The elucidation of regulatory mechanism of molecular network on RNA virus infection in diffuse- and intestinal-type gastric cancer

弥漫型和肠型胃癌RNA病毒感染分子网络调控机制的阐明

• 批准号: 21K12133
• 负责人: 田邊 思帆里
• 金额: $ 2.25万
• 依托单位: National Institute of Health Sciences
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21K12133/
• 关键词: 分子ネットワーク; がん; RNAウィルス; ネットワーク解析; 上皮間葉転換; パスウェイ; EMT; がん幹細胞

胃がんにはびまん型胃がんと腸型胃がん等のいくつかのサブタイプが知られている。びまん型胃がんは、抗がん剤耐性を有し転移や再発等に至るなど、腸型胃がんに比較して悪性度が高いことが知られている。びまん型胃がんの悪性化にはがん幹細胞や上皮間葉転換(Epithelial-mesenchymal transition; EMT)が関与していることが知られており、抗がん剤耐性や治療薬ターゲット、治療薬安全性に関する知見を得る上では、その分子ネットワークを解析する必要がある。びまん型胃がんと腸型胃がんのネットワークを解析したところ、RNAウィルス感染に関する制御ネットワークが得られたことから、がんとRNAウィルス感染との関連性について本研究において詳細を検討することを目的とした。公開データベース上の胃がん遺伝子発現データを用いて変動遺伝子群を同定した。RNAウィルス感染及びがん関連分子をIngenuity Pathway Analysis(IPA)等のネットワーク解析ツールを用いて解析し、RNAウィルス感染メカニズムに関連する分子ネットワークを明らかとした。Regulatory effect解析により、びまん型胃がんにおけるRNAウィルス感染ネットワークの関与が明らかになった。コロナウィルス病態パスウェイに関連する合計22,959解析が同定され、最も活性化スコアが高かった解析は腹膜中のM2マクロファージに関する解析であり、最も活性化スコアが低かった解析は末梢血中のB細胞に関する解析であった。EMTネットワークの活性化を予測するAIモデルを作成し、論文発表した。本研究によりRNAウィルス感染メカニズムとびまん型胃がんとの関連性が示唆され、その詳細を明らかにすることによりウィルス感染制御やがん創薬に繋がる可能性がある。

Stomach が ん に は び ま ん type gastric が ん と intestinal type gastric が ん etc. の い く つ か の サ ブ タ イ プ が know ら れ て い る. Type び ま ん stomach が ん は, resisting が ん tonic patience を have し planning move や 発 again に to る な ど, intestinal type gastric が ん に compare し て 悪 high degree of sexual が い こ と が know ら れ て い る. Youdaoplaceholder0 type gastric がん がん 悪 悪 Epithelial-mesenchymal transition に がん がん stem cells や epithelial-mesenchymal transition; EMT) が masato and し て い る こ と が know ら れ て お り, resisting が ん tonic patience や treatment 薬 タ ー ゲ ッ ト, treatment 薬 security に masato す る knowledge を up る で は, そ の molecular ネ ッ ト ワ ー ク を parsing す る necessary が あ る. Type び ま ん stomach が ん と intestinal type gastric が ん の ネ ッ ト ワ ー ク を parsing し た と こ ろ, RNA ウ ィ ル ス infection に masato す る suppression ネ ッ ト ワ ー ク が must ら れ た こ と か ら, が ん と RNA ウ ィ ル ス infection と の masato even sex に つ い て in this study に お い て detailed を beg す 検 る こ と を purpose と し た. On public デ ー タ ベ ー ス の stomach が ん heritage 伝 son 発 now デ ー タ を with い て - move legacy 伝 subgroup を with fixed し た. RNA ウ ィ ル ス infection and び が ん masato even molecular を Ingenuity Pathway Analysis (IPA) の ネ ッ ト ワ ー ク parsing ツ ー ル を with い て parsing し, RNA ウ ィ ル ス infection メ カ ニ ズ ム に masato even す る molecular ネ ッ ト ワ ー ク を Ming ら か と し た. Regulatory effect analytical に よ り, び ま ん type gastric が ん に お け る RNA ウ ィ ル ス infection ネ ッ ト ワ ー ク の masato Ming ら が か に な っ た. コ ロ ナ ウ ィ ル ス pathological パ ス ウ ェ イ に masato even す る analytical が amounted to 22959 with fixed さ れ, most も activeness ス コ ア が high か っ た analytic は peritoneal の M2 マ ク ロ フ ァ ー ジ に masato す る parsing で あ り, most も activeness ス コ ア が low か っ た parsing は の B cells in peripheral blood に masato す る parsing で あ っ た. EMTネットワ ネットワ activation を pretest するAIモデ を を preparation た, paper release form た た. This study に よ り RNA ウ ィ ル ス infection メ カ ニ ズ ム と び ま ん type gastric が ん と の masato even sex が in stopping さ れ, そ の detailed を Ming ら か に す る こ と に よ り ウ ィ ル ス infection suppression や が ん gen 薬 に 繋 が る possibility が あ る.

