超球面アルゴリズムによる化学反応経路自動探索計算法の開発
超球面アルゴリズムによる化学反応経路自動探索計算法の開発
批准号:
17655001
负责人:
大野 公一
金额:
$2.05万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份:
2005
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2005 至 2006
中文摘要
分子やクラスターの平衡構造(EQ)は、ポテンシャルエネルギー曲面(PES)上のエネルギー極小点に相当する。EQ同士(異性体同士)は、遷移状態を経由する反応経路で結ばれており、PES上の一次鞍点である遷移状態構造(TS)を探索することによって、化学反応を解析することができる。従って、EQとTSの自動探索法の開発は、分子構造と化学反応の理論解析・理論予測において非常に重要である。しかし、PESは、分子の構造変数と同数の次元を持つ多次元関数であり、PES全体をしらみつぶしに調べようとすると膨大な計算時間がかかってしまう。EQとTSを系統的に探すには、PES上の反応経路を、EQからTSへ、TSから別のEQへと辿り、次々と芋づる式に探索するのが、最も効率が良いと考えられる。しかし、EQからTSへと反応経路を辿ってPESを上る方法が存在しなかったため、EQとTSの系統的な自動探索には膨大な計算量が必要であった。本研究では、化学反応の量子原理を発見し、反応経路に沿ってPESを上ることのできる方法の開発に成功した。これにより、EQとTSの系統的な自動探索が有限の計算時間で行えるようになった。前年度は、単純な有機分子に対応する化学組成のPESへ応用してきたが、今年度は、金属原子の導入によるPESの形状の変化を調べるために、アルカリ金属原子や貴金属原子を含む有機金属化合物のPESへの応用を行った。その結果、金属原子の導入によって、様々な反応経路の活性化障壁が大きく減少し、PESの形状が大きく変化することが分かった。また、キラリティーを持つ最小のアミノ酸分子であるアラニン分子に応用し、D体からL体またはL体からD体への熱変換反応経路を4種類見出すことに成功した。
英文摘要
分子やクラスターの平衡構造(EQ)は、ポテンシャルエネルギー曲面(PES)上のエネルギー極小点に相当する。EQ同士(異性体同士)は、遷移状態を経由する反応経路で結ばれており、PES上の一次鞍点である遷移状態構造(TS)を探索することによって、化学反応を解析することができる。従って、EQとTSの自動探索法の開発は、分子構造と化学反応の理論解析・理論予測において非常に重要である。しかし、PESは、分子の構造変数と同数の次元を持つ多次元関数であり、PES全体をしらみつぶしに調べようとすると膨大な計算時間がかかってしまう。EQとTSを系統的に探すには、PES上の反応経路を、EQからTSへ、TSから別のEQへと辿り、次々と芋づる式に探索するのが、最も効率が良いと考えられる。しかし、EQからTSへと反応経路を辿ってPESを上る方法が存在しなかったため、EQとTSの系統的な自動探索には膨大な計算量が必要であった。本研究では、化学反応の量子原理を発見し、反応経路に沿ってPESを上ることのできる方法の開発に成功した。これにより、EQとTSの系統的な自動探索が有限の計算時間で行えるようになった。前年度は、単純な有機分子に対応する化学組成のPESへ応用してきたが、今年度は、金属原子の導入によるPESの形状の変化を調べるために、アルカリ金属原子や貴金属原子を含む有機金属化合物のPESへの応用を行った。その結果、金属原子の導入によって、様々な反応経路の活性化障壁が大きく減少し、PESの形状が大きく変化することが分かった。また、キラリティーを持つ最小のアミノ酸分子であるアラニン分子に応用し、D体からL体またはL体からD体への熱変換反応経路を4種類見出すことに成功した。
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Global Analysis of Reaction Pathways on the Potential Energy Surface of Cyanoacetylene by the Scaled Hypersphere Search Method
尺度超球面搜索法全局分析氰乙炔势能面上的反应路径
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
Chemical Physics Letters 418
影响因子:
--
作者:
[X.Yang, et al.]
通讯作者:
et al.
