水素生産利用に向けた熱水環境微生物による未知一酸化炭素代謝サイクルの解明
阐明微生物在热液环境中用于氢气生产和利用的未知一氧化碳代谢循环
基本信息
- 批准号:16J11269
- 负责人:
- 金额:$ 1.79万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2016
- 资助国家:日本
- 起止时间:2016-04-22 至 2019-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
水素生成型 CO 資化性菌は CO デヒドロゲナーゼ (CODH) と膜結合ヒドロゲナーゼ (ECH) の複合体によって、CO 酸化と水素生成を共役させ、エネルギー保存を行う。このシンプルでユニークな呼吸装置はゲノム上で遺伝子クラスターを形成しており、水素生成型CO資化性菌を特徴づけている。しかし、CODH 遺伝子は配列が多様であり、ユニバーサルプライマーの設計が困難であるため、水素生成型 CO 資化性菌の分子生態学的研究の大きな障壁となってきた。本年度は水素生成型 CO 資化性菌の微生物生態系における機能解明を目指して研究を行った。まず、ゲノム情報が利用可能な全原核生物(約14万3千ゲノム)において、CODH-ECH 遺伝子クラスター保有株を探索し、6門25属43種の65ゲノムと未培養株6ゲノムを同定した。この中には CO 資化水素生成能が未報告の 17 属 24 種も含まれた。8億4千万配列が登録されているメタゲノムデータベースの配列をマッピングしても本遺伝子クラスターは検出されず、環境中の存在量は低いことが示唆された。また、CODH-ECH 遺伝子クラスター保有株の 16S rRNA 系統を利用した菌叢解析により、熱水環境におけるCO 資化性菌の探索を行った。九州および伊豆の泉源より採取した、100の堆積物試料における菌叢解析で得られた配列を解析した結果、幅広い泉源において Firmicutes 門の潜在的な水素生成型 CO 資化性菌が 0.1% 未満の相対存在量で分布することを初めて明らかにした。低い相対存在量のため、計画当初のメタゲノム解析が困難であることが明らかになったが、本特別研究員は CODH 遺伝子を標的とした複数のプライマーセットを設計し、多様性解析手法の基盤を確立した。
CO-producing bacteria are able to co-operate with CODH and membrane bound CODH (ECH) complexes, and to preserve CODH and ECH. The characteristics of CO-producing bacteria in the respiratory system are as follows: The molecular ecology of water-producing CO-producing bacteria is a major barrier to the design of CO-producing bacteria. This year, we will conduct research on the functional elucidation of microbial ecosystems of CO-producing bacteria. In addition, the information on CODH-ECH can be used to explore all prokaryotes (about 143,000 species), including 65 uncultured strains belonging to 25 genera of 6 phyla. There are 17 genera and 24 species of CO-producing water element in this study. The 840 million listings are now available and the list of items that must be used in the event is now available. The genetic information is detected and the amount of it in the environment is low. This is a sign of great concern. The 16S rRNA system of CODH-ECH gene was used to analyze flora and explore CO-producing bacteria in hot water environment. 100 samples collected from the Firmicutes were analyzed for bacterial population. The results showed that 0.1% of the potential water-producing CO-producing bacteria in Firmicutes were not present in the corresponding amount. This special researcher designs and establishes a multi-dimensional analysis method for the CODH gene target.
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
火山性環境における一酸化炭素資化性菌の分布および多様性の解明
阐明火山环境中一氧化碳同化细菌的分布和多样性
- DOI:
- 发表时间:2018
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:大前公保;福山宥斗;大黒達希;大神優祐;安田尚登;吉田天士;左子芳彦
- 通讯作者:左子芳彦
水素生成型新規一酸化炭素資化性好熱細菌Calderihabitans maritimusのゲノム解析
新型产氢一氧化碳同化嗜热细菌 Calderihabitans maritimus 的基因组分析
- DOI:
- 发表时间:2016
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:大前公保;米田恭子;福山宥斗;吉田天士;左子芳彦
- 通讯作者:左子芳彦
Diversity and distribution of thermophilic hydrogenogenic carboxydotrophs revealed by microbial community analysis in sediments from multiple hydrothermal environments in Japan
日本多个热液环境沉积物中微生物群落分析揭示嗜热产氢一氧化碳营养菌的多样性和分布
- DOI:10.1007/s00203-019-01661-9
- 发表时间:2019
- 期刊:
- 影响因子:2.8
- 作者:Kimiho Omae;Yuto Fukuyama;Hisato Yasuda;Kenta Mise;Takashi Yoshida;Yoshihiko Sako
- 通讯作者:Yoshihiko Sako
Genomic analysis of Calderihabitans maritimus KKC1, a thermophilic hydrogenogenic carboxydotrophic bacterium isolated from marine sediment.
Calderihabitans maritimus KKC1(一种从海洋沉积物中分离出来的嗜热产氢一氧化碳营养细菌)的基因组分析。
- DOI:10.1128/aem.00832-17
- 发表时间:2017
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Kimiho Omae;Yasuko Yoneda;Yuto Fukuyama;Takashi Yoshida and Yoshihiko Sako
- 通讯作者:Takashi Yoshida and Yoshihiko Sako
原核生物の 16S rRNA 系統における一酸化炭素 (CO) デヒドロゲナーゼの分布パターンを利用した水素生成型 CO 資化菌の分子生態
利用原核 16S rRNA 谱系中一氧化碳 (CO) 脱氢酶的分布模式研究产氢 CO 同化细菌的分子生态学
- DOI:
- 发表时间:2019
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:大前公保;福山宥斗;大黒達希;大神優祐;安田尚登;吉田天士;左子芳彦
- 通讯作者:左子芳彦
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大前 公保其他文献
集積培養系に出現した多様な一酸化炭素酸化菌の網羅的ゲノム解析
对富集培养系统中出现的各种一氧化碳氧化细菌进行全面的基因组分析
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
西田 志穂;大前 公保;井上 真男;左子 芳彦;神川 龍馬;吉田 天士 - 通讯作者:
吉田 天士
大前 公保的其他文献
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対偶ネットワークが駆動する効率的な遺伝資源開発
成对网络驱动的高效遗传资源开发
- 批准号:
23K19343 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 1.79万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up














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