项目成果

びまん型及び腸型胃がんにおけるRNAウィルスネットワークの分子ネットワーク解析

弥漫型和肠型胃癌RNA病毒网络的分子网络分析

• 发表时间: 2021
• 作者: 田邊 思帆里;Quader Sabina;小野 竜一;Cabral Horacio;青柳 一彦;広瀬 明彦;狩野 光伸;横崎 宏;佐々木 博己
• 通讯作者: 佐々木 博己

cfDNAによる毒性評価

使用 cfDNA 进行毒性评估

• 发表时间: 2022
• 作者: 小野竜一;山本 雄介;成瀬 美衣;田邊 思帆里;吉岡 祐亮;相崎 健一;広瀬 明彦;落谷 孝広;平林 容子;北嶋 聡
• 通讯作者: 北嶋 聡

Relationship between Immune Checkpoint Inhibitors and Myocarditis

免疫检查点抑制剂与心肌炎的关系

• DOI: 10.52793/acmr.2022.3
• 发表时间: 2022
• 期刊: Advances in Clinical and Medical Research
• 作者: 山田雄大;平山和浩;藤井佑樹;吉田達貞;Takeshi Ishikawa;Shihori Tanabe
• 通讯作者: Shihori Tanabe

Report of the 1st and 2nd Mystery of Reactive Oxygen Species Conferences

第一届、第二届活性氧之谜会议报告

• DOI: 10.14573/altex.2203011
• 发表时间: 2022
• 期刊: ALTEX - Alternatives to animal experimentation
• 作者: Shihori Tanabe,Danielle Beaton,Vinita Chauhan;et al.
• 通讯作者: et al.

Adverse Outcome Pathways (AOPs) for celiac disease towards next generation risk assessment of innovative proteins

乳糜泻的不良结果途径 (AOP) 通往下一代创新蛋白质风险评估

• 发表时间: 2022
• 作者: Shihori Tanabe,Youngjun Kim,Alicia Paini;et al.;田邊思帆里;Clemens Wittwehr,Brigitte Landesmann,Dan Villeneuve,Michelle Angrish,Jason O'Brien,Bette Meek,Annamaria Carusi,Shihori Tanabe,Ginnie Hench,Steve Edwards,Nathalie Delrue;田邊思帆里;田邊 思帆里,カデール サビーナ,小野 竜一,カブラル オラシオ,青柳 一彦,広瀬 明彦,横崎 宏,佐々木 博己;道前 洋史;Antonio Fernandez Dumont,Estefania Noriega Fernandez,Frits Koning,Javier Moreno,Shihori Tanabe
• 通讯作者: Antonio Fernandez Dumont,Estefania Noriega Fernandez,Frits Koning,Javier Moreno,Shihori Tanabe