植物のバイオマス増大をもたらすmRNA転写後調節の分子機構
植物のバイオマス増大をもたらすmRNA転写後調節の分子機構
批准号:
16J02378
负责人:
荒江 星拓
金额:
$1.79万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2016
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2016-04-22 至 2019-03-31
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英文摘要
mRNAの3’末端に存在するポリA鎖は分解からの保護に重要であり,また近年ではポリA鎖長と翻訳効率の間に正の相関がみられることが報告されている。このことから,ポリA鎖長制御はmRNA分解と翻訳制御という二つの転写後制御における重要なステップであると考えられる。真核生物に広く保存されたポリA鎖分解酵素CCR4は複数のタンパク質とCCR4-NOT複合体を形成し機能する。シロイヌナズナにおける2つのCCR4オルソログ,AtCCR4aとAtCCR4bの二重変異株(atccr4変異株)ではエンドサイクルの亢進によってバイオマスの増大を示すが,その原因となる標的mRNAは未だ明らかでない。本研究ではatccr4変異株が示すバイオマス増大の原因となる標的mRNAと,その認識に関わるRNA結合タンパク質を明らかにすることを目的としている。本年度は,AtCCR4と相互作用するRNA結合タンパク質APUM2とAtCCR4a/bが,細胞質と細胞質中の顆粒状構造において相互作用することを明らかにした。mRNA分解や翻訳抑制に関わる因子の多くは細胞質中の顆粒状構造に局在することが知られており,この結果はAPUM2がAtCCR4を介した転写後制御に関与することを示唆する。この結果はAtCCR4-NOT複合体の相互作用解析結果と併せてPlant and Cell Physiology誌に投稿した。また,野生型株に比べてatccr4変異株のバイオマスが増大し,かつエンドサイクルが亢進している条件で,Ribo-seqおよびRNA-seqによる網羅的なmRNA翻訳量とmRNA蓄積量の測定を行なった。今後このデータを元に,エンドサイクルの制御に関わる遺伝子で,atccr4変異株で野生型株に比べ翻訳効率が上昇しているmRNAに着目することで,バイオマス増大の原因となる標的mRNAを絞り込めることが期待される。
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シロイヌナズナCCR4-NOT複合体を構成する脱アデニル化酵素とその標的認識に関わるRNA結合タンパク質の同定
鉴定构成拟南芥 CCR4-NOT 复合物的去腺苷酸酶和参与靶标识别的 RNA 结合蛋白
DOI:
--
发表时间:
2017
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Toshihiro Arae, Riko Imahori, Yuya Suzuki, Yukako Chiba, 荒江星拓,森田琴音,鈴木悠也,千葉由佳子, 荒江星拓,鈴木悠也,千葉由佳子, 荒江星拓,鈴木悠也,千葉由佳子]
通讯作者:
荒江星拓,鈴木悠也,千葉由佳子
Multiple deadenylases form a large AtCCR4-NOT complex in Arabidopsis
拟南芥中多个去腺苷酸酶形成大型 AtCCR4-NOT 复合物
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Arae T., Suzuki Y., Chiba Y.]
通讯作者:
Chiba Y.
Identification of Arabidopsis CCR4-NOT complexes with variable combinations of deadenylase subunits
具有不同去腺苷酶亚基组合的拟南芥 CCR4-NOT 复合物的鉴定
DOI:
--
发表时间:
2019
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Toshihiro Arae, Riko Imahori, Yuya Suzuki, Yukako Chiba]
通讯作者:
Yukako Chiba
DOI:
10.1093/pcp/pcx059
发表时间:
2017-06-01
期刊:
PLANT AND CELL PHYSIOLOGY
影响因子:
4.9
作者:
[Arae, Toshihiro, Isai, Shiori, Chiba, Yukako]
通讯作者:
Chiba, Yukako
シロイヌナズナCCR4-NOT複合体サブユニットと標的認識に働くRNA結合タンパク質の探索と同定
搜索和鉴定拟南芥 CCR4-NOT 复合体亚基和在目标识别中发挥作用的 RNA 结合蛋白
DOI:
--
发表时间:
2017
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Toshihiro Arae, Riko Imahori, Yuya Suzuki, Yukako Chiba, 荒江星拓,森田琴音,鈴木悠也,千葉由佳子, 荒江星拓,鈴木悠也,千葉由佳子]
通讯作者:
荒江星拓,鈴木悠也,千葉由佳子
共 10 条
ポリA鎖を介した転写後制御の時空間動態から迫る植物カルスの分化多能性獲得機構
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批准号:22KJ0759
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2023
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负责人:荒江 星拓
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依托单位:
海外基金