超高感度な固体NMRを用いた細胞内タンパク質運動性測定法の開発と応用
超高感度な固体NMRを用いた細胞内タンパク質運動性測定法の開発と応用
批准号:
15J00189
负责人:
山田 和哉
金额:
$1.09万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2015
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2015-04-24 至 2017-03-31
中文摘要
本研究では、細胞内(in-cell)固体NMRを用いた細胞内分子数の定量、細胞内分子の超高感度測定に向けた高温動的核分極法(高温DNP)のためのガラス基質の探索、細胞内タンパク質の構造情報を得るための新規ラジカルタグの合成を行った。細胞内分子数の定量研究では、昨年度に大腸菌細胞を生きたまま固体NMRを用いて測定し、ユビキチン過剰発現時の1細胞あたりに合成される分子種・分子数を定量する方法論を確立した。今年度はさらにその手法を発展させ、大腸菌細胞内でのユビキチン構造解析を行った。その結果、大腸菌細胞内のユビキチンは、正しい二次構造を取っていることが示された。高温DNPのガラスマトリクス探索では、昨年度の探索によりリボース、イジトール、ソルビトールが適することを見出していたが、高濃度ソルビトール溶液は室温で放置すると結晶化してしまい、不適であることが分かった。また、DSCを用いてリボース、イジトールのガラスマトリクスのガラス転移点を測定し、210 K以上になったことを確認した。これらのマトリクスを用いれば、210 K以上での測定が必要なタンパク質の運動性に関する情報を、高感度で得られるようになる。新規ラジカルタグの合成研究では、光励起ラジカルであるフラビンによる核スピン緩和促進効果により、タンパク質内の原子間距離を求める手法開発を試みた。昨年度合成したタグ化フラビン分子は水中で不安定であり、タンパク質のタグ化には不適であった。そこで、新たな分子を複数設計し、種々の条件で合成を試みたところ、条件に合うタグ化フラビン分子を1種合成することに成功した。
英文摘要
本研究では、細胞内(in-cell)固体NMRを用いた細胞内分子数の定量、細胞内分子の超高感度測定に向けた高温動的核分極法(高温DNP)のためのガラス基質の探索、細胞内タンパク質の構造情報を得るための新規ラジカルタグの合成を行った。細胞内分子数の定量研究では、昨年度に大腸菌細胞を生きたまま固体NMRを用いて測定し、ユビキチン過剰発現時の1細胞あたりに合成される分子種・分子数を定量する方法論を確立した。今年度はさらにその手法を発展させ、大腸菌細胞内でのユビキチン構造解析を行った。その結果、大腸菌細胞内のユビキチンは、正しい二次構造を取っていることが示された。高温DNPのガラスマトリクス探索では、昨年度の探索によりリボース、イジトール、ソルビトールが適することを見出していたが、高濃度ソルビトール溶液は室温で放置すると結晶化してしまい、不適であることが分かった。また、DSCを用いてリボース、イジトールのガラスマトリクスのガラス転移点を測定し、210 K以上になったことを確認した。これらのマトリクスを用いれば、210 K以上での測定が必要なタンパク質の運動性に関する情報を、高感度で得られるようになる。新規ラジカルタグの合成研究では、光励起ラジカルであるフラビンによる核スピン緩和促進効果により、タンパク質内の原子間距離を求める手法開発を試みた。昨年度合成したタグ化フラビン分子は水中で不安定であり、タンパク質のタグ化には不適であった。そこで、新たな分子を複数設計し、種々の条件で合成を試みたところ、条件に合うタグ化フラビン分子を1種合成することに成功した。
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Quantitative in-cell solid-state NMR for counting the number of molecules synthesized in a ubiquitin-overexpressed intact Escherichia coli cell
定量细胞内固态 NMR,用于计数泛素过表达的完整大肠杆菌细胞中合成的分子数量
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kazuya Yamada, Ayako Egawa, Toshimichi Fujiwara]
通讯作者:
Toshimichi Fujiwara
Counting the molecules synthesized in an ubiquitin-overexpressed intact Escherichia coli cell by solid-state NMR
通过固态 NMR 对泛素过表达的完整大肠杆菌细胞中合成的分子进行计数
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kazuya Yamada, Ayako Egawa, Toshimichi Fujiwara, 畑中美帆, Kazuya Yamada, 畑中美帆, 山田 和哉, 山田 和哉]
通讯作者:
山田 和哉
大腸菌によるユビキチン過剰発現時に合成される単一細胞当りの分子数評価を指向した定量固体NMR法
定量固态核磁共振方法旨在评估大肠杆菌泛素过度表达期间每个单细胞合成的分子数量
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kazuya Yamada, Ayako Egawa, Toshimichi Fujiwara, 畑中美帆, Kazuya Yamada, 畑中美帆, 山田 和哉]
通讯作者:
山田 和哉
Development of the Quantitative Solid-state NMR and its Application to the Counting of the Number of Molecules in an Intact Escherichia Coli Cell
定量固态核磁共振的发展及其在完整大肠杆菌细胞中分子数计数中的应用
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kazuya Yamada, Ayako Egawa, Toshimichi Fujiwara]
通讯作者:
Toshimichi Fujiwara
Quantitative Solid-state NMR Method for Counting the Number of Molecules Synthesized under the Overexpression in an Escherichia Coli Cell
用于计数大肠杆菌细胞中过表达下合成的分子数的定量固态NMR方法
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kazuya Yamada, Ayako Egawa, Toshimichi Fujiwara, 畑中美帆, Kazuya Yamada, 畑中美帆, 山田 和哉, 山田 和哉, 畑中美帆, Miho Hatanaka, 山田 和哉]
通讯作者:
山田 和哉
共 7 条
国内基金
海外基金
基于In-cell NMR策略对“舟楫之剂”桔梗中引经药效物质的快速发现研究
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批准号:82305053
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:30万元
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批准年份:2023
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负责人:王丽明
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依托单位:
神经细胞内异常磷酸化α-synuclein稳定性及其调控机制的in-cell NMR研究
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批准号:21673284
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项目类别:面上项目
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资助金额:65.0万元
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批准年份:2016
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负责人:张则婷
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依托单位: