Mutationsdynamik nicht-kodierender Genomabschnitte und ihr Potential für die Rekonstruktion der Evolution eudikotyler Angiospermen

非编码基因组部分的突变动态及其重建真双子叶被子植物进化的潜力

• 批准号: 5439275
• 负责人: Professor Dr. Thomas Borsch
• 金额: --
• 依托单位: Botanischer Garten und Botanisches Museum (BGBM)
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2003-12-31 至 2008-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5439275?language=en
• 关键词: Mutationsdynamik; nicht; kodierender; Genomabschnitte; und

Durch die vermehrte Verwendung von phylogenetischen Hypothesen bei biologischen Fragestellungen kommt es zunehmend auf die Zuverlässigkeit von Stammbäumen an (Auflösung, statistische Absicherung). Eigene Vorarbeiten legen nahe, dass nicht-kodierende DNA (Spacer und Introns) im Vergleich zu Genen bei Angiospermen besonders effektive phylogenetische Marker darstellen. Bisher wurden Spacer und Introns hauptsächlich auf Gattungsebene angewandt. Am Beispiel der Eudikotylen, die 75% der Blütenpflanzen-Diversität enthalten und deren Evolution in wesentlichen Punkten noch unverstanden ist, soll die Mutationsdynamik ausgewählter Genomabschnitte untersucht werden. Es wird vermutet, dass die Qualität des phylogenetischen Signals bedingt durch Struktur und selektive Zwänge von Gruppe II-Introns über Gruppe I-Introns zu Spacern zunimmt. Somit ist der Homoplasiegehalt auch durch Struktur und Funktion bedingt. Insbesondere die Introns erlauben dabei durch ihre leicht zu ermittelnde Sekundärstruktur den strukturellen Einfluss auf Mutationen zu verstehen. Zu erwarten sind (1) Fortschritte im Verständnis der Evolution der Eudikotylen, (2) Kausale Erklärungen für unterschiedliches Signal und damit verbunden unterschiedliche Effektivität verschiedener Genomabschnitte für phylogenetische Analysen, und (3) Ableitung optimaler molekularer Marker für bestimmte Fragestellungen.

在生物学片段分析中，遗传学假说的正确性取决于Stammbäumen和（Auflösung，statisticche Absicherung）的Zuverlässigkeit。传统上，被子植物基因组中的非互补DNA（间隔区和内含子）是有效的遗传标记。Bisher将Spacer和Introns放在Gattungsebene angewandt上。在Eudikotylen中，75%的Blütenpflanzen-Diversität不确定性和在我们的观点中的进化是不确定的，因此突变动力学也是韦尔登不确定的。因此，通过结构和选择性地从第二内含子组中选择第一内含子组来获得遗传学信号的质量是非常重要的。有些同性恋也是通过结构和功能来实现的。内含子的缺失是由于其结构对突变的影响。Zu erwarten sind（1）Fortschritte im Verständnis der Evolution der Eudikotylen，（2）Kausale Erklärungen für unterschedliches Signal und damit verbunden unterschedliche Effektivität verbedener Genomabschnitte für Genetische Analysen，und（3）Ableitung optimaler molekularer Marker für bestimmte Fragestellungen.