寄生バチによるクモ網操作:マルチオミクス解析を用いた分子機構解明と進化経路追跡

寄生黄蜂操纵蜘蛛网:利用多组学分析阐明分子机制并追踪进化路径

基本信息

  • 批准号:
    17J40065
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.83万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2017
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2017-04-26 至 2020-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

過去2年、ニールセンクモヒメバチ幼虫・成虫の時系列比較トランスクリプトミクスに注力してきたが、発現定量解析の基準としていたリファレンス配列は、ゲノム情報が存在しなかったためトランスクリプトーム配列を基に構築した擬似的なものを利用せざるを得なかった。それでも上手く解析できることは十分期待されていたが、現実的には検出されるDEGのTPM値が異様に高いといった難点を呈したため、全ゲノムによる発現定量解析の再実施を目的とし、ニールセンクモヒメバチおよび同じく解析対象としている同属別種の全ゲノム決定を目指した。ハチ成虫から抽出したゲノムをChromium Controllerによってエンリッチメントし、MiSeq によって全ゲノムシーケンスする方針を採った。破砕法を検討しながら最適条件を探りつつ抽出を繰り返し、特に長さの点(60Kbps前後)で最も成績のよかったサンプル上位2つをエンリッチメントおよびシーケンスに供した。ただし、抽出量は3~5ng/ulと非常に少ないものであった。結果としては、いずれの配列もクオリティが低く、ゲノム抽出自体に問題があることが示された。その後も、近縁ヒメバチのテストサンプルを用いて抽出キットも複数試すなど、破砕や抽出の条件検討を繰り返したが、1個体抽出では長さと量を両立させた最適な条件を得るには至れず、課題を残した。ここには技術的な問題だけではなく、小型のヒメバチ類が1個体のみでは十分量の長鎖DNAを得るのが難しいという生物学的な特質が存在する可能性もある。そのため、今後(1)Chromium ControllerとMiSeqによる配列決定からMinion (Nanopore)に変更し、(2)1個体からの抽出をやめ、20Kbps以上でDNA量が合計で1ugになるよう複数個体をプールする、という方針に変更する。
In the past two years, the time series comparison of larvae and adults has been carried out, and the benchmarks for quantitative analysis have been found, and the information has been used to construct the basis for simulation. In addition, it is expected that the TPM value of DEG will be different from that of the original one. In addition, it is expected that the TPM value of DEG will be different from that of the original one. The policy of Chromium Controller is adopted. The most suitable conditions for breaking the law are to explore the best conditions for extraction, especially for long periods of time (around 60Kbps), and to provide the best results. 3~5ng/ul is very small. The result is that the number of entries in the list is lower than the number of entries in the list In the future, we will use the nearby support server to extract multiple tokens for testing, and the conditions for extraction and extraction will be discussed briefly. If one token is extracted, it will be long and the amount will be established. If the optimal conditions are met, the topic will be completed. This is a technical problem, a small problem, a small problem, In the future,(1) Chromium Controller MiSeq,(2) 1 individual,(3) total DNA,(4) total DNA,(5) total DNA,(6) total DNA,(7) total DNA,(8) total DNA,(9) total DNA,(9) total DNA,(10) total DNA,

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
多様なクモ網を打破したクモヒメバチの多彩な産卵行動戦術
冲破各种蜘蛛网的蜘蛛黄蜂的各种产卵战术
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Takasuka Keizo;Matsumoto Rikio;Maeto Kaoru;髙須賀圭三
  • 通讯作者:
    髙須賀圭三
Cyclosa omonaga (Araneae: Araneidae), an alternative host of the spider ectoparasitoid Reclinervellus nielseni (Hymenoptera: Ichneumonidae), with notes on behavioural manipulation
Cyclosa omonaga(Araneae:Araneidae),蜘蛛外寄生类 Reclinervellus nielseni(膜翅目:Ichneumonidae)的替代宿主,附有行为操纵的注释
  • DOI:
    10.13156/arac.2017.17.8.406
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Takasuka Keizo;Matsumoto Rikio;Maeto Kaoru;髙須賀圭三;Takasuka Keizo
  • 通讯作者:
    Takasuka Keizo
Evaluation of manipulative effects by an ichneumonid spider-ectoparasitoid larva upon an orb-weaving spider host (Araneidae, Cyclosa argenteoalba) by means of surgical removal and transplantation
通过手术切除和移植评估姬蜂蜘蛛外寄生物幼虫对球织蜘蛛宿主(蜘蛛科,Cyclosa argenteoalba)的操纵效果
  • DOI:
    10.1636/joa-s-18-082
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    1
  • 作者:
    Takano Tsuyoshi;Kimura Shoichi;Kano Yasunori;Takasuka Keizo
  • 通讯作者:
    Takasuka Keizo
クモヒメバチ幼虫の外部付着様式
蜘蛛蜂幼虫的体外附着方式
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Naoya Mitani;Akihiko Mougi;髙須賀圭三,宮崎勝己,後藤彩,櫛引敬嗣,小川大地,安井知己
  • 通讯作者:
    髙須賀圭三,宮崎勝己,後藤彩,櫛引敬嗣,小川大地,安井知己
Oviposition behaviour by a spider‐ectoparasitoid, Zatypota maculata, exploits the specialized prey capture technique of its spider host
蜘蛛外寄生物 Zatypota maculata 的产卵行为利用了蜘蛛宿主专门的猎物捕获技术
  • DOI:
    10.1111/jzo.12668
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2
  • 作者:
    Takasuka Keizo;Matsumoto Rikio;Maeto Kaoru
  • 通讯作者:
    Maeto Kaoru
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    12J02707
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    2012
  • 资助金额:
    $ 2.83万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows

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    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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  • 批准号:
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  • 财政年份:
    2012
  • 资助金额:
    $ 2.83万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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