D-L conversion Pathways between Optical Isomers of Alanine : Applications of the Scaled Hypersphere Search Method to Exploring Unknown Reaction Routes in a Chiral System
丙氨酸光学异构体之间的 D-L 转换路径:缩放超球面搜索方法在探索手性系统中未知反应路线中的应用
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
Chemistry Letters 35
影响因子:
--
作者:
[K.Ohno, et al.]
通讯作者:
et al.
Insight into Global Reaction Mechanism of [C_2, H_4, O] System from ab initio Calculations by the Scaled Hypersphere Search Method
尺度超球面搜索法从头计算洞察[C_2,H_4,O]体系整体反应机理
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
Journal of Physical Chemistry A 111(印刷中)
影响因子:
--
作者:
[X.Yang, et al.]
通讯作者:
et al.
Generation Mechanisms of Amino Acids in the Interstellar Space via Reactions between Closed-Shell Species : Significance of Higher Energy Isomers in Molecular Evolution
星际空间中闭壳物种反应产生氨基酸的机制:高能异构体在分子进化中的意义
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
Astrophysical Journal 640
影响因子:
--
作者:
[S.Maeda, et al.]
通讯作者:
et al.
Conversion Pathways between a Fullerene and a Ring among C_<20> Clusters by a Sphere Contracting Walk Method : Remarkable Difference in Local Potential Energy Landscapes around the Fullerene and the Ring
通过球收缩行走方法在 C_<20> 团簇中富勒烯和环之间的转换路径:富勒烯和环周围局部势能景观的显着差异
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
The Journal of Chemical Physics 124
影响因子:
--
作者:
[S.Maeda, et al.]
通讯作者:
et al.
共 8 条
非調和ポテンシャルの効率的構築アルゴリズムに基づく新しい量子動力学法の開発
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批准号:21655002
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$2.05万
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财政年份:2009
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负责人:大野 公一
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依托单位:
化学反応経路の全貌解析と分子進化過程の究明
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批准号:06F06063
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2006
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负责人:大野 公一
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依托单位:
ポテンシャル表面ダイナミクスに基づく反応経路探索
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批准号:06F06338
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2006
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负责人:大野 公一
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依托单位:
速度分解励起原子衝突イオン化電子分光法と走査プローブ顕微鏡による表面反応ダイナミクスの解明
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批准号:04F04384
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2004
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负责人:大野 公一
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依托单位:
ポテンシャル曲面上の極限的反応経路図の完全探索とその応用
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批准号:04F04118
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2004
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负责人:大野 公一
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依托单位:
電子分光及び量子化学による生体分子の立体ダイナミクスに関する研究
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批准号:00F00111
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.77万
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财政年份:2000
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负责人:大野 公一
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依托单位:
金属を含む原子・分子小集団の赤外吸収線幅と電荷ゆらぎとの相関
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批准号:10874078
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$0.38万
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财政年份:1998
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负责人:大野 公一
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依托单位:
クラスターを含むエネルギー移動と一電子酸化還元反応のダイナミックス
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批准号:63606503
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.83万
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财政年份:1987
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负责人:大野 公一
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依托单位:
クラスターを含むエネルギー移動と-電子酸化還元反応のダイナミックス
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批准号:62606503
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1987
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负责人:大野 公一
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依托单位:
電子分光法による電子移動反応機構の解析
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批准号:61470014
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (B)
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资助金额:$4.16万
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财政年份:1986
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负责人:大野 公一
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依托单位:
ペニング電子分光法による分子軌道の立体化学
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批准号:58470011
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (B)
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资助金额:$5.82万
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财政年份:1983
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负责人:大野 公一
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依托单位:
真空紫外回転偏光子分光装置による振電現象の研究
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批准号:X00210----574183
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1980
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负责人:大野 公一
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依托单位:
芳香族化合物の振動状態及び電子状態に関する総合的研究
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批准号:X00095----364160
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (D)
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资助金额:$0.3万
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财政年份:1978
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负责人:大野 公一
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依托单位:
有機分子の電子スペクトルの偏光特性と溶媒効果
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批准号:X00210----974135
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.17万
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财政年份:1974
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负责人:大野 公一
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依托单位:
海外基金