ゲノム情報を基盤としたニホンミツバチの遺伝的多様性とその形成要因の解明

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本研究では、在来種ミツバチの保全および育種等の応用学的利用の促進によるミツバチ不足問題の解決を目的に、ゲノム情報を基盤としたニホンミツバチの遺伝的多様性とその形成要因に関する解析を進めた。本年度は、これまで継続してきた日本列島全域の計105個体の全ゲノムRe-seq解析に関して、パラメータの微調整や補足解析を重点的に実施した。最終的に構築できた多型情報のデータセットを元に、ADMIXTUREおよびPCAを用いた集団の遺伝構造の評価を行った結果、日本列島内の集団は、北部（東北・関東・中部地方）、中間（中国地方）、南部（九州地方）で異なる遺伝的分化を持ち、さらに、近畿および四国地方の個体は、各祖先型が混成した遺伝的組成を持つことが明らかとなった。また、複数の地域で、個体群の人為的な移入との関連が示唆される遺伝的組成を持つ個体の存在が確認できた。次に、集団特異的な分化（Population Branch Statistics）および環境変数との相関（LFMM）の2通りの指標を用いて、地域適応と関連する候補遺伝子をゲノムワイドに探索した。得られた候補遺伝子の中には、概日リズムやエネルギー代謝と関連する遺伝子のほか、免疫、神経、骨格系などと関連する機能遺伝子が複数含まれていた。本研究で得られた一連の成果は、ニホンミツバチの形質-遺伝相関を解明する基礎研究および保全や農業利用を目的とした応用研究など、多方面への接続が可能であると考えている。なお、本年度の後半には、得られた研究成果の総括を行い、投稿論文の執筆や学会発表等に取り組んだ。