自然生息地の植物ウイルス多様性とその成立メカニズム

自然生境植物病毒多样性及其建立机制

• 批准号: 15J00628
• 负责人: 神谷 麻梨
• 金额: $ 1.22万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2015
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2015-04-24 至 2017-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15J00628/
• 关键词: 植物ウイルス; RNA-Seq; ウイルス生態学; Arabidopsis halleri; アブラナ科; 重複感染

該当年度は、前年度のハクサンハタザオにおける既知ウイルスの同定に引き続き、未知ウイルスの探索を試み、得られた結果を論文にまとめ公表した。さらに、接種感染実験系の確立と、野外の複数地点でのRNA-Seqによるウイルス解析を行った。１．新規ウイルスの同定RNA-Seqを用いて既知ウイルスの網羅的同定だけでなく、植物側にも既知ウイルス側の配列にもマップされなかったリード内から、de novo assemblyを用いた新規ウイルスの探索を試みた。これにより、Alphapartitivirusに属する1種の新規パーティティウイルスを発見し、Arabidopsis halleri partitivirus1と命名した。このウイルスは調査対象としたハクサンハタザオ68個体中、82％もの植物個体に感染しており、種子を通じて垂直感染することを明らかにした。ハクサンハタザオにおけるウイルス感染と宿主―ウイルス相互作用の解析結果をまとめた論文を公開した（Kamitani et al. 2016）。２．地域間・宿主間でのウイルスの比較（2,3地点目）上記ハクサンハタザオ以外のアブラナ科植物が複数共存する調査地において、生育する全アブラナ科種を対象にウイルスの検出を行った。調査地によってウイルスの在不在が異なり、またウイルスの感染有無は植物種によって異なった。検出されたウイルスのうち１種は国内未報告のウイルスであったため植物防疫所へ報告を行い、さらに配列の同定と既知の株との比較や、農作物などへの接種実験による感染力・病徴の確認を行った。ウイルスの接種については野生種のハクサンハタザオでの例がなかったが、汁液接種により高い割合で感染させられる系を確立した。

The current year and the previous year's のハクサンハタザオにおける are known to be the same as the ウイルスの Same decision続き、Unknown ウイルスのExplorationをtestみ、GetられたRESULTSをthesisにまとめ公报した.さらに, inoculation and infection were established, and RNA-Seq analysis was performed at multiple locations in the wild. 1. New rules and regulations for RNA-Seq are as follows:く、Plant side にもknown ウイルスlateral のmatch array にもマップされなかったリード内から, de Novo assembly is used to explore the new rules and regulations.これにより, Alphapartitivirus に genus する 1 species の newly established パーティティウイ ルスを発见し, Arabidopsis halleri partitivirus 1 と named した. Among the 68 individuals surveyed by the このウイルスは, the としたハクサンハタザオ, 82% were ものThe individual plants are infected, and the seeds are vertically infected.ハクサンハタザオにおけるウイルスInfectionとHost-ウイルスInteractionのanalytical resultsをまとめたpaperをpublicした (Kamitani et al. 2016). 2． Comparison of でのウイルスの between regions and hosts (2 and 3 locations) The above mentioned ハクサンハタザオのアブラナ科 Plant The plural coexistence of things is investigated in the place of investigation, and the birth of children is done in the whole family. Investigate whether there are any different plants in the place where the plant is infected or not, and whether the plant species is infected or not.検出されたウイルスのうち1 species のウイルスであったためPlant Control Station not reported in the country を行い、さらComparison of known strains and comparison of known strains, inoculation of crops, and confirmation of infectivity and disease. Inoculation of wild speciesったが, juice inoculation により高 い incision で infection さ せら れる を Establishment した.

项目成果

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RNA-Seq reveals plant-virus interactions in the natural habitat

RNA-Seq揭示自然栖息地中植物与病毒的相互作用

• 发表时间: 2016
• 作者: Mari Kamitani;Atsushi J. Nagano;Mie N. Honjo;Hiroshi Kudoh
• 通讯作者: Hiroshi Kudoh

RNA-Seq を用いた野生植物内ウイルスの探索と多様性

使用 RNA-Seq 搜索野生植物中的病毒并分析其多样性

• 发表时间: 2015
• 作者: 神谷麻梨;永野惇;本庄三恵;工藤洋
• 通讯作者: 工藤洋

RNA-Seqを用いた自然条件下における植物―ウイルス相互作用の解析

使用 RNA-Seq 分析自然条件下植物-病毒相互作用

• 发表时间: 2017
• 作者: 神谷麻梨;永野惇;本庄三恵;工藤洋
• 通讯作者: 工藤洋

野生植物におけるウイルス感染の”かたち”

病毒感染野生植物的“形态”

• 发表时间: 2015
• 作者: 神谷麻梨;永野惇;本庄三恵;工藤洋
• 通讯作者: 工藤洋