ネコブセンチュウゲノムの可塑性とサツマイモ病原性レースとの関連

线虫基因组可塑性与甘薯致病小种的关系

• 批准号: 22K05660
• 负责人: 浅水 恵理香
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Ryukoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K05660/
• 关键词: ネコブセンチュウゲノム解読; サツマイモ形質転換; 植物寄生性線虫; ネコブセンチュウ; ゲノム可塑性; サツマイモ; 病原性レース

植物寄生性線虫は、世界的に農業の重要害虫である。中でもネコブセンチュウとシストセンチュウによる被害は甚大であり、毎年作物収穫の約14％がこれらの線虫害によって失われている。対策は、殺線虫剤や土壌薫蒸剤を使用する化学的防除に頼られており、環境への悪影響が懸念されている。トマトなど一部の作物を除いて線虫抵抗性品種の育成は進んでおらず、安全かつ持続的な生物的防除方法を確立するには、線虫と植物の相互作用メカニズムの包括的理解が、急務となっている。本研究では、国内のサツマイモ圃場で被害の多いサツマイモネコブセンチュウに着目し、宿主サツマイモとの相互作用に関わる遺伝子群を明らかにすることを目的としている。我々は先行研究において、サツマイモネコブセンチュウゲノムには感染に関わる遺伝子が集積する「ホットスポット」が存在することを示した。この領域のハプロタイプを明らかにするため、サツマイモネコブセンチュウ2系統について、PacBio HiFiロングリードによるゲノム解読を行った。アセンブルの結果、それぞれ約150Mbのホモ接合領域の他に、80Mbのヘテロ接合領域が見出された。これは、予測ゲノムサイズとほぼ一致してより、真の染色体構造に近いアセンブルが得られたと考えられる。線虫病原レースであるSP (Sweet Potato) レースと宿主であるサツマイモとの関連について、2022年度には遺伝子機能解析に向けたサツマイモ形質転換系の立ち上げを行った。Ohtaniら (1996) の手法を参考にして、SPレース検定用の5品種ならびに、形質転換好適品種 (高系14号系'鳴門金時')を材料に用いて、無菌培養した茎から茎頂を切り出し、カルス誘導を行った。これらのカルスを用いて、アグロバクテリウム法による形質転換を進める計画である。

Plant parasites are important agricultural pests in the world. The annual crop yield is about 14%, and the annual crop yield is about 10%. The chemical control of the use of pesticides and pesticides is a concern for the environmental impact. The development of resistant varieties for the elimination of nematode in some crops, the establishment of safe and sustainable biological control methods, the understanding of the interaction between nematode and plant, and the development of resistant varieties for nematode include urgent matters. This study is aimed at exploring the relationship between host and host interaction. We will first study the relationship between infection and genetic diversity, and then we will discuss the relationship between infection and genetic diversity. This domain's "Hi-Fi" platform is open to the public, and the PacBio Hi-Fi platform is open to the public. The results of this study were about 150Mb in the joint field and 80Mb in the joint field. This is the first time that we've seen a woman's body. In 2022, the function analysis of the pathogen was carried out in the direction of SP (Sweet Potato). Ohtani (1996) refers to the method used in the identification of 5 varieties, quality change of suitable varieties (Gao Xi No. 14 line 'Mingmen Jinshi'), material use, aseptic culture, stem cutting, stem top cutting, and induction. This is the first time I've ever seen a woman in my life.

项目成果

緑肥圃場での線虫群のふるまいを捉える試み

尝试捕捉绿肥田中线虫群体的行为

• 发表时间: 2023
• 作者: Nakamura M;†Kondo M;Suzuki A;Hirai H;Che FS. 他64名;浅水恵理香
• 通讯作者: 浅水恵理香