細胞分化における体細胞piRNAの機能解明

体细胞piRNA在细胞分化中的功能阐明

基本信息

  • 批准号:
    15J00469
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.47万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2015
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2015-04-24 至 2017-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

piRNAは主に生殖巣において機能すると考えられているが、近年、体細胞においても機能することが示唆されつつある。本研究ではpiRNAを発現する卵巣由来のカイコ培養細胞(BmN4)を脂肪細胞様に分化させ、生殖細胞から体細胞に分化する際のpiRNA動態を捉えるための実験基盤の構築を目的とした。また、BmN4細胞を用いた人工piRNA産生系の確立を試みた。1. piRNAの多くはゲノム上のpiRNAクラスタと呼ばれる領域に由来する。BmN4細胞における脂肪細胞分化誘導時のmRNAおよびpiRNAの変動を調査したところ、piRNAクラスタの一部から発現するmRNAおよびpiRNAは、脂肪細胞分化によって顕著に変化した。カイコ胚子期の発達段階別のpiRNAライブラリとの比較を行った結果、これらのpiRNAクラスタは、胚子の発達に伴っても類似の発現変動を示すことが分かった。この結果は、本研究で用いた誘導系がpiRNAクラスタの発現調節の観点で胚子期の変動を模倣している可能性を示唆している。この結果は平成29年度蚕糸・昆虫機能利用学術講演会において発表した。2. piRNAはping-pong cycleと呼ばれる増幅経路によって増幅すると考えられている。しかし、ping-pong cycleはバイオインフォマティクス解析から想定されたモデルであって、堅固な実験的証明は存在しなかった。本研究では、BmN4細胞を用いて人工的にping-pong piRNAを産生する系を構築し、ping-pong cycleの実証に成功した。さらに、この実験系を利用することによって、piRNA-PIWIタンパク質による認識には17塩基の相補が必要であり、22塩基の相補があれば充分であることを示した。この結果は、RNA誌に発表するとともに、国際学会においても発表を行い、学生優秀発表賞を受賞した。
PiRNA は main に reproductive 巣 に お い て function す る と exam え ら れ て い る が, in recent years, somatic に お い て も function す る こ と が in stopping さ れ つ つ あ る. This study で は piRNA を 発 now す る eggs 巣 origin の カ イ コ cultured cells (BmN4) を fat cells others に differentiation さ せ, reproductive cells か ら somatic cell differentiation す に る interstate の piRNA dynamic を catch え る た め の be 験 base plate の build を purpose と し た. Youdaoplaceholder0, BmN4 cells を were used to produce artificial piRNA lines by た た to establish を test みた. More than 1. PiRNA の く は ゲ ノ ム on の piRNA ク ラ ス タ と shout ば れ る field に origin す る. BmN4 cells に お け る adipocyte differentiation induced の mRNA お よ び piRNA の - move を survey し た と こ ろ, piRNA ク ラ ス タ の a か ら 発 now す る mRNA お よ び piRNA は, adipocyte differentiation に よ っ て 顕 the に variations change し た. カ イ コ stage embryo child の 発 da Duan Jie don't の piRNA ラ イ ブ ラ リ と の is line を っ た results, こ れ ら の piRNA ク ラ ス タ は, embryo の 発 da に with っ て も similar の 発 now - move を shown す こ と が points か っ た. は こ の results, this study で い た induction system が piRNA ク ラ ス タ の 発 now adjust の 観 point で stage embryo child の - dynamic imitation を し て い を る possibility in stopping し て い る. The results of the にお and て academic lecture on the utilization of insect functions in the 29th year of the Heisei era were presented as た. 2. PiRNA は ping - pong cycle と shout ば れ る rights of 経 road に よ っ て rights of す る と exam え ら れ て い る. し か し, ping - pong cycle は バ イ オ イ ン フ ォ マ テ ィ ク ス parsing か ら scenarios さ れ た モ デ ル で あ っ て, strong な be 験 は proof of し な か っ た. This study で は, BmN4 cells を い て artificial に ping - pong piRNA を produce す る を build し, ping - pong cycle の card be に successful し た. さ ら に, こ の be を 験 department use す る こ と に よ っ て, piRNA PIWI タ ン パ ク qualitative に よ る know に は 17 salt base の phase fill が necessary で あ り, 22 salt base の phase が あ れ ば fully で あ る こ と を shown し た. <s:1> the results of <s:1>, RNA journal に publication するとと に に, international society にお て て を publication を, student excellence publication award を award た.

