高分子量蛋白質NMR構造決定の完全自動化と人工花成ホルモン受容体複合体への応用
高分子量蛋白質NMR構造決定の完全自動化と人工花成ホルモン受容体複合体への応用
批准号:
18J01012
负责人:
新家 粧子
金额:
$2.33万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2018
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2018-04-25 至 2021-03-31
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英文摘要
今年度は、フロリゲン蛋白質の19Fスクリーニングと、19Fを利用した、ヒット化合物複合体構造解析に取り組んだ。昨年度のフロリゲン受容体蛋白質に対する19F NMRスクリーニングの結果得られた複数のヒット化合物について、1H 飽和移動差 NMR実験を実施した。その結果、フロリゲン受容体蛋白質と混合した際に、19Fヒット化合物と受容体蛋白質の相互作用を示す明確なシグナルが得られた。さらに、フロリゲン蛋白質についても、昨年度整備した所属機関独自の19Fスクリーニングライブラリを用いて19F NMRスクリーニングを実施した。その結果、複数のヒット化合物が得られた。これらのヒット化合物についても、1H 飽和移動差NMR実験を実施し、フロリゲン蛋白質と19Fヒット化合物の相互作用を示すシグナルを得た。つづいて、19Fヒット化合物の蛋白質への結合部位を明らかにすることを目的とし、19Fを利用した選択的飽和移動差NMR実験に取り組んだ。既知阻害剤との複合体構造情報に富むFKBP12蛋白質をモデル蛋白質とした。19F NMRスクリーニングにより得られたFKBP12のヒット化合物について、滴定実験を行なった。化合物滴定によるHSQCシグナルの化学シフト変化に基づいてFKBP12との複合体構造モデルを構築し、1H核および19F核を用いた選択的飽和移動差NMR実験の結果を満足する複合体構造モデルを選択する事で、極めて収束度の高い複合体構造を得ることに成功した。
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会议论文
Mechanisms of chitosan recognition by chitosan-related proteins
壳聚糖相关蛋白识别壳聚糖的机制
DOI:
--
发表时间:
2018
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Shoko Shinya, Evgenii L. Kovrigin, Kyoko Furuita, Chojiro Kojima, Tamo Fukamizo]
通讯作者:
Tamo Fukamizo
DOI:
10.1093/bioinformatics/bty581
发表时间:
2018-12-15
期刊:
BIOINFORMATICS
影响因子:
5.8
作者:
[Kobayashi, Naohiro, Hattori, Yoshikazu, Fujiwara, Toshimichi]
通讯作者:
Fujiwara, Toshimichi
DOI:
10.1016/j.bbagen.2019.129418
发表时间:
2020-02-01
期刊:
BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENERAL SUBJECTS
影响因子:
3
作者:
[Bala, Siqin, Shinya, Shoko, Kohda, Daisuke]
通讯作者:
Kohda, Daisuke
キチン系バイオマスの有効利用をめざした構造生物学:キトサン加水分解酵素
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批准号:13J03639
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.15万
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财政年份:2013
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负责人:新家 粧子
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依托单位:
海外基金