メチル化DNA選択的結合TALEタンパク質の創製とエピジェネティクス研究への展開
メチル化DNA選択的結合TALEタンパク質の創製とエピジェネティクス研究への展開
批准号:
15J09770
负责人:
辻 将吾
金额:
$1.22万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2015
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2015-04-24 至 2017-03-31
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英文摘要
今年度は、昨年度得られた知見を元により5mC選択性の高い変異体TALEユニットを獲得するべく、4つのアミノ酸ランダム化部位のうちC末端側2つのアミノ酸をアラニンに固定したライブラリーを作製しスクリーニングを行った。その結果、複数の候補変異体が得られた。それらの塩基選択性をルシフェラーゼアッセイにより個別に評価したところ、5mC選択性が高いユニットが多く含まれていた。その中でも最も活性が高かったユニットを最終的な人工ユニットとして採用した。この人工ユニットを用いたTALEの結合活性を精製タンパク質を用いたゲルシフトアッセイによって評価した。その結果、人工ユニットを含むTALEは、C配列に比べて、5mC配列に対して2倍程度高い結合親和性を示すことがわかった。創製した人工ユニットが内在ゲノムDNAのメチル化を識別できるかを検討するため、人工ユニットを用いて細胞内ゲノムの5mC部位を標的としたTALEを作製した。このTALEに転写活性化ドメインを融合することで人工転写因子を作製し、標的内在遺伝子のメチル化状態依存的な活性化を試みた。その結果、TALE標的部位が非メチル化状態の細胞群に比べて、メチル化状態である細胞群において有意に転写を活性化したことから、人工ユニットが細胞内ゲノムを標的とした場合にも機能することがわかった。今後、人工ユニットを用いたTALEの5mC機能解析への応用が期待される。
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TALEタンパク質の分子進化
TALE蛋白的分子进化
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[辻将吾, 今西未来, 二木史朗]
通讯作者:
二木史朗
分子進化法を用いたメチル化シトシン選択的結合TALEの創製
利用分子进化方法创建选择性结合甲基化胞嘧啶的TALE
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[辻将吾, 今西未来, 二木史朗]
通讯作者:
二木史朗
メチル化シトシン認識 TALE タンパク質の創製
创建识别甲基化胞嘧啶的 TALE 蛋白
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[辻将吾, 二木史朗, 今西未来]
通讯作者:
今西未来
TALEタンパク質を利用した細胞内メチル化シトシン認識ツールの創製
使用 TALE 蛋白创建细胞内甲基化胞嘧啶识别工具
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[辻将吾, 二木史朗, 今西未来]
通讯作者:
今西未来
Creating a TALE protein with unbiased 5’-T binding ability
创建具有无偏 5-T 结合能力的 TALE 蛋白
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Shogo Tsuji, Shiroh Futaki, Miki Imanishi]
通讯作者:
Miki Imanishi
共 9 条
脳内タンパク質のリン酸化に着目した、加齢で睡眠の質が低下する機序の解明
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批准号:22K17848
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项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2022
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负责人:辻 将吾
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依托单位:
海外基金