固相培養条件下の麹菌における遺伝子の動的発現制御機構の解明とその応用

固相培养条件下曲霉动态基因表达调控机制的阐明及其应用

• 批准号: 22K05405
• 负责人: 兒島 孝明
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Meijo University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K05405/
• 关键词: Aspergillus oryzae; 発酵生産; バイオインフォマティクス; トランスクリプトーム; 麹菌; 発酵

本研究では、A. oryzaeの固体培養における遺伝子発現動態の包括的理解とその技術基盤構築を目的として研究期間1年目に以下のアプローチを実施した。・SC条件下のA. oryzaeにおけるmRNAレベルでの動的転写制御機構のデータベース構築の予備検討SC培養後のA. oryzaeより抽出したRNAを用いることで一定時間ごとの遺伝子発現動態をトレースできるかどうかの予備検討を実施した。A. oryzae野生株を寒天プレート上で培養し、植菌後3日後から7日後まで1日おきに菌体を回収した。これらの菌体よりRNAを抽出し、高速DNAシーケンサーによって各培養時間ごとのA. oryzae全遺伝子の発現データを取得した。取得した発現動態をもとにクラスタリングを実施し、類似発現パターンを示す遺伝子群をグループ化した。各クラスター中の遺伝子の機能を精査したところ、一つのクラスターでは過半数がリボソームタンパク質で構成されていた。この結果は、サンプリングからRNA-Seq、クラスタリングに至る一連の作業工程の適切さを示すものであった。

In the course of this study, A. oryzae solid-state training program includes the understanding of the basic technology and objectives of the study period of one year. Under the condition of SC, the writing system of A. Oryzae system is responsible for the operation of the SC system. After the SC training, the oryzae system pulls out the RNA system for a certain period of time to detect the state of the operation. A. the wild strain of oryzae was cultured in cold weather. 3 days later, 7 days later, 1 day later, the bacteria returned to the plant. The bacteria can be extracted by RNA, and the whole culture time can be obtained by using high-speed DNA. The whole cycle of oryzae can be obtained. Get the information that you need to know that you are going to change the status of the subgroup. In all the hospitals, the sub-machine can be used to make sure that more than half of them are in the market at a time, and that more than half of them are successful. The results of the test, the operation results, the results and the results.