種子の胚数多様性を支配する分子基盤の解明

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令和4年度は，まず多胚性および単胚性の遺伝子発現プロファイルを明らかにするため，RNA-seq解析を進めた。多胚性と単胚性系統を交雑して育成したF3系統群から，多胚性および単胚性を示す各3個体のバルクをそれぞれ3セットずつ準備した。これらの花序先端（多胚性と単胚性の形態が分化する領域を含むと期待される）から全RNAを抽出し，RNA-seq解析を行った。現在得られたデータの分析を進めているが，多胚性で発現量が5倍以上多い転写産物が約70種，逆に単胚性で発現量が5倍以上多い転写産物が約100種得られている。多胚性で発現量の多い転写産物にはF-boxタンパク質遺伝子や細胞分裂に関わる遺伝子をコードすると想定されるものや，ncRNAと予想されるものが複数含まれていた。これらの内いくつかは多胚性遺伝子Mが座乗すると報告されている第4染色体に由来していた。次に，単胚性種子の中に2 個の果実が融合した二胚種子が混在する二胚性について，遺伝解析の準備を進めた。二胚種子率の高い二胚性系統と単胚性系統のF2分離集団について採種用母根を養成した。収穫した母根をガラス温室に定植し，約60個体から自殖種子を採種するとともにゲノムDNAを取得した。採種した種子の分析を現在進めているが，採種前の花の着生状況から，二胚種子率がよく分離していると期待される。すでに採種およびDNA抽出が完了している70個体（二胚種子率が 0～66.5%で連続分布することを確認済み）と合わせて，今後解析を進める。