細胞分化における体細胞piRNAの機能解明
細胞分化における体細胞piRNAの機能解明
批准号:
15J00469
负责人:
庄司 佳祐
金额:
$1.47万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2015
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2015-04-24 至 2017-03-31
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英文摘要
piRNAは主に生殖巣において機能すると考えられているが、近年、体細胞においても機能することが示唆されつつある。本研究ではpiRNAを発現する卵巣由来のカイコ培養細胞(BmN4)を脂肪細胞様に分化させ、生殖細胞から体細胞に分化する際のpiRNA動態を捉えるための実験基盤の構築を目的とした。また、BmN4細胞を用いた人工piRNA産生系の確立を試みた。1. piRNAの多くはゲノム上のpiRNAクラスタと呼ばれる領域に由来する。BmN4細胞における脂肪細胞分化誘導時のmRNAおよびpiRNAの変動を調査したところ、piRNAクラスタの一部から発現するmRNAおよびpiRNAは、脂肪細胞分化によって顕著に変化した。カイコ胚子期の発達段階別のpiRNAライブラリとの比較を行った結果、これらのpiRNAクラスタは、胚子の発達に伴っても類似の発現変動を示すことが分かった。この結果は、本研究で用いた誘導系がpiRNAクラスタの発現調節の観点で胚子期の変動を模倣している可能性を示唆している。この結果は平成29年度蚕糸・昆虫機能利用学術講演会において発表した。2. piRNAはping-pong cycleと呼ばれる増幅経路によって増幅すると考えられている。しかし、ping-pong cycleはバイオインフォマティクス解析から想定されたモデルであって、堅固な実験的証明は存在しなかった。本研究では、BmN4細胞を用いて人工的にping-pong piRNAを産生する系を構築し、ping-pong cycleの実証に成功した。さらに、この実験系を利用することによって、piRNA-PIWIタンパク質による認識には17塩基の相補が必要であり、22塩基の相補があれば充分であることを示した。この結果は、RNA誌に発表するとともに、国際学会においても発表を行い、学生優秀発表賞を受賞した。
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Proof-of-concept for the “ping-pong” amplification cycle of PIWI-interacting RNAs.
PIWI 相互作用 RNA 的“乒乓”扩增循环的概念验证。
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Keisuke Shoji, Yutaka Suzuki, Sumio Sugano, Toru Shimada, and Susumu Katsuma]
通讯作者:
and Susumu Katsuma
Is the expression of sense and antisense transgenes really sufficient for artificial piRNA production?
有义和反义转基因的表达真的足以用于人工 piRNA 的生产吗?
DOI:
10.1016/j.cub.2015.07.001
发表时间:
2015
期刊:
Current Biology
影响因子:
9.2
作者:
[Izumi N, Shoji K, Sakaguchi Y, Honda S, Kirino Y, Suzuki T, Katsuma S, Tomari Y, Keisuke Shoji and Susumu Katsuma]
通讯作者:
Keisuke Shoji and Susumu Katsuma
昆虫遺伝研究室ホームページ
昆虫遗传学实验室主页
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Artificial "ping-pong" cascade of PIWI-interacting RNA in silkworm cells.
Piwi相互作用RNA在蚕细胞中的人工“乒乓”级联。
DOI:
10.1261/rna.058875.116
发表时间:
2017-01
期刊:
RNA (New York, N.Y.)
影响因子:
--
作者:
[Shoji K, Suzuki Y, Sugano S, Shimada T, Katsuma S]
通讯作者:
Katsuma S
Revealing Nbr functions in pre-piRNA trimming in silkworms by bioinfomatics analysis
通过生物信息学分析揭示 Nbr 在蚕 pre-piRNA 修剪中的功能
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Keisuke Shoji, Natsuko Izumi, Yukihide Tomari, Susumu Katsuma.]
通讯作者:
Susumu Katsuma.
共 8 条
細胞内共生細菌による宿主piRNA 経路操作機構の解明
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批准号:24K01769
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.98万
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财政年份:2024
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负责人:庄司 佳祐
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依托单位:
piRNAセンサーシステムを用いたpiRNAクラスタの成立条件の解明
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批准号:22K15082
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项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2022
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负责人:庄司 佳祐
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依托单位:
持続感染性RNAウイルスを用いたpiRNAによる非自己認識システムの解明
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批准号:17J02408
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$3.08万
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财政年份:2017
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负责人:庄司 佳祐
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依托单位:
海外基金