流出解析と環境ＤＮＡ分析を用いた種の生息位置推定モデルの開発

利用径流分析和环境 DNA 分析开发物种栖息地估计模型

• 批准号: 17J02158
• 负责人: 内田 典子
• 金额: $ 1.79万
• 依托单位: Tohoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2017
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2017-04-26 至 2020-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-17J02158/
• 关键词: 環境DNA; 水生昆虫; メタバーコーディング; 定量PCR; 群集構造

本研究の最終目的は環境DNAの測定データから対象種の存在位置を推定できるモデルの開発である．本年度においては，これまで収集した河川の水生昆虫の生物相・生物量データと無脊椎動物群の環境DNAを解析して得られたデータを用いて，a) 実河川における環境DNA濃度分布の把握，b) 分布型流出モデルへの適用，c) 環境DNAメタバーコーディングによる水生昆虫相の解明を試みた．このうち，特にa)，c) に加えて，d) 環境DNAから得られたデータの環境評価への適用に関して成果が得られた．本研究成果により，流域における生物量の空間推定を可能とし，環境評価を通じて河川整備計画などへの貢献が期待できる．各成果の詳細は以下のとおりである，a) 定量PCRにより得られたDNA濃度と，メタバーコーディングにより得られた生物DNAの相対割合を乗じて各生物群DNAの存在量を求めるアイデアを提案した．本手法により得られた各生物群のDNA濃度と実河川における水生昆虫個体数は正の相関関係を示した．本テーマは土木学会誌（環境工学）に掲載された．c) 2016年5月~12月における水生昆虫の群集構造の時系列変化から，群集データは環境DNAと採集調査法の間で完全一致はしないが，群集の変化傾向が類似することを明らかにした．本テーマは応用生態工学会誌に採択が決定した．d) 環境DNAおよびサーバーネットを用いた採集調査から得られた水生昆虫の分類群多様性データを，従来から知られている水質指標（EPT指数，ユスリカ指数）の計算に適用した．その結果，環境DNAデータに基づく水質指標はサーバーネット調査データに基づく場合よりも水質変化に対する感度が高いことが示された．環境DNAデータは生物情報に基づきながらも生物採集を必要としない，新たな環境評価指標を提供する可能性を示した．本テーマはOA誌PeerJに受理された．

The most important environmental DNA in this study is to determine the location of the animal species in the environment. It is presumed that the animal species are in operation this year. This year, the aquatic insects in rivers and rivers were collected. The biomass of aquatic insects, the biomass of vertebrate animals, the environmental DNA analysis, and the environmental DNA distribution were determined. A) the distribution of environmental pollution in rivers and rivers was determined. B) the distribution pattern of outflow is in good use, c) the environmental DNA is sensitive to the environmental pollution, and the aquatic insects are sensitive to the environmental pollution. Special a), c) the environmental DNA is affected by the environmental pollution, and d) the environmental environmental pollution is affected by the environmental pollution. The results of this study are satisfactory, and the spatial presumption of the biomass of the watershed is likely to be satisfactory. The environmental protection plan, the river improvement plan, the project, the planning, the planning, the management, the quality, the DNA, the quality, the level, the The biological DNA of each biota was obtained. The DNA of each biota is required to meet the requirements of the biota. This method is used to determine the DNA of each biota. The number of aquatic insects in the river is positively correlated with each other. The Journal of Civil Engineering (Environmental Engineering) in this laboratory. C) from May to December 2016, a series of seasonal flocks of aquatic insects were built. The clustering method for the DNA environment is completely consistent, and the clustering method is similar to that of the user. The Institute of Health and Engineering of the Institute of Health and Engineering determines the classification of aquatic insects. D) the environmental DNA environment uses the cluster cluster to obtain the classification of aquatic insects. In recent years, the environmental DNA environmental pollution index (EPT Index) has been used in the calculation of environmental pollution. The results show that the environmental DNA environmental environmental pollution index is very sensitive to environmental pollution. The new environmental protection refers to the availability of information on the possibility of environmental protection. This OA journal PeerJ will accept information.

项目成果

メタバーコーディングと定量PCRから得た水生昆虫環境DNA量と水生昆虫現存量の関係

宏条形码和定量PCR获得的水生昆虫环境DNA量与水生昆虫丰度的关系

• 发表时间: 2019
• 期刊: 土木学会論文集G（環境工学）
• 作者: Obata;M. and Goto;Y.;内田典子，久保田健吾，会田俊介，風間聡
• 通讯作者: 内田典子，久保田健吾，会田俊介，風間聡

サーバーネット採集法と環境DNAによる台風撹乱に対する底生動物群集構造の応答観測

利用服务器网采集法和环境DNA观测底栖群落结构对台风扰动的响应

• 发表时间: 2019
• 作者: Hirao;Y.;内田典子，久保田健吾，会田俊介，風間聡;内田典子・久保田健吾・会田俊介・風間聡
• 通讯作者: 内田典子・久保田健吾・会田俊介・風間聡

The attempt of quantitative compering with environmental DNA and biomass of benthic invertebrates in Japan

日本环境DNA与底栖无脊椎动物生物量定量比较的尝试

• 发表时间: 2018
• 作者: Hirao;Y.;内田典子，久保田健吾，会田俊介，風間聡;内田典子・久保田健吾・会田俊介・風間聡;内田典子・久保田健吾・会田俊介・風間聡;Noriko UCHIDA
• 通讯作者: Noriko UCHIDA

Longitudinal and Seasonal Profiles of Concentration of Stream Environmental DNA for Stream Invertebrates in Fresh Water

淡水中溪流无脊椎动物溪流环境 DNA 浓度的纵向和季节分布

• 发表时间: 2017
• 作者: Noriko Uchida;So Kazama;Kengo Kubota;Kei Nukazawa
• 通讯作者: Kei Nukazawa

RELATIONSHIP BETWEEN STREAM INSECTS’ BIOMASS AND ENVIRONMENTAL DNA DERIVED BY METABARCODING AND QUANTITATIVE PCR

通过 Metabarcode 和定量 PCR 得出的河流昆虫生物量与环境 DNA 之间的关系

• DOI: 10.2208/jscejer.75.7_iii_281
• 发表时间: 2019
• 期刊: Journal of Japan Society of Civil Engineers, Ser. G (Environmental Research)
• 作者: Hirao;Y.;内田典子，久保田健吾，会田俊介，風間聡
• 通讯作者: 内田典子，久保田健吾，会田俊介，風間聡