がん多様性をin situで見える化する解析プラットフォーム構築と臨床応用

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腫瘍免疫微小環境とゲノム不安定性を統合的に理解する「がん免疫ゲノミクス」研究は、バイオマーカー探索や複合的ながん免疫治療法の開発で、ポストがんゲノム時代の新しい潮流である。我々は、がん多様性を克服するロバストな研究プラットフォームとして、①最新のシングルセルシークエンスシステム、②独自の3次元イメージング法を有する。2022年度も2021年度と同様に、各プラットフォームを実装・融合させるための基盤整備に加えて、癌イメージングのモダリティとして最新な、multiplexed single-cell pathology (Vectra Polaris・Phenocycler)やVisium空間的遺伝子発現解析の実装も進めた。主な研究実績は、①尿路上皮がんCD73陽性T細胞の不均一性解析をmultiplexed single-cell pathologyで行い、膀胱がん微小環境におけるCD73発現と腫瘍免疫浸潤の関わりを明らかにした。特に細胞間距離の解析では、腫瘍空間のCD73+ CTLとCD73+Treg細胞は、それぞれCD73- CTLとCD73-Treg細胞と比較して、同一組織内のPD-L1+細胞から離れた場所に存在しており、CTL・Treg細胞の空間分布に対するCD73発現の影響が示唆された。また、②lncRNAと癌の関連は様々な癌種で報告され始めている。我々は、新規RNA 探索システムであるハイブリダイゼーションチェインリアクション（HCR）を用いて、ハイスループットな腫瘍内lncRNAの可視化プラットフォームを構築した。さらにHCRと膨張顕微鏡法(Expansion microscopy)を組み合わせることで、回折限界を超えたlncRNA発現評価を可能とする新規イメージングを確立した。