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胞子形成細菌の多様性と分類に関する研究

芽孢菌多样性及分类研究

基本信息

批准号：
16J30010
负责人：
渡邊美穂
金额：
$ 2.58万
依托单位：
Hokkaido University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2016
资助国家：
日本
起止时间：
2016-04-22 至 2019-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16J30010/
关键词：
細菌内生胞子分類系統系統分類胞子形成ゲノム解析新規細菌

项目摘要

内生胞子は、強いストレス耐性を有する細菌細胞形態のひとつである。内生胞子は医薬・農・環境微生物学等さまざまな研究分野で重要視されている。しかし、その系統的広がりやその機構の進化については未知のままである。細菌における胞子形成機構について明らかにすることは、細菌の系統進化解明にもつながり得ると考えられる。本研究では胞子形成細菌の多様性を明らかにし、その進化過程の解明および分類体系の確立を目的とした。本年度においては、胞子形成性硫酸還元細菌群の大規模な再分類の提唱を主に行った。Desulfotomaculum属は、グラム陽性胞子形成性の硫酸還元細菌の一群である。この属は系統的多様性が非常に高いために、これに含まれる35種は8つの下位分類群（DesulfotomaculumサブクラスターIa～Ih）に分けられていた。この下位分類群の中にはCryptanaerobacter, Desulfurispora, Pelotomaculum, Sporotomaculumの異なる4属も混在しており、その中には硫酸還元を行わない特徴を持つものも含まれる。本研究では、Desulfotomaculum属の下位分類群についてその系統学的な関係性を精査した。それぞれの下位分類群に属する株のゲノムから得た代表的なハウスキーピング遺伝子を用いて複数の系統樹を作成した。その結果、それぞれの下位分類群は少なくとも属レベルの分類群に相当しうることが確認された。このことから、本属の基準株を含んでいるグループのみをDesulfotomaculum属として、それ以外の4グループに対応する新属を設ける旨の再分類提唱を行った。この結果は国際誌上で発表し、提唱した4属については有効な名前として記載されている。

Endophytic spores are resistant to bacterial cell morphology. Endosperm is an important research area in medicine, agriculture and environmental microbiology. The evolution of the system is unknown. The mechanism of spore formation in bacteria and the evolution of bacteria The purpose of this study is to clarify the diversity of sporophytic bacteria, to clarify their evolutionary processes, and to establish taxonomic systems. This year's large-scale reclassification of sporophytic sulfate reducing bacteria was carried out. Desulfotomaculum is a group of bacteria that form positive spores. The diversity of the genus is very high, and the genus contains 35 species and 8 subordinate taxa (Desulfotomaculum). In the lower taxa, four genera Cryptanaeropus, Desulfurispora, Pelotomaculum, Sporomaculum are mixed together, and in the middle of the taxa, sulfuric acid is reduced. In this study, the systematics of Desulfotomaculum were investigated. A phylogenetic tree is constructed using a plurality of tree members. The result is that the lower taxa of the genus are less than the lower taxa of the genus. The reference strain of this genus contains four groups of species, namely Desulfotomaculum genus and four groups of species, and the new genus is proposed for reclassification. The results of this study were recorded in the international journal.