ORNi-PCR法によるリンゴ黒星病菌における防除剤耐性変異株の高速検出法の開発

ORNi-PCR法快速检测苹果黑星病抗药突变株的方法

基本信息

  • 批准号:
    22K05644
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.66万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 财政年份:
    2022
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2022-04-01 至 2025-03-31
  • 项目状态:
    未结题

项目摘要

リンゴ黒星病は青森県の基幹産業であるリンゴ栽培に甚大な被害をもたらし、近年多発傾向にある。防除剤として、黒星病菌のCYP51A1遺伝子がコードする蛋白質が持つ脱メチル化活性の阻害剤(DMI剤)が用いられるが、同遺伝子の一塩基変異により複数のDMI剤耐性変異株が出現する。よって、防除剤散布に先立ち変異株の有無や変異塩基の特定が必要だが、現行の手法はこれらの判別に一~数ヶ月を要するため、より迅速な手法が求められている。研究代表者らは、Oligoribonucleotide (ORN) interference-PCR(ORNi-PCR)法が様々な遺伝子の一塩基変異を迅速・簡便に特定できることを示してきた。本研究は、黒星病の早期防除法の開発に向けて、ORNi-PCRによるCYP51A1遺伝子の一塩基変異検出法を確立し、約2時間で変異株を特定できるシステムの構築を目的とする。CYP51A1遺伝子は、DMI剤耐性を示す4種類の一塩基変異によるアミノ酸配列の変異型(Y133F、M141I、E206Q、G427R)を生じる。2022(令和4)年度は、野生型および各変異型を判別するORNi-PCR反応条件を検討した。その結果、野生型CYP51A1遺伝子の増幅をORNによって抑制し、各変異型のみ特異的に増幅するORNi-PCR反応条件を決定した。これにより、ORNi-PCR法によるCYP51A1遺伝子型の判別が可能となった。
In recent years, there has been a tendency for the development of the basic industries in Aomori. The CYP51A1 gene of Pseudomonas sp. is protected against the presence of a protein inhibitor (DMI agent) that maintains the activity of the protein. To prevent the spread of the disease, it is necessary to determine whether there is a different gene in the plant, and to determine the current method. The representative of the research team, Oligonucleotide (ORN) interference-PCR (ORNi-PCR) method for the identification of genetic diversity, rapid, simple and specific, was shown. This study aimed to establish a novel method for the identification of CYP51A1 gene by ORNi-PCR for the development of early disease prevention. CYP51A1 gene expression and DMI resistance showed that four kinds of acid alignment variants (Y133F, M141I, E206Q, G427R) were produced. 2022 (Order 4) ORNi-PCR reaction conditions were discussed to distinguish between wild type and heterotype. The results showed that ORN inhibition and ORNi-PCR reaction conditions for wild-type CYP51A1 gene amplification were determined. The CYP51A1 gene polymorphism can be distinguished by ORNi-PCR.

项目成果

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清水 武史其他文献

ペルオキシソーム増殖剤高感受性ラットのM2型Kupffer 細胞におけるPhospholipase A2の発現
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    清水 武史;七島 直樹;澤野 武行;山田 俊幸;土田 成紀
  • 通讯作者:
    土田 成紀
Phospholipase A2 group IVcはLipocalin 2の誘導するアポトーシスを抑制して授乳期におけるラットの乳腺を維持する
磷脂酶 A2 IVc 组抑制脂质运载蛋白 2 诱导的细胞凋亡并在哺乳期间维持大鼠乳腺。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    七島 直樹;山田 俊幸;清水 武史;澤野 武行;土田 成紀
  • 通讯作者:
    土田 成紀
Impaired function of follicular helper T cells associated with loss of expression of the NK cell receptor gene, Klra17, from CD4-positive T cells
滤泡辅助 T 细胞功能受损与 CD4 阳性 T 细胞的 NK 细胞受体基因 Klra17 表达缺失相关
  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    山田 俊幸;七島 直樹;清水 武史;澤野 武行;土田 成紀
  • 通讯作者:
    土田 成紀
余事象分布を導入した近似GMMに基づくFPGA実装指向型未学習クラス推定ニューラルネット
引入共事件分布的基于近似GMM的面向FPGA实现的未训练类估计神经网络
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    植草 秀明;島 圭介;迎田 隆幸;清水 武史
  • 通讯作者:
    清水 武史
南西太平洋から得られたシロカサゴ科ヤセアカカサゴ属の2未記載種
两种未描述的蝎科蝎属物种,产自西南太平洋。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    植草 秀明;島 圭介;迎田 隆幸;清水 武史;和田英敏・瀬能 宏・本村浩之
  • 通讯作者:
    和田英敏・瀬能 宏・本村浩之

清水 武史的其他文献

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开发利用技术可视化苹果腐烂病受影响区域的诊断方法
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    23K05471
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    2023
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    $ 2.66万
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    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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