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Proof-of-concept for the “ping-pong” amplification cycle of PIWI-interacting RNAs.
PIWI 相互作用 RNA 的“乒乓”扩增循环的概念验证。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Keisuke Shoji;Yutaka Suzuki;Sumio Sugano;Toru Shimada;and Susumu Katsuma
  • 通讯作者:
    and Susumu Katsuma
Is the expression of sense and antisense transgenes really sufficient for artificial piRNA production?
有义和反义转基因的表达真的足以用于人工 piRNA 的生产吗?
  • DOI:
    10.1016/j.cub.2015.07.001
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    9.2
  • 作者:
    Izumi N;Shoji K;Sakaguchi Y;Honda S;Kirino Y;Suzuki T;Katsuma S;Tomari Y;Keisuke Shoji and Susumu Katsuma
  • 通讯作者:
    Keisuke Shoji and Susumu Katsuma
昆虫遺伝研究室ホームページ
昆虫遗传学实验室主页
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Artificial "ping-pong" cascade of PIWI-interacting RNA in silkworm cells.
Piwi相互作用RNA在蚕细胞中的人工“乒乓”级联。
  • DOI:
    10.1261/rna.058875.116
  • 发表时间:
    2017-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Shoji K;Suzuki Y;Sugano S;Shimada T;Katsuma S
  • 通讯作者:
    Katsuma S
Revealing Nbr functions in pre-piRNA trimming in silkworms by bioinfomatics analysis
通过生物信息学分析揭示 Nbr 在蚕 pre-piRNA 修剪中的功能
  • DOI:
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Keisuke Shoji;Natsuko Izumi;Yukihide Tomari;Susumu Katsuma.
  • 通讯作者:
    Susumu Katsuma.
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

庄司 佳祐其他文献

カイコpiRNAの3′末端形成機構に関するBioinfomatics解析
家蚕piRNA 3′端形成机制的生物信息学分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    庄司 佳祐;泉 奈津子;泊 幸秀
  • 通讯作者:
    泊 幸秀
Iruka directs selective ubiquitination of empty Argonaute for successful miRNA-mediated silencing
Iruka 指导空 Argonaute 选择性泛素化,成功实现 miRNA 介导的沉默
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    小林 穂高;庄司 佳祐;根岸 瑠美;泊 幸秀
  • 通讯作者:
    泊 幸秀
カイコpiRNAの3'末端形成機構に関するBioinformatics解析
家蚕piRNA 3端形成机制的生物信息学分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    庄司 佳祐;泉 奈津子;泊 幸秀
  • 通讯作者:
    泊 幸秀
カイコ培養細胞において持続感染している昆虫マキュラウイルスから産生されるsmall RNAの保持する特徴
持续感染培养蚕细胞的昆虫黄斑病毒产生的小RNA特征
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    庄司 佳祐;泉 奈津子;泊 幸秀;庄司佳祐・泉奈津子・泊幸秀・岩永将司・勝間進
  • 通讯作者:
    庄司佳祐・泉奈津子・泊幸秀・岩永将司・勝間進

庄司 佳祐的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('庄司 佳祐', 18)}}的其他基金

細胞内共生細菌による宿主piRNA 経路操作機構の解明
阐明内共生细菌对宿主piRNA途径的操纵机制
  • 批准号:
    24K01769
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
piRNAセンサーシステムを用いたpiRNAクラスタの成立条件の解明
使用 piRNA 传感器系统阐明 piRNA 簇形成的条件
  • 批准号:
    22K15082
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 1.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
持続感染性RNAウイルスを用いたpiRNAによる非自己認識システムの解明
使用持续感染性 RNA 病毒通过 piRNA 阐明非自我识别系统
  • 批准号:
    17J02408
  • 财政年份:
    2017
  • 资助金额:
    $ 1.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows

相似海外基金

Elucidation of piRNA biogenesis in silkworm germ line BmN4 cells
阐明家蚕种系 BmN4 细胞中 piRNA 的生物合成
  • 批准号:
    15K06948
  • 财政年份:
    2015
  • 资助金额:
    $ 1.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Reconstruction of in vitro piRNA biogenesis using silkworm germ line BmN4 cells
利用家蚕种系 BmN4 细胞重建体外 piRNA 生物发生
  • 批准号:
    25840041
  • 财政年份:
    2013
  • 资助金额:
    $ 1.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了