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流出解析と環境DNA分析を用いた種の生息位置推定モデルの開発

流出解析と環境DNA分析を用いた種の生息位置推定モデルの開発
利用径流分析和环境 DNA 分析开发物种栖息地估计模型
批准号:
17J02158
负责人:
内田 典子
金额:
$1.79万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2017
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2017-04-26 至 2020-03-31

项目摘要

项目成果

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本研究の最終目的は環境DNAの測定データから対象種の存在位置を推定できるモデルの開発である.本年度においては,これまで収集した河川の水生昆虫の生物相・生物量データと無脊椎動物群の環境DNAを解析して得られたデータを用いて,a) 実河川における環境DNA濃度分布の把握,b) 分布型流出モデルへの適用,c) 環境DNAメタバーコーディングによる水生昆虫相の解明を試みた.このうち,特にa),c) に加えて,d) 環境DNAから得られたデータの環境評価への適用に関して成果が得られた.本研究成果により,流域における生物量の空間推定を可能とし,環境評価を通じて河川整備計画などへの貢献が期待できる.各成果の詳細は以下のとおりである,a) 定量PCRにより得られたDNA濃度と,メタバーコーディングにより得られた生物DNAの相対割合を乗じて各生物群DNAの存在量を求めるアイデアを提案した.本手法により得られた各生物群のDNA濃度と実河川における水生昆虫個体数は正の相関関係を示した.本テーマは土木学会誌(環境工学)に掲載された.c) 2016年5月~12月における水生昆虫の群集構造の時系列変化から,群集データは環境DNAと採集調査法の間で完全一致はしないが,群集の変化傾向が類似することを明らかにした.本テーマは応用生態工学会誌に採択が決定した.d) 環境DNAおよびサーバーネットを用いた採集調査から得られた水生昆虫の分類群多様性データを,従来から知られている水質指標(EPT指数,ユスリカ指数)の計算に適用した.その結果,環境DNAデータに基づく水質指標はサーバーネット調査データに基づく場合よりも水質変化に対する感度が高いことが示された.環境DNAデータは生物情報に基づきながらも生物採集を必要としない,新たな環境評価指標を提供する可能性を示した.本テーマはOA誌PeerJに受理された.
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会议论文
メタバーコーディングと定量PCRから得た水生昆虫環境DNA量と水生昆虫現存量の関係
宏条形码和定量PCR获得的水生昆虫环境DNA量与水生昆虫丰度的关系
DOI: --
发表时间: 2019
期刊: 土木学会論文集G(環境工学)
影响因子: --
作者: [Obata, M. and Goto, Y., 内田典子,久保田健吾,会田俊介,風間聡]
通讯作者: 内田典子,久保田健吾,会田俊介,風間聡
サーバーネット採集法と環境DNAによる台風撹乱に対する底生動物群集構造の応答観測
利用服务器网采集法和环境DNA观测底栖群落结构对台风扰动的响应
DOI: --
发表时间: 2019
期刊:
影响因子: --
作者: [Hirao, Y., 内田典子,久保田健吾,会田俊介,風間聡, 内田典子・久保田健吾・会田俊介・風間聡]
通讯作者: 内田典子・久保田健吾・会田俊介・風間聡
The attempt of quantitative compering with environmental DNA and biomass of benthic invertebrates in Japan
日本环境DNA与底栖无脊椎动物生物量定量比较的尝试
DOI: --
发表时间: 2018
期刊:
影响因子: --
作者: [Hirao, Y., 内田典子,久保田健吾,会田俊介,風間聡, 内田典子・久保田健吾・会田俊介・風間聡, 内田典子・久保田健吾・会田俊介・風間聡, Noriko UCHIDA]
通讯作者: Noriko UCHIDA
Longitudinal and Seasonal Profiles of Concentration of Stream Environmental DNA for Stream Invertebrates in Fresh Water
淡水中溪流无脊椎动物溪流环境 DNA 浓度的纵向和季节分布
DOI: --
发表时间: 2017
期刊:
影响因子: --
作者: [Noriko Uchida, So Kazama, Kengo Kubota, Kei Nukazawa]
通讯作者: Kei Nukazawa
8
    Verifying the flush regime of environmental DNA and developing monitoring methods for aquatic and terrestrial biotas
    • 批准号:
      20K22426
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
    • 资助金额:
      $1.83万
    • 财政年份:
      2020
    • 负责人:
      内田 典子
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金
    毒死蜱对武陵山区常见水生昆虫炎黄星齿蛉的生物毒性研究
    • 批准号:
      2024JJ7415
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2024
    • 负责人:
      黄兴龙
    • 依托单位:
    环境变化和功能性状对水生昆虫集合群落的影响研究
    • 批准号:
      32101270
    • 项目类别:
      青年科学基金项目(C类)
    • 资助金额:
      30.0万元
    • 批准年份:
      2021
    • 负责人:
      何思文
    • 依托单位:
    镉污染对水生昆虫的生物毒性及水生昆虫GSTs对镉胁迫的响应:以武陵山区常见水生昆虫花边星齿蛉为例
    • 批准号:
      2020JJ5454
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2020
    • 负责人:
      黄兴龙
    • 依托单位:
    苍山平行溪流的流域水生昆虫多样性分布格局之水陆一体化研究
    • 批准号:
      31960255
    • 项目类别:
      地区科学基金项目
    • 资助金额:
      40.0万元
    • 批准年份:
      2019
    • 负责人:
      李先福
    • 依托单位: