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自然生息地の植物ウイルス多様性とその成立メカニズム

自然生息地の植物ウイルス多様性とその成立メカニズム
自然生境植物病毒多样性及其建立机制
批准号:
15J00628
负责人:
神谷 麻梨
金额:
$1.22万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2015
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2015-04-24 至 2017-03-31

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项目成果

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該当年度は、前年度のハクサンハタザオにおける既知ウイルスの同定に引き続き、未知ウイルスの探索を試み、得られた結果を論文にまとめ公表した。さらに、接種感染実験系の確立と、野外の複数地点でのRNA-Seqによるウイルス解析を行った。1.新規ウイルスの同定RNA-Seqを用いて既知ウイルスの網羅的同定だけでなく、植物側にも既知ウイルス側の配列にもマップされなかったリード内から、de novo assemblyを用いた新規ウイルスの探索を試みた。これにより、Alphapartitivirusに属する1種の新規パーティティウイルスを発見し、Arabidopsis halleri partitivirus1と命名した。このウイルスは調査対象としたハクサンハタザオ68個体中、82%もの植物個体に感染しており、種子を通じて垂直感染することを明らかにした。ハクサンハタザオにおけるウイルス感染と宿主―ウイルス相互作用の解析結果をまとめた論文を公開した(Kamitani et al. 2016)。2.地域間・宿主間でのウイルスの比較(2,3地点目)上記ハクサンハタザオ以外のアブラナ科植物が複数共存する調査地において、生育する全アブラナ科種を対象にウイルスの検出を行った。調査地によってウイルスの在不在が異なり、またウイルスの感染有無は植物種によって異なった。検出されたウイルスのうち1種は国内未報告のウイルスであったため植物防疫所へ報告を行い、さらに配列の同定と既知の株との比較や、農作物などへの接種実験による感染力・病徴の確認を行った。ウイルスの接種については野生種のハクサンハタザオでの例がなかったが、汁液接種により高い割合で感染させられる系を確立した。
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专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
工藤研究室ホームページ
工藤实验室主页
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
RNA-Seq reveals plant-virus interactions in the natural habitat
RNA-Seq揭示自然栖息地中植物与病毒的相互作用
DOI: --
发表时间: 2016
期刊:
影响因子: --
作者: [Mari Kamitani, Atsushi J. Nagano, Mie N. Honjo, Hiroshi Kudoh]
通讯作者: Hiroshi Kudoh
RNA-Seq を用いた野生植物内ウイルスの探索と多様性
使用 RNA-Seq 搜索野生植物中的病毒并分析其多样性
DOI: --
发表时间: 2015
期刊:
影响因子: --
作者: [神谷麻梨, 永野惇, 本庄三恵, 工藤洋]
通讯作者: 工藤洋
RNA-Seqを用いた自然条件下における植物―ウイルス相互作用の解析
使用 RNA-Seq 分析自然条件下植物-病毒相互作用
DOI: --
发表时间: 2017
期刊:
影响因子: --
作者: [神谷麻梨, 永野惇, 本庄三恵, 工藤洋]
通讯作者: 工藤洋
9
    RCNMV増殖に影響を与える植物側・ウイルス側配列変異の包括的解析
    • 批准号:
      19J01031
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额:
      $2.58万
    • 财政年份:
      2019
    • 负责人:
      神谷 麻梨
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金
    基于RNA-seq技术探究抗菌肽HX-12C对SA皮肤感染的抑制机理
    • 批准号:
      2025JJ70518
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2025
    • 负责人:
      汪美凤
    • 依托单位:
    利用ATAC-seq联合RNA-seq分析TOP2A介导的HCC肿瘤细胞迁移侵 袭的机制研究
    • 批准号:
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2024
    • 负责人:
      柳静
    • 依托单位:
    基于RNA-seq技术对Tau过表达小鼠角膜神经病变的机制研究
    基于比较基因组学和RNA-Seq探讨ClpP抑制剂bohemamines的生物合成机制研究