複雑反応経路網に適用し得る速度解析法の開発
複雑反応経路網に適用し得る速度解析法の開発
批准号:
15J02125
负责人:
住谷 陽輔
金额:
$1.79万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2015
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2015-04-24 至 2018-03-31
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英文摘要
初年度に開発した速度定数行列縮約(RCMC)法の応用範囲を拡げた。RCMC法では、短時間で行き来する安定構造同士を一つにまとめ、安定構造の重み付き総和として得られる超状態間のオーバーオールの速度定数を計算できる。前年度はRCMC法を反応経路の自動探索を行う人工力誘起反応(AFIR)法と組み合わせたプログラムを作成したので、当該年度で本手法の更なる開発と応用を行った。本手法では、RCMC法による速度解析を、反応経路自動探索のナビゲーションシステムとして利用する。これにより、速度論に基づいて反応経路の探索領域を制限し、反応物から指定した温度・反応時間で到達し得る反応経路を効率的に探索できる。本手法をPasserini反応に適用した。本反応は、多成分の反応基質が相互作用する複雑な反応だが、起こり得る反応機構を得ることができた。本手法の探索では、分子の結合情報や反応パターンなどの情報は使用せず、完全に系統的である。現在、プログラムのチューニングを終え、論文の投稿準備を進めている。また、さらに計算を高速化する手順を考案し、論文で報告した。この方法では、2つの手順から反応経路ネットワークを作成する。具体的には、(1) 最初の探索ではAFIR法で近似的なlocally updated plane(LUP)経路を求める。(2) 得られたLUP経路ネットワークからボトルネックとして振る舞う経路をRCMC法で抽出し、その経路のみ遷移状態(TS)構造最適化を行い、固有反応座標(IRC)経路を求める。これにより、速度解析の結果にほぼ影響しない経路のTS構造最適化とIRC計算を削減できる。本手順は、Cu(111)表面上のH2Oの反応に適用した。これにより、ボトルネックであった結合組み替えの過程をIRC経路として、その他の高速で進行する過程をLUP経路とした反応経路ネットワークを得ることができた。
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Kinetic analysis of the reaction path network for C6H6
C6H6 反应路径网络的动力学分析
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[住谷陽輔, 前田理, 武次徹也]
通讯作者:
武次徹也
Global Reaction Route Mapping for Surface Adsorbed Molecules: A Case Study for H2O on Cu(111) Surface
表面吸附分子的整体反应路线图谱:以 Cu(111) 表面上的 H2O 为例
DOI:
10.1246/cl.171194
发表时间:
2018
期刊:
Chemistry Letters
影响因子:
1.6
作者:
[S. Maeda, K. Sugiyama, Y. Sumiya, M. Takagi, K. Saita]
通讯作者:
K. Saita
Kinetic analysis for complex reaction networks: Application to organic reactions
复杂反应网络的动力学分析:在有机反应中的应用
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[住谷陽輔, 前田理, 武次徹也]
通讯作者:
武次徹也
Kinetic Analysis for Complex Reaction Networks: Importance of Conformational Entropy
复杂反应网络的动力学分析:构象熵的重要性
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[住谷陽輔, 武次徹也, 前田理]
通讯作者:
前田理
速度論に基づく複雑反応経路網の解析と自動探索との連携
基于动力学和自动搜索协作的复杂反应路径网络分析
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[住谷陽輔, 前田理, 武次徹也]
通讯作者:
武次徹也
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