多様なバイオマスを構成する多糖類を分解できる微生物の基質の識別・認識機構の解明

阐明可降解构成各种生物质的多糖的微生物的底物识别和识别机制

• 批准号: 16J08791
• 负责人: 油屋 駿介
• 金额: $ 2.18万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2016
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2016-04-22 至 2019-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16J08791/
• 关键词: セルロボランス; プロテオーム解析; セルロソーム; メチルトランスフェラーゼ; クロストリジウムセルロボランス; 宿主ベクター系; 経時的プロテオーム; C. cellulovorans; DNAメチラーゼ; シャトルベクター; 制限酵素

１.　C. cellulovoransの経時的プロテオーム解析以前のClostridium cellulovoransの比較プロテオーム解析の結果から本微生物が上清に存在する基質に応じて代謝タンパク質や基質の認識に関わるタンパク質群を大きく変動させていることが明らかになった。一方、C. cellulovoransがこれらの多糖基質の分解・代謝の際に、どのようにして経時的に分泌タンパク質と細胞タンパク質を変動させていくメカニズムは未だ明らかになっていない。これを明らかにするためにC. cellulovoransの経時的プロテオーム解析を行っている。昨年までにサンプルの調製、分析を終えていたため、本年度はこの統計解析を行い、C. cellulovoransが経時的に変動させているタンパク質群を明らかにした。経時的な解析の結果C. cellulovoransは菌体表面のセルロソームを上清に分泌することで植物細胞壁多糖を効率よく分解していることが示唆された。またネットワーク解析も行い、C. cellulovoransがプロテアーゼとプロテアーゼインヒビターを協調的に発現させることで、植物のプロテアーゼを阻害しながら多糖類を分解している機構が示唆された。本内容は基質の識別・認識機構の解明、バイオマス分解、C. cellulovoransの代謝工学などにとっての重要な情報源になることが期待される。

1.C. Youdaoplaceholder0 cellulovorans the プロテ, cellulovorans and ム of time resolve the previous <s:1> Clostridium Cellulovorans の is プ ロ テ オ ー ム analytical results の か ら exist on the microbial が qing に す る matrix に 応 じ て metabolic タ ン パ ク qualitative や matrix の know に masato わ る タ ン パ ク mass group of large を き く - move さ せ て い る こ と が Ming ら か に な っ た. Side, c. cellulovorans が こ れ ら の の polysaccharide matrix decomposition, metabolic の interstate に, ど の よ う に し て 経 に secretion of タ ン パ ク qualitative と cells タ ン パ ク qualitative を - move さ せ て い く メ カ ニ ズ ム は not だ Ming ら か に な っ て い な い. こ れ を Ming ら か に す る た め に c. cellulovorans の 経 when プ ロ テ オ ー ム parsing line を っ て い る. Yesterday in ま で に サ ン プ ル の modulation, analysis を え て い た た め, this year's は こ の statistical parsing を い, c. cellulovorans が 経 when に - move さ せ て い る タ ン パ ク mass group を Ming ら か に し た. 経 な analytic の results when c. cellulovorans は bacteria surface の セ ル ロ ソ ー ム を supernatant に secretion す る こ と で plant cell wall polysaccharides could promote behavior rate よ を く decomposition し て い る こ と が in stopping さ れ た. ま た ネ ッ ト ワ ー ク parsing も い, c. cellulovorans が プ ロ テ ア ー ゼ と プ ロ テ ア ー ゼ イ ン ヒ ビ タ ー を coordinated に 発 now さ せ る こ と で, plant の プ ロ テ ア ー ゼ を resistance against し な が ら polysaccharide を decomposition し て い る institutions が in stopping さ れ た. This content の は matrix recognition, understanding institutions の uttered, バ イ オ マ ス decomposition, c. cellulovorans の metabolic engineering な ど に と っ て の important な intelligence source に な る こ と が expect さ れ る.

项目成果

経時的定量プロテオーム解析を用いた細胞・分泌タンパク質の同時計測によるClostridium cellulovoransの植物構成多糖適応機構の解析

使用定量时程蛋白质组分析同时测量细胞和分泌蛋白，分析纤维素梭菌的植物成分多糖适应机制

• 发表时间: 2018
• 作者: 油屋駿介;青木航;植田充美
• 通讯作者: 植田充美

Clostridium cellulovoransの基質多糖認識機構の解明

阐明纤维素梭菌的底物多糖识别机制

• 发表时间: 2017
• 作者: 油屋駿介;青木航;黒田浩一;植田充美
• 通讯作者: 植田充美

AI導入によるバイオテクノロジーの発展

通过引入人工智能来发展生物技术

• 发表时间: 2018
• 作者: 小柳恵理;吉藤郁弥;荻朋男;夏目豊彰;鐘巻将人;大学保一;青木 航
• 通讯作者: 青木 航

Characteristic strategy of assimilation of various saccharides by Clostridium cellulovorans.

• DOI: 10.1186/s13568-016-0237-5
• 发表时间: 2016-12
• 期刊: AMB Express
• 影响因子: 3.7
• 作者: Inamori T;Aburaya S;Morisaka H;Kuroda K;Ueda M
• 通讯作者: Ueda M

Temporal quantitative proteome analysis reveals dynamic change of cellular and secreted protein profiles of Clostridium cellulovorans depending on carbon sources

时间定量蛋白质组分析揭示了纤维素梭菌的细胞和分泌蛋白质谱随碳源的动态变化

• 发表时间: 2017
• 作者: Shunsuke Aburaya;Wataru Aoki;Kouichi Kuroda;Mitsuyoshi Ueda
• 通讯作者: Mitsuyoshi Ueda