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浅海由来生物のエラから探るイプシロンプロテオバクテリア綱細菌の分布と機能

浅海生物鳃中Epsilonproteobacteria类细菌的分布和功能研究

基本信息

批准号：
18J14216
负责人：
水谷雪乃
金额：
$ 0.96万
依托单位：
Mie University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2018
资助国家：
日本
起止时间：
2018-04-25 至 2020-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

深海域に生息する一部の海産無脊椎動物とそのエラに生息している細菌は、栄養共生関係にあることが知られているが、浅海域においては未だ不明な点が多い。昨年度、我々は様々な浅海無脊椎動物のエラを対象とした細菌叢解析及び特異的Primerを用いたPCR検出を行った結果、メガイアワビのエラにのみ、深海域において共生細菌と知られているイプシロンプロテオバクテリアに属する新規細菌が優占していることを明らかにした。そこで本年度は、メガイアワビに焦点を当て、採取時期の異なる個体に対して細菌叢解析を行い、メガイアワビのエラに由来する細菌構造のデータを蓄積した。さらに、本細菌の特異的Primerを用いたPCR検出法により、本細菌は消化管や腹足といった他の部位ではなく、エラにのみ生息していることを確認した。加えて、メガイアワビのエラ切片を作製し、本細菌の特異的Probeを用いたFISH法により、新規イプシロンプロテオバクテリアはエラ組織の表面にマイクロコロニーを形成して点在している様子を観察した。次に、このメガイアワビに特異的に生息している新規イプシロンプロテオバクテリアの役割を解明するために、メタゲノム解析により本細菌の代謝機能の予測を試みた。昨年度は、エラから抽出したDNAを用いて次世代シーケンサーによる網羅的な解析を行ったものの、得られたゲノム情報の大半を、宿主の遺伝子情報が占めていた。そこで、DNAを抽出する前に本細菌のみを回収する方法を、東京農工大学のモリ准教授の研究室と共同研究で探索した。メガイアワビのエラ組織のホモジナイズサンプルに、本細菌の特異Probeを付与しFACSを用いて本細菌の回収を試みた。現在は蛍光細胞の回収を増やし、再度メタゲノム解析を行っている。これまでの研究成果を一つの論文にまとめ、現在PeerJへ投稿している。

In the deep sea area, there is a sea fish, vertebrates, animals, fish, bacteria, symbiosis, and shallow waters. Last year, we reported that in shallow water, vertebrae, animals, vertebrates, vertebrae, vertebrates, vertebrates, vertebrates, In the current year, the focus of attention is very important, and during the period of time, there is a need for the analysis of bacteria, and the reasons for the analysis of bacteria. The Primer in the digestive tract, abdominal foot, and other parts of the digestive tract were detected by the PCR method and confirmed by the local bacteria. The Probe of the local bacteria was detected by the FISH method, the new rules and regulations. The surface of the tissue was observed by the method of scanning electron microscopy. In the second half of the year, the information generation system of the special system was introduced, and the new regulations were used to analyze the mechanism of bacteria generation in the system. Last year, we extracted the resolution of the next-generation DNA network for the next-generation wireless network, and most of the information was found, and the host was responsible for the majority of the data. The laboratory of associate professor of Beijing University of Agriculture and Technology and the laboratory of associate professor of Beijing University of Agriculture and Technology have studied and explored jointly. The organization will make sure that the local Probe and local bacteria will be paid to the FACS by using the local bacteria. Now, the light cell is going back to the computer, and I'm going to analyze it again. The results of the research have been published in the first half of this paper. I am now submitting contributions to PeerJ.

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

分子生物学的手法を用いた新規イプシロンプロテオバクテリア綱細菌の生息環境の探索

利用分子生物学方法探索新型 Epsilonproteobacteria 类细菌的栖息地

DOI：
发表时间：
2018
期刊：
影响因子：
0
作者：
Yukino Mizutani;Kazuki Fujiwara;Satoshi Fukuzaki;Reiji Tanaka;水谷雪乃，藤原一輝，福﨑智司，田中礼士;Yukino Mizutani，Kazuki Fujiwara，Satoshi Fukuzaki，Reiji Tanaka;水谷雪乃，藤原一輝，福﨑智司，田中礼士
通讯作者：
水谷雪乃，藤原一輝，福﨑智司，田中礼士

Detection and isolation of not-yet cultured Epsilonproteobacterium from gills of shallow water invertebrates

浅水无脊椎动物鳃中尚未培养的ε变形杆菌的检测和分离

DOI：
发表时间：
2018
期刊：
影响因子：
0
作者：
Yukino Mizutani;Kazuki Fujiwara;Satoshi Fukuzaki;Reiji Tanaka;水谷雪乃，藤原一輝，福﨑智司，田中礼士;Yukino Mizutani，Kazuki Fujiwara，Satoshi Fukuzaki，Reiji Tanaka
通讯作者：
Yukino Mizutani，Kazuki Fujiwara，Satoshi Fukuzaki，Reiji Tanaka

メタゲノム解析を用いた各種浅海由来無脊椎動物のエラ細菌叢比較

使用宏基因组分析比较各种浅海无脊椎动物的鳃细菌菌群

DOI：
发表时间：
2018
期刊：
影响因子：
0
作者：
Yukino Mizutani;Kazuki Fujiwara;Satoshi Fukuzaki;Reiji Tanaka;水谷雪乃，藤原一輝，福﨑智司，田中礼士;Yukino Mizutani，Kazuki Fujiwara，Satoshi Fukuzaki，Reiji Tanaka;水谷雪乃，藤原一輝，福﨑智司，田中礼士;水谷雪乃，福﨑智司，田中礼士
通讯作者：
水谷雪乃，福﨑智司，田中礼士

Diversity, enumeration, and isolation of Arcobacter spp. in the giant abalone, Haliotis gigantea

弓形杆菌属的多样性、计数和分离。

DOI：
10.1002/mbo3.890
发表时间：
2019
期刊：
MicrobiologyOpen
影响因子：
3.4
作者：
Mizutani Yukino;Iehata Shunpei;Mori Tetsushi;Oh Ryota;Fukuzaki Satoshi;Tanaka Reiji
通讯作者：
Tanaka Reiji

Exploration of uncultured Epsilonproteobacterium in/on the gills of shallow water invertebrates

浅水无脊椎动物鳃中/上未培养的ε变形杆菌的探索