RCNMV増殖に影響を与える植物側・ウイルス側配列変異の包括的解析
RCNMV増殖に影響を与える植物側・ウイルス側配列変異の包括的解析
批准号:
19J01031
负责人:
神谷 麻梨
金额:
$2.58万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2019
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2019-04-25 至 2022-03-31
中文摘要
今年度は、前年度の結果を受け、シロイヌナズナの個体レベルに加えてプロトプラストレベルでのウイルス接種実験法の確立と、接種実験を行った。接種に用いるための蛍光タンパク質を付与したウイルスRNA集団、標的遺伝子に変異を付与したウイルスRNA集団は、それぞれの感染性クローンからのin Vitro転写により作成した。接種対象のプロトプラストは、前年度の検討を踏まえ、剃刀を用いて葉を裁断する方法(Chopping法)により、大量に回収できる状況になった。接種はポリエチレングリコールを用いて行い、接種のための諸条件(接種手順、接種源のウイルスRNA量、接種後の培養条件等)の検討を行った。検討開始当初は、プロトプラスト生存率は高いものの接種効率が低い問題が生じたため、専門家のアドバイスを受け条件検討を行った。検討の結果、PEG溶液や接種源RNAとの混合を穏やかに十分回数行うこと、接種源の量を十分にとることが感染成立や感染率の上昇に重要であることが明らかになった。これにより、接種を行ったプロトプラストが、接種後48時間後も高い生存率を示す条件が得られたため、その後の実験に用いることにした。遺伝子発現解析の結果、ウイルス(RCNMV)の増殖が最も盛んである17℃において、植物の複数の遺伝子についてウイルス感染による発現変動が示唆された。これらの遺伝子は先行研究のタンパク質の解析からもウイルス増殖との関連が示唆されているものであり、今後、RNAレベルとタンパク質レベルでの応答の比較研究が期待される。
英文摘要
今年度は、前年度の結果を受け、シロイヌナズナの個体レベルに加えてプロトプラストレベルでのウイルス接種実験法の確立と、接種実験を行った。接種に用いるための蛍光タンパク質を付与したウイルスRNA集団、標的遺伝子に変異を付与したウイルスRNA集団は、それぞれの感染性クローンからのin Vitro転写により作成した。接種対象のプロトプラストは、前年度の検討を踏まえ、剃刀を用いて葉を裁断する方法(Chopping法)により、大量に回収できる状況になった。接種はポリエチレングリコールを用いて行い、接種のための諸条件(接種手順、接種源のウイルスRNA量、接種後の培養条件等)の検討を行った。検討開始当初は、プロトプラスト生存率は高いものの接種効率が低い問題が生じたため、専門家のアドバイスを受け条件検討を行った。検討の結果、PEG溶液や接種源RNAとの混合を穏やかに十分回数行うこと、接種源の量を十分にとることが感染成立や感染率の上昇に重要であることが明らかになった。これにより、接種を行ったプロトプラストが、接種後48時間後も高い生存率を示す条件が得られたため、その後の実験に用いることにした。遺伝子発現解析の結果、ウイルス(RCNMV)の増殖が最も盛んである17℃において、植物の複数の遺伝子についてウイルス感染による発現変動が示唆された。これらの遺伝子は先行研究のタンパク質の解析からもウイルス増殖との関連が示唆されているものであり、今後、RNAレベルとタンパク質レベルでの応答の比較研究が期待される。
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RNA-Seqを用いた野生植物におけるウイルス感染の網羅的探索
使用 RNA-Seq 全面搜索野生植物中的病毒感染
DOI:
--
发表时间:
2019
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kamitani Mari, Kashima Makoto, Tezuka Ayumi, Nagano Atsushi J., 神谷 麻梨, 神谷 麻梨, 神谷 麻梨, 神谷麻梨, 神谷麻梨]
通讯作者:
神谷麻梨
RNAから紐解くウイルスの生態
RNA揭示病毒生态学
DOI:
--
发表时间:
2020
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kamitani Mari, Kashima Makoto, Tezuka Ayumi, Nagano Atsushi J., 神谷 麻梨, 神谷 麻梨]
通讯作者:
神谷 麻梨
野外の植物におけるウイルス叢探索と宿主-ウイルス相互作用解析
田间植物病毒区系探索和宿主-病毒相互作用分析
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kamitani Mari, Kashima Makoto, Tezuka Ayumi, Nagano Atsushi J., 神谷 麻梨]
通讯作者:
神谷 麻梨
RNA-Seqで観る野生植物とウイルスの相互作用
使用 RNA-Seq 观察野生植物和病毒之间的相互作用
DOI:
--
发表时间:
2020
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kamitani Mari, Kashima Makoto, Tezuka Ayumi, Nagano Atsushi J., 神谷 麻梨, 神谷 麻梨, 神谷 麻梨]
通讯作者:
神谷 麻梨
DOI:
10.1101/2020.05.10.086611
发表时间:
2020-05
期刊:
bioRxiv
影响因子:
--
作者:
[Nobutoshi Yamaguchi;Satoshi Matsubara;Kaori Yoshimizu;Motohide Seki;K. Hamada;Mari Kamitani;Y. Kurita;Soichi Inagaki;Takamasa Suzuki;Eng-Seng Gan;T. To;T. Kakutani;A. Nagano;A. Satake;Toshiro Ito]
通讯作者:
Nobutoshi Yamaguchi;Satoshi Matsubara;Kaori Yoshimizu;Motohide Seki;K. Hamada;Mari Kamitani;Y. Kurita;Soichi Inagaki;Takamasa Suzuki;Eng-Seng Gan;T. To;T. Kakutani;A. Nagano;A. Satake;Toshiro Ito
共 10 条
自然生息地の植物ウイルス多様性とその成立メカニズム
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批准号:15J00628
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.22万
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财政年份:2015
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负责人:神谷 麻梨
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依托单位:
海外基金