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高温適応進化におけるプロテオスタシスネットワークの挙動とその機能の解明

阐明蛋白质稳态网络在适应高温进化中的行为和功能

基本信息

批准号：
20H03302
负责人：
岸本利彦
金额：
$ 10.98万
依托单位：
Toho University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20H03302/
关键词：
進化大腸菌プロテオスタシス高温適応進化

项目摘要

2022年度は下記の研究実績を得た。１）大腸菌高温適応進化と進化におけるネットワーク解析　2系統の大腸菌高温適応進化により48℃以上で増殖可能となった大腸菌株の至適増殖温度を解析し、第2系統の48.1℃適応株の至適増殖温度が45℃以上となり、実験室進化で中温菌である大腸菌が高温菌に進化したことが判明した。高温適応進化過程の大腸菌株のRNAseq解析、ゲノム解析を実施した。２）プロテオスタシス制御因子の変異機能解析　①高温適応進化で ORFに3箇所の変異が固定されたGroELに関して、全ての変異の組み合わせを持つGroEL遺伝子発現系をAnc株に導入・発現し、40℃での増殖特性を確認した。その結果、変異蓄積に従い高温での増殖様式が安定することが確認され、GroEL変異が高温での増殖にポジティブであることが確認された。②シャペロン系因子のターゲットタンパク質の網羅解析　Kernerの方法(Kerner, Cell, 2005)を用い、Hisタグ付きGroESの発現を行い、GroEL/ES複合体精製の検討を行った。その結果、各種変異型GroELを発現する高温適応進化株からのGroEL/ES複合体精製が確認された。　③RpoH変異による転写制御能ネットワーク変化の解析　高温適応進化過程におけるrpoH変異前後の大腸菌株を用いたRNAseq解析を行った。その結果、rpoH変異によりプロテオスタシス系８遺伝子全ての発現が上昇していた。その他の遺伝子群の発現は、rpoH変異による大きな影響を受けておらず、rpoH変異はプロテオスタシス系の発現上昇を行うことで、高温適応進化にポジティブな影響を与えていることが示唆された。　④プロテオスタシス系必須遺伝子変異前後のタンパク質構造変化をAlphaFold2解析し、変異により高温菌の相同タンパク質の構造に似る傾向があることが確認された。

In 2022, the Company recorded the results of its research and development. 1) EVOLUTION AND EVOLUTION OF E. COLI AT HIGH TEMPERATURE EVOLU RNAseq analysis and genome analysis of E. coli strains during thermophilic evolution were performed. 2) Analysis of the different functions of the control factors in the ORF under high temperature: ① The three differences in the ORF under high temperature are related to the fixation of GroEL, the combination of all the differences in the ORF under high temperature, and the establishment of GroEL gene generation system under high temperature. As a result, the growth rate of high temperature is stable, and the growth rate is stable. Kerner's method (Kerner, Cell, 2005) was used to analyze the quality of GroEL/ES complex. As a result, the GroEL/ES complex was purified and confirmed by the development of various heteromorphic GroEL strains adapted to high temperature. 3. RNA analysis of E. coli strains before and after RPOH mutation As a result, the rpoH is different, and the system is 8 years old. The development of other genetic subgroups is affected by the changes in temperature and temperature, and the development of genetic systems is affected by the changes in temperature and temperature. 4. The structural variation of the high temperature bacteria before and after the change of the structure of the high temperature bacteria must be analyzed by AlphaFold.