、かつバイオアナライザーにより定性した。その結果DNAの質・量が十分であるものを次の解析に用いた。抽出DNAは2種類の制限酵素により断片化し、今回のプロジェクト用に作成したアダプターをライゲーションしたうえでRAD-Seq法により個体群を解析した。イルミナ社MiSeqを用い、MiSeq Reagent Kit v3 (150 Cycle)キットにより計5ランのシーケンシングを行い、2種それぞれの全個体におけるSNPs（一塩基多型）を検出した。それぞれの遺伝子型を基にSTRUCTUREによるクラスター解析を行い、移入元（琉球列島）と移入先（小笠原諸島）における遺伝構造を解析した。その結果、(1) 琉球列島内では概ね島ごとに遺伝構造が異なること、（2）琉球列島と小笠原諸島では遺伝組成が異なることが示唆された。

Natural distribution of ectomycorrhizal fungi in Ryukyu Islands, Amami Island, Okinawa Island, Ishigaki Island and Miyako Island. The two species of ectomycorrhizal fungi are concentrated. The first two types of artificial migration are the parent islands and mother islands of the Ogasawara Islands. In the case of a child, it is necessary to separate the child from the child. More than 200 individuals and more than 120 individuals were collected and analyzed. DNA was extracted from whole individuals, DNA was mapped in the ITS domain, DNA was identified from the same species, and DNA was identified from neighboring individuals by RAPD. The results of DNA sequencing are determined by the amount of DNA available. The quality and quantity of DNA are very different. DNA was extracted from two kinds of restriction enzymes, and the RAD-Seq method was used to analyze individual groups. MiSeq Reagent Kit v3 (150 Cycle): 5 types of SNPs (1 to 2 types) The analysis of the STRUCTURE of the genetic sub-type, the migration element (Ryukyu Islands) and the migration element (Ogasawara Islands) The results are as follows: (1) The structure of the Ryukyu Islands is different;(2) The structure of the Ryukyu Islands is different.

项目成果

Dating the emergence of truffle-like fungi in Australia, by using an augmented meta-analysis

通过增强荟萃分析来确定澳大利亚松露类真菌出现的年代

• DOI: 10.1071/sb16025
• 发表时间: 2016
• 期刊: Australian Systematic Botany
• 影响因子: 1.6
• 作者: Sheedy EM;Ryberg M;Lebel T;May TW;Bougher NL;Matheny PB
• 通讯作者: Matheny PB

Dating the emergence of sequestrate fungi in Australia, using an augmented meta-analysis

使用增强荟萃分析测定澳大利亚隔离真菌的出现日期

• 发表时间: 2017
• 作者: Deng Guanyu;Bhattacharjee Tilak;Chong Yan;Zheng Ruixiao;Bai Yu;Shibata Akinobu;Tsuji Nobuhiro;Sheedy M
• 通讯作者: Sheedy M

On populations of ectomycorrhizal fungi introduced to the Bonin Islands

关于引入小笠原群岛的外生菌根真菌种群

• 发表时间: 2016
• 作者: Sheedy E;Hosaka K
• 通讯作者: Hosaka K

きのこの絶滅種標本からDNAを採り野外から検出する試み.

尝试从已灭绝的蘑菇物种标本中收集 DNA 并在现场进行检测。

• 发表时间: 2017
• 作者: Abue;M.;Yokoyama;M.;Shibuya;R.;Tamai;K.;Yamaguchi;K.;Sato;I.;Tanaka;N.;Hamada;S.;Shimosegawa;T.;Sugamura;K.;Satoh;K.;中谷友樹;保坂健太郎・南京沃
• 通讯作者: 保坂健太郎・南京沃

ソライロタケをめぐる分類・生物地理・生態の謎.

空色竹的分类、生物地理学和生态学之谜。

• 发表时间: 2016
• 作者: Sugiyama;T.;Inoue;S.;Cerin;E.;Shimomitsu;T.;Owen;N..;保坂健太郎
• 通讯作者: 保坂健太郎