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交雑によるゲノム不和合回避と適応進化の分子機構：アゴハゼの交雑集団をモデルとして

通过杂交避免基因组不相容性和适应性进化的分子机制：以虾虎鱼杂交种群为模型

基本信息

批准号：
15J06937
负责人：
平瀬祥太朗
金额：
$ 1万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2015
资助国家：
日本
起止时间：
2015-04-24 至 2016-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

日本列島沿岸に生息するハゼ科魚類のアゴハゼには、更新世の日本海の隔離で生じた2つの遺伝的グループ（太平洋グループと日本海グループ）が存在し、分布境界にあたる岩手県田老周辺で交雑帯が形成されている。しかし、交雑帯を介したグループ間の遺伝子浸透はあまり進行しておらず、また、F2以降の交雑個体のみで構成された集団が田老に存在することが8座のマイクロサテライトDNAとミトコンドリアDNAによる解析で示唆されている。本研究は、アゴハゼにおけるこの第3の遺伝的グループの成立の背景にある遺伝機構を明示することを目的としている。本年度は、太平洋グループの2集団と日本海グループの2集団、田老周辺の6集団の計209個体のRAD-seqを行い、交雑帯の集団構造ならびに田老の交雑集団のゲノム構成をゲノムワイド多型情報に基づいて調査した。多個体で共有された1163SNP座を用いてクラスタリング解析を行った結果、田老の交雑個体が約50%の混合比で各グループ由来のゲノムを有していることが示唆された。また、クラスター数を3と仮定した場合、田老の交雑集団は第3のクラスターに帰属され、このクラスターから各グループへの一方向的な遺伝子流動が検出された。田老の交雑集団に2グループのゲノムがランダムに浸透しているかどうかを調べたところ、約60%のSNP座でランダムではない浸透が検出された。RAD-seq解析の結果は、2グループの交雑によって新たなゲノム構成を有するグループが生まれたことを示唆している。

The Japanese Islands coastal fish species are isolated from the Pleistocene Sea of Japan, and the Pacific Ocean fish species are isolated from the Sea of Japan. The analysis of DNA in the 8-site DNA cluster was carried out in the presence of the F2-site DNA and the F2-site DNA. This study aims to clarify the background of the establishment of the third generation of genetic resources. This year, the Pacific Ocean Group 2, Japan Sea Group 2, Japan Sea Group 6, Japan Sea Group 2, Japan Sea Group 6, Japan Sea Group 7, Japan Sea Group 7, Japan Sea Group 8, Japan Sea Group 8, Japan A total of 1163SNP loci were identified in the population. The results showed that the population was approximately 50% mixed with each other. When the number of traffic lights is 3, the traffic lights of the traffic lights. In the past, about 60% of the SNP loci were infiltrated into the genome of the two groups. RAD-seq analysis results in the formation of a new set of clusters and clusters.