Geräteeinheit für die Sequenzierung und Auftrennung genomischer Fragmente sowie für die quantitative PCR-Analyse

用于基因组片段测序和分离以及定量 PCR 分析的设备单元

• 批准号: 57259082
• 金额: --
• 依托单位: Universität Ulm
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Major Research Instrumentation
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2007-12-31 至 无数据
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/57259082?language=en
• 关键词: Ger; teeinheit; die; Sequenzierung; und

Ein wesentlicher Schwerpunkt der Forschungsprojekte der Klinik für Innere Medizin IM ist die Identifizierung von molekularen Pathomechanismen und neuen Biomarkern bei akuten und chronischen Leukämien im Erwachsenenalter. Hierzu werden moderne molekulargenetische Methoden wie die Sequenzanalyse, die quantitative Genexpressionsanalyse, sowie unterschiedliche array-basierte Techniken eingesetzt. Aus den laufenden Forschungsprojekten, insbesondere den array-basierten Analysen werden eine Vielzahl potentieller Kandidatengene identifiziert, die sowohl mittels Sequenzanalyse, als auch quantitativer Expressions-Analyse auf Einzelgen-Niveau auf ihre pathogenetische Bedeutung untersucht werden müssen (z.B. gene dosage effect, Zygotie-Status). Darüber hinaus lassen sich sowohl bei den akuten als auch bei den chronischen Leukämien eine Reihe von leukämie-relevanten Genaberrationen nachweisen, mit deren Hilfe genetische Risikoprofile erstellt werden. Die beantragte Geräteeinheit ist für die Durchführung dieser Analysen (Mutationsanalysen, quantitative Expressionsanalysen auf Einzelgenniveau) vorgesehen. Mit Hilfe des DNA-Sequenzers können genomische Fragmente bis zu einer Länge von 900 bp mit hoher Sensitivität im Hochdurchsatzverfahren sequenziert und somit große Gene/Genabschnitte auf Mutationen analysiert, sowie genomische Fragmente unterschiedlicher Länge aufgetrennt werden. Da Genmutationen häufig zu einer deregulierten Genexpression führen, bzw. die Überexpression von Genen Folge einer Mutation sein kann, ist die Durchführung beider Techniken in einem Großteil der zu untersuchenden Gene obligat. Für die quantitative Expressionanaiyse auf Einzelgen-Niveau wird ein Real Time PCR System verwendet, das eine hochsensitive Quantifizierung (RQ-PCR) der Expression von Genfusionsprodukten oder einzelnen Genen erlaubt.

[2] [1] [1] [1] [1] [1] [1] [1] [1] [1] [1] [1] [1] [1] [1] [1] [1] [1] [1] [1] [1] [1] [4]现代分子遗传学方法，基因序列分析，基因表达定量分析，非分子遗传学方法，阵列技术。Aus den laufenden Forschungsprojekten， insbesonere den阵列-基础分析werden eine Vielzahl潜在基因鉴定，die sowohl mitteles序列分析，als auch定量表达-分析auf Einzelgen-Niveau auf ihre致病机制Bedeutung untersucht werden m<s:1> ssen （z.B.基因剂量效应，合格状态）。darber hinaus lassen sich sowohl bei den akuten也auch bei den chronischen Leukämien eine Reihe von leukämie-relevanten Genaberrationen nachweisen， mit deren hilife genetische risikprofile erstellt werden。Die beantragte Geräteeinheit ist f<e:1> r Die durchf<e:1> hrung dieser Analysen (Mutationsanalysen, quantitative Expressionsanalysen auf inzelgenniveau) vorgeshen。Mit hilife des DNA-Sequenzers können genomische Fragmente bis zu einer Länge von 900 bp Mit hoher Sensitivität im Hochdurchsatzverfahren sequenziert und somit grose ße Gene/Genabschnitte auf Mutationen analyert, sowie genomische Fragmente unterschiedlicher Länge augetrent werden。Da Genmutationen häufig zu einer去调控基因表达<e:1> [j], bzw。1 . die Überexpression von Genen Folge einer Mutation sein kann, 1 . die durchfhung beider Techniken in einem gros . teil der der undertersuchenden Gene bilat。在实时荧光定量PCR系统（Real Time PCR System）中，采用荧光定量PCR （RQ-PCR）技术对基因进行定量表达。

项目成果

Gene expression factors as predictors of genetic risk and survival in chronic lymphocytic leukemia

• DOI: 10.3324/haematol.2009.010298
• 发表时间: 2010-01-01
• 期刊: HAEMATOLOGICA-THE HEMATOLOGY JOURNAL
• 作者: Kienle, Dirk;Benner, Axel;Stilgenbauer, Stephan
• 通讯作者: Stilgenbauer, Stephan

Synergy between PI3K signaling and MYC in Burkitt lymphomagenesis.

• DOI: 10.1016/j.ccr.2012.06.012
• 发表时间: 2012-08-14
• 期刊: Cancer cell
• 影响因子: 50.3
• 作者: Sander S;Calado DP;Srinivasan L;Köchert K;Zhang B;Rosolowski M;Rodig SJ;Holzmann K;Stilgenbauer S;Siebert R;Bullinger L;Rajewsky K
• 通讯作者: Rajewsky K