In situな尿路上皮がん免疫ゲノミクス多様性解析とリキッドバイオプシーの確立

尿路上皮癌原位免疫基因组多样性分析和液体活检的建立

• 批准号: 22H03217
• 负责人: 田中 伸之
• 金额: $ 11.23万
• 依托单位: Keio University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22H03217/
• 关键词: 腫瘍内不均一性; 多様性解析; がん免疫ゲノミクス; 尿路上皮がん; リキッドバイオプシー

腫瘍免疫微小環境とゲノム不安定性の統合的に理解する「がん免疫ゲノミクス」は、がん免疫研究でポストがんゲノム時代の新しい潮流である。我々が試みる次世代シークエンス・がんイメージングの融合は、難治性尿路上皮がんにおいて立体的ながん多様性を単一細胞レベルで可視化し、がん免疫ゲノミクスビックデータに革新性を与える。すなわち、不均一ながん免疫ゲノミクスも、癌細胞をin situ (本来存在する場所)で再現することが可能でありる。最終的に我々は、先端のリキッドバイオプシー技術を用いて、世界初のがん免疫ゲノミクス超低侵襲バイオマーカーを、前向き研究で確立することを目標とする。腫瘍組織内で、遺伝学的情報と空間トランスクリプトームを細胞レベルで追跡・融合することは、一人の人間の臓器間および臓器内に存在する複雑なクローン系譜を明らかにし、同一個体内でサブクローン毎に異なる免疫抑制環境がどのように構築・存在するかが「見て分かる」ようになると考える。初年度である令和４年度は、尿路上皮がん剖検組織を用いて、免疫療法後に生存するサブクローンと生息ニッチを細胞レベル・in situ (本来存在する場所)で明らかにした。空間トランスクリプトームとゲノムデータを融合し、最新のVisium 遺伝子発現解析上で標的サブクローンを同定するアルゴリズム構築を、Lasso 法を独自に派生させ成功した。この試みは、標的サブクローンのトランスクリプトーム解明に加えて、サブクローンの空間的位置が間質の不均一性にどのような影響を与えるかを明らかにすると考える。

A new trend in the era of immune research is to understand the integration of tumor immune microenvironment and instability. We try to create a new generation of fusion, refractory urothelia, three-dimensional diversity, single cell, visualization, immunity and innovation. It is possible to reproduce cancer cells in situ. The ultimate goal is to establish a new, advanced, and ultra-invasive immune system. The information and genetic information in tumor tissue, space and tissue, cell cycle, tracing, fusion, and the existence of multiple genes in different organs of a person, and the existence of different immunosuppressive environments in the same body, constitute a genealogy. In the first year and the fourth year, the urothelia were dissected, and the cells were cultured in situ after immunotherapy. The spatial distribution model is integrated with the latest Vidium gene discovery model, and the spatial distribution model is independently derived from the Lasso model. The spatial position of the object and the heterogeneity of the interstitial space affect the results of the study.

项目成果

慶應義塾大学医学部 泌尿器科学教室ホームページ

庆应义塾大学医学院泌尿外科主页

がん免疫療法時代における腎細胞癌バイオマーカー：がん免疫ゲノミクスの視点から

癌症免疫治疗时代的肾细胞癌生物标志物：从癌症免疫基因组学角度

• 发表时间: 2022
• 作者: Kufukihara Ryohei;Tanaka Nobuyuki;Takamatsu Kimiharu;Niwa Naoya;Fukumoto Keishiro;Yasumizu Yota;Takeda Toshikazu;Matsumoto Kazuhiro;Morita Shinya;Kosaka Takeo;Aimono Eriko;Nishihara Hiroshi;Mizuno Ryuichi;Oya Mototsugu;田中 伸之;田中 伸之
• 通讯作者: 田中 伸之

Prognostic role of the innate immune signature CD163 and “eat me” signal calreticulin in clear cell renal cell carcinoma

先天免疫特征 CD163 和“吃我”信号钙网蛋白在透明细胞肾细胞癌中的预后作用

• DOI: 10.1007/s00262-023-03369-8
• 发表时间: 2023
• 期刊: Cancer Immunology, Immunotherapy
• 作者: Anno Tadatsugu;Tanaka Nobuyuki;Takamatsu Kimiharu;Hakozaki Kyohei;Kufukihara Ryohei;Baba Yuto;Takeda Toshikazu;Matsumoto Kazuhiro;Morita Shinya;Kosaka Takeo;Mikami Shuji;Nishihara Hiroshi;Mizuno Ryuichi;Oya Mototsugu
• 通讯作者: Oya Mototsugu

微小環境から考える泌尿器がんの異質性：複合がん免疫療法の最適化

从微环境考虑泌尿系癌症的异质性：癌症免疫联合治疗的优化

• 发表时间: 2022
• 作者: Kufukihara Ryohei;Tanaka Nobuyuki;Takamatsu Kimiharu;Niwa Naoya;Fukumoto Keishiro;Yasumizu Yota;Takeda Toshikazu;Matsumoto Kazuhiro;Morita Shinya;Kosaka Takeo;Aimono Eriko;Nishihara Hiroshi;Mizuno Ryuichi;Oya Mototsugu;田中 伸之
• 通讯作者: 田中 伸之

Hybridisation chain reaction-based visualisation and screening for lncRNA profiles in clear-cell renal-cell carcinoma

• DOI: 10.1038/s41416-022-01895-3
• 发表时间: 2022-06-28
• 期刊: BRITISH JOURNAL OF CANCER
• 影响因子: 8.8
• 作者: Kufukihara, Ryohei;Tanaka, Nobuyuki;Oya, Mototsugu
• 通讯作者: Oya, Mototsugu