ＲＣＮＭＶ増殖に影響を与える植物側・ウイルス側配列変異の包括的解析

影响RCNMV增殖的植物和病毒序列突变综合分析

• 批准号: 19J01031
• 负责人: 神谷 麻梨
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: Ryukoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2019
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2019-04-25 至 2022-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19J01031/
• 关键词: RCNMV; ウイルス; プロトプラスト; シロイヌナズナ; RNA-Seq; 植物・ウイルス間相互作用; disorder領域

今年度は、前年度の結果を受け、シロイヌナズナの個体レベルに加えてプロトプラストレベルでのウイルス接種実験法の確立と、接種実験を行った。接種に用いるための蛍光タンパク質を付与したウイルスRNA集団、標的遺伝子に変異を付与したウイルスRNA集団は、それぞれの感染性クローンからのin Vitro転写により作成した。接種対象のプロトプラストは、前年度の検討を踏まえ、剃刀を用いて葉を裁断する方法(Chopping法)により、大量に回収できる状況になった。接種はポリエチレングリコールを用いて行い、接種のための諸条件（接種手順、接種源のウイルスRNA量、接種後の培養条件等）の検討を行った。検討開始当初は、プロトプラスト生存率は高いものの接種効率が低い問題が生じたため、専門家のアドバイスを受け条件検討を行った。検討の結果、PEG溶液や接種源RNAとの混合を穏やかに十分回数行うこと、接種源の量を十分にとることが感染成立や感染率の上昇に重要であることが明らかになった。これにより、接種を行ったプロトプラストが、接種後48時間後も高い生存率を示す条件が得られたため、その後の実験に用いることにした。遺伝子発現解析の結果、ウイルス（RCNMV）の増殖が最も盛んである17℃において、植物の複数の遺伝子についてウイルス感染による発現変動が示唆された。これらの遺伝子は先行研究のタンパク質の解析からもウイルス増殖との関連が示唆されているものであり、今後、RNAレベルとタンパク質レベルでの応答の比較研究が期待される。

This year, the results of the previous year have been reviewed, and the results of the previous year have been reviewed. The virus was isolated from the genome of the virus and isolated from the genome of the virus. The method for determining the number of inoculation cases (Chopping method) and the number of inoculation cases in the previous year The inoculation conditions (inoculation sequence, inoculation source RNA amount, culture conditions after inoculation, etc.) were discussed. At the beginning of the study, the survival rate of the virus was high, and the vaccination rate was low. The results of the study showed that PEG solution and RNA of inoculation source were mixed in ten lines, the amount of inoculation source was very high, and the infection rate was increased. The results showed that the survival rate was higher 48 hours after inoculation. The results of genetic discovery analysis show that the proliferation ofルス(RCNMV) is at its peak at 17℃, and the occurrence ofルスinfection in multiple genetic viruses of plants is evident. In the future, comparative research on RNA synthesis and its quality is expected.

项目成果

RNA-Seqを用いた野生植物におけるウイルス感染の網羅的探索

使用 RNA-Seq 全面搜索野生植物中的病毒感染

• 发表时间: 2019
• 作者: Kamitani Mari;Kashima Makoto;Tezuka Ayumi;Nagano Atsushi J.;神谷 麻梨;神谷 麻梨;神谷 麻梨;神谷麻梨;神谷麻梨
• 通讯作者: 神谷麻梨

RNAから紐解くウイルスの生態

RNA揭示病毒生态学

• 发表时间: 2020
• 作者: Kamitani Mari;Kashima Makoto;Tezuka Ayumi;Nagano Atsushi J.;神谷 麻梨;神谷 麻梨
• 通讯作者: 神谷 麻梨

野外の植物におけるウイルス叢探索と宿主－ウイルス相互作用解析

田间植物病毒区系探索和宿主-病毒相互作用分析

• 发表时间: 2021
• 作者: Kamitani Mari;Kashima Makoto;Tezuka Ayumi;Nagano Atsushi J.;神谷 麻梨
• 通讯作者: 神谷 麻梨

RNA-Seqで観る野生植物とウイルスの相互作用

使用 RNA-Seq 观察野生植物和病毒之间的相互作用

• 发表时间: 2020
• 作者: Kamitani Mari;Kashima Makoto;Tezuka Ayumi;Nagano Atsushi J.;神谷 麻梨;神谷 麻梨;神谷 麻梨
• 通讯作者: 神谷 麻梨

Removal of repressive histone marks creates epigenetic memory of recurring heat in Arabidopsis

• DOI: 10.1101/2020.05.10.086611
• 发表时间: 2020-05
• 期刊: bioRxiv
• 作者: Nobutoshi Yamaguchi;Satoshi Matsubara;Kaori Yoshimizu;Motohide Seki;K. Hamada;Mari Kamitani;Y. Kurita;Soichi Inagaki;Takamasa Suzuki;Eng-Seng Gan;T. To;T. Kakutani;A. Nagano;A. Satake;Toshiro Ito