がん多様性をin situで見える化する解析プラットフォーム構築と臨床応用

癌症原位多样性可视化分析平台的构建及临床应用

• 批准号: 21K19414
• 负责人: 田中 伸之
• 金额: $ 4.16万
• 依托单位: Keio University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-07-09 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21K19414/
• 关键词: がん免疫ゲノミクス; 免疫微小環境; シークエンス; シングルセル; ライトシート顕微鏡; がん多様性; in situ

腫瘍免疫微小環境とゲノム不安定性を統合的に理解する「がん免疫ゲノミクス」研究は、バイオマーカー探索や複合的ながん免疫治療法の開発で、ポストがんゲノム時代の新しい潮流である。我々は、がん多様性を克服するロバストな研究プラットフォームとして、①最新のシングルセルシークエンスシステム、②独自の3次元イメージング法を有する。2022年度も2021年度と同様に、各プラットフォームを実装・融合させるための基盤整備に加えて、癌イメージングのモダリティとして最新な、multiplexed single-cell pathology (Vectra Polaris・Phenocycler)やVisium空間的遺伝子発現解析の実装も進めた。主な研究実績は、①尿路上皮がんCD73陽性T細胞の不均一性解析をmultiplexed single-cell pathologyで行い、膀胱がん微小環境におけるCD73発現と腫瘍免疫浸潤の関わりを明らかにした。特に細胞間距離の解析では、腫瘍空間のCD73+ CTLとCD73+Treg細胞は、それぞれCD73- CTLとCD73-Treg細胞と比較して、同一組織内のPD-L1+細胞から離れた場所に存在しており、CTL・Treg細胞の空間分布に対するCD73発現の影響が示唆された。また、②lncRNAと癌の関連は様々な癌種で報告され始めている。我々は、新規RNA 探索システムであるハイブリダイゼーションチェインリアクション（HCR）を用いて、ハイスループットな腫瘍内lncRNAの可視化プラットフォームを構築した。さらにHCRと膨張顕微鏡法(Expansion microscopy)を組み合わせることで、回折限界を超えたlncRNA発現評価を可能とする新規イメージングを確立した。

The study of immune microenvironment and immune instability in tumor is aimed at exploring the development of complex immune therapy and the new trend of immune therapy. We have to overcome the diversity of research methods,(1) the latest research methods,(2) the independent three-dimensional research methods. In 2022, the same type of DNA was used in 2021. The DNA was added to the DNA, and the DNA was added to the DNA. The DNA was added to the DNA. The main results of this study are as follows: ① Heterogeneous analysis of CD73-positive T cells in urothelia, multiplexed single-cell pathology, microenvironment of bladder, CD73 expression and tumor immune infiltration In particular, the analysis of cell-to-cell distance and the spatial distribution of CD73 + CTL and CD73 +Treg cells in tumor tissues were compared with that of CD73- CTL and CD73-Treg cells. The presence of PD-L1+ cells in the same tissue and the spatial distribution of CTL Treg cells affected the expression of CD73. IncRNA and cancer are related to each other. We propose to construct a new type of RNA detection system using the HCR. HCR and Expansion Microscopy are used to establish new methods for the detection of RNA.

项目成果

シングルセルから超高解像度ナノレベルまで:次世代イメージングで見て解る癌 微小環境の全容

从单细胞到超高分辨率纳米级：通过下一代成像看到癌症微环境的全貌

• 发表时间: 2021
• 作者: Grahn Alexandra;Tanaka Nobuyuki; Uhlen Per; Brehmer Marianne;田中 伸之
• 通讯作者: 田中 伸之

がん免疫療法時代における腎細胞癌バイオマーカー：がん免疫ゲノミクスの視点から

癌症免疫治疗时代的肾细胞癌生物标志物：从癌症免疫基因组学角度

• 发表时间: 2022
• 作者: Kufukihara Ryohei;Tanaka Nobuyuki;Takamatsu Kimiharu;Niwa Naoya;Fukumoto Keishiro;Yasumizu Yota;Takeda Toshikazu;Matsumoto Kazuhiro;Morita Shinya;Kosaka Takeo;Aimono Eriko;Nishihara Hiroshi;Mizuno Ryuichi;Oya Mototsugu;田中 伸之;田中 伸之
• 通讯作者: 田中 伸之

慶應義塾大学医学部 泌尿器科学教室ホームページ

庆应义塾大学医学院泌尿外科主页

Single-Cell Phenotyping of CD73 Expression Reveals the Diversity of the Tumor Immune Microenvironment and Reflects the Prognosis of Bladder Cancer

CD73表达的单细胞表型揭示肿瘤免疫微环境的多样性并反映膀胱癌的预后

• DOI: 10.1016/j.labinv.2022.100040
• 发表时间: 2023
• 期刊: Laboratory Investigation
• 影响因子: 5
• 作者: Izawa Mizuki;Tanaka Nobuyuki;Murakami Tetsushi;Anno Tadatsugu;Teranishi Yu;Takamatsu Kimiharu;Mikami Shuji;Kakimi Kazuhiro;Imamura Takeshi;Matsumoto Kazuhiro;Oya Mototsugu
• 通讯作者: Oya Mototsugu

Multiplexed single-cell pathology reveals the association of CD8 T-cell heterogeneity with prognostic outcomes in renal cell carcinoma

• DOI: 10.1007/s00262-021-03006-2
• 发表时间: 2021-07-14
• 期刊: CANCER IMMUNOLOGY IMMUNOTHERAPY
• 影响因子: 5.8
• 作者: Murakami, Tetsushi;Tanaka, Nobuyuki;Oya, Mototsugu
• 通讯作者: Oya, Mototsugu