Establishment of rapid functional diagnosis of genome information and its application to cancer precision medicine

基因组信息快速功能诊断的建立及其在肿瘤精准医疗中的应用

• 批准号: 21K19444
• 负责人: 醍醐 弥太郎
• 金额: $ 3.99万
• 依托单位: Shiga University of Medical Science
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-07-09 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21K19444/
• 关键词: ゲノム機能診断; がんプレシジョン医療

多数の癌患者の核酸試料を用いたゲノム解析やトランスクリプトーム解析等のオミックス解析により、数多くの癌関連遺伝子の構造的、機能的多様性に基づく発癌・進展機構が明らかにされつつあるが、一方で、その機能検証に必要となる遺伝子変化の蓄積の生物学的影響を正確にヒト細胞で再現できるアッセイ系は確立されていない。大規模癌ゲノム解析やゲノム医療等において同定される遺伝子変化等の高速機能評価が可能になればゲノム情報の質的診断法の開発基盤となることが期待される。そこで、癌の発生や進展に関わる遺伝子変化をアッセイ構築モデルとして、（1）複数の遺伝子変化の体系的機能解析に利用可能な迅速遺伝子導入技術と機能検証アッセイの確立と（2）遺伝子変化の数的・質的変化等のゲノム情報の高速機能評価に基づいた癌のリスク診断法とプレシジョン医療の開発基盤の構築等に向けた基盤的な解析を行った。令和4年度は、前年度に引き続き、第１段階の癌関連遺伝子を分子モデルとした各種の遺伝子制御技術により遺伝子機能をヒト細胞株内で増減するアッセイを行い、並行して、遺伝子変化の高速機能評価に基づいた生物学的診断と創薬スクリーニングに応用可能なcell-based assayを実施した。また、第2段階の癌関連遺伝子の機能を制御した細胞を迅速に作成するアッセイを行った。さらに、第3段階として、多様な遺伝子変化の高速機能評価系と診断・治療応用基盤の構築に向けて、遺伝子機能をヒト細胞株内で制御した条件下で細胞の各種表現型の検討と下流分子の探索に向けたアッセイの検討を行った。

The analysis of nucleic acid samples from most cancer patients is necessary to determine the structural and functional diversity of many cancer-related genes, the biological effects of gene transformation and accumulation, and the correct cellular reproduction. A high-speed functional evaluation of the diagnosis of large-scale cancer, such as analysis, diagnosis, diagnosis, etc., is expected. The development and progression of cancer is related to the transformation of the gene into a new gene.(1) Functional analysis of multiple gene transformation systems using possible rapid gene introduction techniques, functional identification, and establishment;(2) High-speed functional evaluation of information, such as quantitative and qualitative transformation of gene transformation; and analysis of cancer diagnosis, diagnosis, and construction of medical development bases. In 2010 and 2014, the first stage of cancer-related gene expression was introduced into the molecular system of various gene control technologies, and the gene function was enhanced in cell lines. In parallel, the rapid functional evaluation of gene transformation, basic biological diagnosis, and gene innovation were carried out. The function of the second stage cancer-related gene is controlled by the cell. In addition, in the third stage, high-speed functional evaluation of multi-gene transformation is carried out in the construction of diagnostic and therapeutic substrates, and in the investigation of various phenotypes of cells and downstream molecular exploration in cell lines.

项目成果

Holliday junction recognition protein as a prognostic biomarker and therapeutic target for oral cancer

霍利迪连接体识别蛋白作为口腔癌的预后生物标志物和治疗靶点

• DOI: 10.3892/ijo.2022.5316
• 发表时间: 2022
• 期刊: International journal of oncology
• 影响因子: 5.2
• 作者: Bayarbat Tsevegjav;Atsushi Takano;Ming Zhu;Yoshihiro Yoshitake;Masanori Shinohara;Yataro Daigo
• 通讯作者: Yataro Daigo

Acceleration of cancer research by effective use of human biobanks and integrative omics technologies

通过有效利用人类生物库和综合组学技术加速癌症研究

• 发表时间: 2022
• 作者: Bayarbat Tsevegjav;Atsushi Takano;Ming Zhu;Yoshihiro Yoshitake;Masanori Shinohara;Yataro Daigo;醍醐 弥太郎;Yataro Daigo
• 通讯作者: Yataro Daigo

Characterization of Opa interacting protein 5 as a new biomarker and therapeutic target for oral cancer

Opa 相互作用蛋白 5 作为口腔癌新生物标志物和治疗靶点的表征

• DOI: 10.3892/ijo.2022.5317
• 发表时间: 2022
• 期刊: International journal of oncology
• 影响因子: 5.2
• 作者: Nishikimi M;Ogura T;Nishida K;Hayashida K;Emoto R;Matsui S;Matsuda N;Iwami T;Ming Zhu Atsushi Takano Bayarbat Tsevegjav Yoshihiro Yoshitake Masanori Shinohara Yataro Daigo
• 通讯作者: Ming Zhu Atsushi Takano Bayarbat Tsevegjav Yoshihiro Yoshitake Masanori Shinohara Yataro Daigo

生体試料による支援活動

使用生物样本支持活动

• 发表时间: 2022
• 作者: 大橋りえ;藤井一希;高雄啓三;椎名伸之;醍醐 弥太郎
• 通讯作者: 醍醐 弥太郎