Signal Transduction Process of G-Protein Coupled Receptor (GPCR) Studied by Molecular Dynamics Simulation

分子动力学模拟研究G蛋白偶联受体(GPCR)的信号转导过程

• 批准号: 16H06164
• 负责人: HARADA Ryuhei
• 金额: $ 13.15万
• 依托单位: University of Tsukuba
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
• 财政年份: 2016
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2016-04-01 至 2019-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16H06164/
• 关键词: Gタンパク質共役受容体; 分子動力学シミュレーション; タンパク質の構造探索; 生物物理学

项目成果

How Does the Number of Initial Structures Affect the Conformational Sampling Efficiency and Quality in Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics (PaCS-MD)?

• DOI: 10.1246/cl.170207
• 发表时间: 2017-03
• 期刊: Chemistry Letters
• 影响因子: 1.6
• 作者: R. Harada;Y. Shigeta

カスケード型並列分子動力学シミュレーションとマルコフ状態モデルを併用したタンパク質の自由エネルギー計算

使用级联并行分子动力学模拟和马尔可夫状态模型计算蛋白质自由能

• 发表时间: 2018
• 作者: 原田隆平;重田育照
• 通讯作者: 重田育照

On-the-Fly Specifications of Reaction Coordinates in Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics Accelerate Conformational Transitions of Proteins

• DOI: 10.1021/acs.jctc.8b00264
• 发表时间: 2018-06-01
• 期刊: JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION
• 影响因子: 5.5
• 作者: Harada, Ryuhei;Shigeta, Asuteru
• 通讯作者: Shigeta, Asuteru

分子混雑のシミュレーション研究とカスケード選択型分子動力学シミュレーションの開発 (日本物理学会 第13回若手奨励賞 -領域12- 受賞記念講演)

分子拥挤的模拟研究和级联选择分子动力学模拟的发展（日本物理学会第13届青年鼓励奖-第12区-纪念演讲）

• 发表时间: 2019
• 作者: R. Harada;T. Nakamura;Y. Shigeta;原田隆平
• 通讯作者: 原田隆平

生体分子シミュレーションによる機能解析と計算生体分子医科学への展開

使用生物分子模拟进行功能分析以及计算生物分子医学的发展

• 发表时间: 2018
• 作者: 原田隆平