エピジェネティクスおよび細菌叢解析に基づくOral Aging Clockの開発

基于表观遗传学和微生物群分析的口腔衰老时钟的开发

• 批准号: 22K10296
• 负责人: 植原 治
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Health Sciences University of Hokkaido
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K10296/
• 关键词: 細菌叢解析; DNAメチル化解析; エイジングクロック; マイクロバイオーム; エピジェネティクス

DNAメチル化レベルより求めた生物学的年齢（Epigenetic Aging Clock）は、近年、有力な老化の指標の一つとして考えられはじめている。Epigenetic Aging Clockは、種々の細胞でもエピジェネティクス的年齢の顕著な相関性が示唆されている。しかし、口腔スワブでは、他臓器や細胞よりも相関性がないことも示されている。免疫系と多くの口腔疾患との相互作用の特徴は十分に解明されているが、口腔疾患を発症するリスクが非常に高い人を予測するために使用できる免疫指標は、極めて少ない。口腔疾患を考慮した老化年齢を予測するには、宿主および病原性因子の両因子に基づいたAging Clockを開発することが望ましい。本年度は、マウスのOral Aging Clockを開発する上で重要となる口腔細菌叢解析を行った。P. gingivalisの投与による若年マウス（10週齢）および高齢マウス（80週齢）の口腔細菌叢の変化をQIIME2を用いて解析した（α多様性observed features、shannon、faith pd；β多様性weighted unifrac、unweighted unifrac；ANCOM）。若年マウスおよび高齢マウスを比較したところα多様性（observed features、shannon、faith pd）、β多様性（weighted unifrac、unweighted unifrac）の変化は認められたが、ANCOMによる細菌属の変化は認められなかった。高齢マウスよりも若年マウスの方がP. gingivalisによる口腔細菌叢の変化を影響を受けやすいことが明かになった。一方、採血したサンプルのエイジングクロックについては明かにすることができなかった。

DNA is a biological Aging Clock, and in recent years, it is a powerful aging indicator. Epigenetic Aging Clock is a new type of genetic clock. The relationship between oral cavity and other organs and cells is discussed in detail. The characteristics of the interaction between the immune system and oral diseases are very clear, and the symptoms of oral diseases are very high, and the immune indicators are very low. Oral diseases are considered to be age-related, host and pathogenic factors, and Aging clocks are expected to be developed. This year, the Oral Aging Clock was launched. QIIME2 analysis of changes in oral flora of P. gingivalis (α-polytropic observed features, Shannon, faith pd;β-polytropic weighted uniform, unweighted uniform;ANCOM) If the year is too high, the alpha diversity (observed features, Shannon, faith pd), the beta diversity (weighted uniform, unweighted uniform) and the ANCOM genus are different. High Gingivalis is affected by changes in the oral flora. A party, blood collection, collection, collection