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ウイルス感染現象を詳細に記述するマルチスケールモデルの開発とデータ解析理論の構築

详细描述病毒感染现象的多尺度模型的开发和数据分析理论的构建

基本信息

批准号：
16J03672
负责人：
柿添友輔
金额：
$ 1.79万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2016
资助国家：
日本
起止时间：
2016-04-22 至 2019-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

1.宿主免疫応答で重要であるインターフェロンαがヒト免疫不全ウイルス1型（HIV-1）の2種感染様式(cell-free感染とcell-to-cell感染)に与える影響を調査した。具体的には、cell-free感染とcell-to-cell感染を区別できるウイルス感染実験を実施し、時系列データを取得する。取得された時系列データをうまく説明できるような数理モデルを開発し、ベイズ推定を用いたモデル適合を行なった。解析の結果、インターフェロンαはcell-to-cell感染を抑制し、cell-free感染を促進することを示唆した。2.B型肝炎ウイルスは、現在のところウイルス排除が達成可能な抗ウイルス薬は開発されていない。ウイルス排除が困難である主な原因は、感染細胞内に長期間残存しているウイルス由来物質(cccDNA)であることがこれまでの研究において分かっている。そこで本研究では、初代培養肝細胞を用いたHBV感染実験を実施し、細胞内のウイルス複製動態の時系列データを取得した。取得した時系列データに対して、ウイルス感染実験をうまく説明できるような数理モデルを開発し、定量的解析を行なった。解析の結果、cccDNAはおよそ20日という非常に長い半減期を持つことを明らかにした。本研究ではこのような細胞内のウイルス複製動態に加え、細胞間のウイルス感染を考慮したマルチスケールモデルを開発し、そこからウイルスの適応度である基本再生産数を導出した。このように導出した基本再生産数を用いて、今年度行なった初代培養細胞におけるHBV感染と昨年度解析を行なったHep38.7-Tet細胞系における基本再生産数を比較し、生物学的な議論を展開した。本研究成果は、現在国際誌への投稿準備を進めている。

1. The importance of host immune response was investigated in relation to the two modes of infection (cell-free infection and cell-to-cell infection) of HIV-1. Specific cell-free infections and cell-to-cell infections are identified. Get a description of the time series, the mathematical model, the development model, the estimation model, the application model, and the application model. The results of the analysis show that cell-to-cell infection is inhibited and cell-free infection is promoted. 2. Hepatitis B virus infection is now diagnosed as a possible cause of infection. The main reason for the difficulty in eliminating them is that they remain in infected cells for a long time and are derived from substances (cccDNA). In this study, HBV infection in primary cultured hepatocytes was investigated, and the dynamics of HBV replication in the cells were determined. Get a description of the time series, the number of infections, and the number of quantitative analyses. The analysis results, cccDNA In this study, the basic reproduction number was derived by considering the dynamics of intracellular replication and intercellular infection. The basic reproduction numbers derived from Hep38.7-Tet cell line were compared with those derived from Hep38.7-Tet cell line. The results of this study are now ready for submission to the International Journal.